.... ....|1... ....|2... ....|3... ....|4... ....|5... ....|6... ....|7... ....|8... ....|9... ....|10.. ....|11.. ....|12.. ....|13.. ....|14.. ....| prot M--K--V--T--V--C--F--G--R--T--R--V--V--V--P--C--G--D--G--H--M--K--V--F--S--L--I--Q--Q--A--V--T--R--Y--R--K--A--I--A--K--D--P--N--Y--W--I--Q--V--H--R-- human_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------D--P--N--Y--W--I--Q--V--H--R-- chimp_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------D--P--N--Y--W--I--Q--V--H--R-- macaque_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------D--P--N--Y--W--I--Q--V--H--R-- human_dna ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATCCAAACTACTGGATACAGGTGCATCGC chimp_dna ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GATCCAAACTACTGGATACAGGTGCATCGC macaque_dna ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACCCAAACTACTGGATACAAGTGCATCGC hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 15.. ....|16.. ....|17.. ....|18.. ....|19.. ....|20.. ....|21.. ....|22.. ....|23.. ....|24.. ....|25.. ....|26.. ....|27.. ....|28.. ....|29.. ....| prot L--E--H--G--D--G--G--I--L--D--L--D--D--I--L--C--D--V--A--D--D--K--D--R--L--V--A--V--F--D--E--Q--D--P--H--H--G--G--D--G--T--S--A--S--S--T--G--T--Q--S-- human_prot L--E--H--G--D--G--G--I--L--D--L--D--D--I--L--C--D--V--A--D--D--K--D-----L--V--A--V--F--D--E--Q--D--P--H--H--G--G--D--G--T--S--A--S--S--T--G--T--Q--S-- chimp_prot L--E--H--G--D--G--G--I--L--D--L--D--D--I--L--C--D--V--A--D--D--K--D-----L--V--A--V--F--D--E--Q--D--P--H--H--G--G--D--G--T--S--A--S--S--T--G--T--Q--S-- macaque_prot L--E--H--G--D--G--G--I--L--D--L--D--D--I--L--C--D--V--A--D--D--K--D-----L--V--A--V--F--D--E--Q--D--P--H--H--G--G--D--G--T--S--A--S--S--T--G--T--Q--S-- human_dna TTGGAACATGGAGATGGAGGAATACTAGACCTTGATGACATTCTTTGTGATGTAGCAGACGATAAAGAC---CTGGTAGCAGTGTTTGATGAGCAGGATCCACATCACGGAGGTGATGGCACCAGTGCCAGTTCCACGGGTACCCAGAGC chimp_dna TTGGAACATGGAGATGGAGGAATACTAGACCTTGATGACATTCTTTGTGATGTAGCAGACGATAAAGAC---CTGGTAGCAGTGTTTGATGAGCAGGATCCACATCACGGAGGTGATGGCACCAGTGCCAGTTCCACGGGTACCCAGAGC macaque_dna TTGGAACATGGAGATGGAGGAATACTAGACCTTGATGACATTCTCTGTGATGTAGCAGACGATAAAGAC---CTGGTAGCAGTGTTTGATGAGCAGGATCCACATCATGGAGGTGATGGCACCAGTGCCAGTTCAACGGGTACCCAGAGC hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 30.. ....|31.. ....|32.. ....|33.. ....|34.. ....|35.. ....|36.. ....|37.. ....|38.. ....|39.. ....|40.. ....|41.. ....|42.. ....|43.. ....|44.. ....| prot P--E--I--F--G--S--E--L--G--T--N--N--V--S--A--F--Q--P--Y--Q--A--T--S--E--I--E--V--T--P--S--V--L--R--A--N--M--P--L--H--V--R--R--S--S--D--P--A--L--I--G-- human_prot P--E--I--F--G--S--E--L--G--T--N--N--V--S--A--F--Q--P--Y--Q--A--T--S--E--I--E--V--T--P--S--V--L--R--------M--P--L--H--V--R--R--S--S--D--P--A--L--I--G-- chimp_prot P--E--I--F--G--S--E--L--G--T--N--N--V--S--A--F--Q--P--Y--Q--A--T--S--E--I--E--V--T--P--S--V--L--R--------M--P--L--H--V--R--R--S--S--D--P--A--L--I--G-- macaque_prot P--E--I--F--G--S--E--L--G--T--N--S--V--S--A--F--H--P--Y--Q--A--T--S--E--I--E--V--T--P--S--V--L--R--------M--P--L--H--V--R--R--S--S--D--P--A--L--I--G-- human_dna CCAGAGATATTTGGTAGTGAGCTTGGCACCAACAATGTCTCAGCCTTTCAGCCTTACCAAGCAACAAGTGAAATTGAGGTCACACCTTCAGTCCTTCGA------ATGCCTCTTCATGTTCGACGCAGTAGTGACCCAGCTCTAATTGGC chimp_dna CCAGAGATATTTGGTAGTGAGCTTGGCACCAACAATGTCTCAGCCTTTCAGCCTTACCAAGCAACAAGTGAAATTGAGGTCACACCTTCAGTCCTTCGA------ATGCCTCTTCATGTTCGACGCAGTAGTGACCCAGCTCTAATTGGC macaque_dna CCAGAGATATTTGGTAGTGAGCTTGGCACCAACAGTGTCTCAGCCTTTCATCCTTACCAAGCAACAAGTGAAATTGAGGTCACACCTTCAGTCCTTCGA------ATGCCTCTTCATGTTCGACGCAGTAGTGACCCAGCTCTAATTGGC hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ (C) 45.. ....|46.. ....|47.. ....|48.. ....|49.. ....|50.. ....|51.. ....|52.. ....|53.. ....|54.. ....|55.. ....|56.. ....|57.. ....|58.. ....|59.. ....| prot L--S--T--S--V--S--D--S--N--F--S--S--E--E--P--S--R--K--N--P--T--R--W--S--T--T--A--G--F--L--K--Q--N--T--A--G--S--P--K--T--C--D--R--K--K--D--E--N--Y--R-- human_prot L--S--T--S--V--S--D--S--N--F--S--S--E--E--P--S--R--K--N--P--T--R--W--S--T--T--A--G--F--L--K--Q--N--T--A--G--S--P--K--T--C--D--R-----K--D--E--N--Y--R-- chimp_prot L--S--T--S--V--S--D--S--N--F--S--S--E--E--P--S--R--K--N--P--T--R--W--S--T--T--A--G--F--L--K--Q--N--T--A--G--S--P--K--T--C--D--R-----K--D--E--N--Y--R-- macaque_prot I--S--T--S--V--S--D--H--N--F--S--S--E--E--P--S--R--K--N--P--T--R--W--S--T--T--A--G--F--L--K--Q--N--T--A--G--S--P--K--T--C--D--R-----K--D--E--N--Y--R-- human_dna CTCTCCACTTCTGTCAGTGATAGTAATTTTTCCTCTGAAGAGCCTTCAAGGAAAAATCCCACACGCTGGTCAACAACAGCTGGCTTCCTCAAGCAGAACACTGCTGGGAGTCCTAAAACCTGCGACAGG---AAAGATGAAAACTACAGA chimp_dna CTCTCCACTTCTGTCAGTGATAGTAATTTTTCCTCGGAAGAGCCTTCAAGGAAAAATCCCACACGCTGGTCAACAACAGCTGGCTTCCTCAAGCAGAACACTGCTGGGAGTCCTAAAACCTGCGACAGG---AAAGATGAAAACTACAGA macaque_dna ATCTCCACTTCTGTCAGTGATCATAATTTTTCCTCTGAAGAGCCTTCAAGGAAAAATCCCACACGCTGGTCAACAACAGCTGGCTTCCTAAAGCAGAACACTGCTGGGAGTCCTAAAACCTGCGACAGG---AAAGATGAAAACTACAGA hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 60.. ....|61.. ....|62.. ....|63.. ....|64.. ....|65.. ....|66.. ....|67.. ....|68.. ....|69.. ....|70.. ....|71.. ....|72.. ....|73.. ....|74.. ....| prot S--L--P--R--D--T--S--N--W--S--N--Q--F--Q--R--D--N--A--R--S--S--L--S--A--S--H--P--M--V--G--K--W--L--E--K--Q--E--Q--D--E--D--G--T--E--E--D--N--S--R--V-- human_prot S--L--P--R--D--T--S--N--W--S--N--Q--F--Q--R--D--N--A--R--S--S--L--S--A--S--H--P--M--V--G--K--W--L--E--K--Q--E-----D--E--D--G--T--E--E--D--N--S--R--V-- chimp_prot S--L--P--R--D--T--S--N--W--S--N--Q--F--Q--R--D--N--A--R--S--S--L--S--A--S--H--P--M--V--G--K--W--L--E--K--Q--E-----D--E--D--G--T--E--E--D--N--S--R--V-- macaque_prot S--L--P--R--D--T--S--N--W--S--N--Q--F--Q--R--D--N--A--R--S--S--L--S--A--S--H--P--M--V--G--K--W--L--E--K--Q--E-----D--E--D--G--T--E--E--D--N--S--R--V-- human_dna AGCCTCCCGCGGGATACTAGTAACTGGTCTAACCAATTTCAGAGAGACAATGCTCGCTCGTCTCTGAGTGCCAGTCACCCAATGGTGGGCAAGTGGCTGGAGAAACAAGAA---GATGAGGATGGGACAGAAGAGGATAACAGTCGTGTT chimp_dna AGCCTCCCGCGGGATACTAGTAACTGGTCTAACCAATTTCAGAGAGACAATGCTCGCTCGTCTCTGAGTGCCAGTCACCCAATGGTGGGCAAGTGGCTGGAGAAACAAGAA---GATGAGGATGGGACAGAAGAGGATAACAGTCGTGTT macaque_dna AGCCTCCCACGGGATACTAGTAACTGGTCTAACCAATTTCAGAGAGACAATGCTCGCTCGTCTCTGAGTGCCAGTCACCCAATGGTGGGCAAGTGGCTGGAGAAACAAGAA---GATGAGGATGGGACAGAAGAGGATAACAGTCGTGTT hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ (H) 75.. ....|76.. ....|77.. ....|78.. ....|79.. ....|80.. ....|81.. ....|82.. ....|83.. ....|84.. ....|85.. ....|86.. ....|87.. ....|88.. ....|89.. ....| prot E--P--V--G--H--A--D--T--G--L--E--H--I--P--N--F--S--L--D--D--M--V--K--L--V--E--V--P--N--D--G--G--P--L--G--I--H--V--V--P--F--S--A--R--G--G--R--T--L--G-- human_prot E--P--V--G--H--A--D--T--G--L--E--H--I--P--N--F--S--------D--M--V--K--L--V--E--V--P--N--D--G--G--P--L--G--I--H--V--V--P--F--S--A--R--G-----R--T--L--G-- chimp_prot E--P--V--G--H--A--D--T--G--L--E--H--I--P--N--F--S--------D--M--V--K--L--V--E--V--P--N--D--G--G--P--L--G--I--H--V--V--P--F--S--A--R--G-----R--T--L--G-- macaque_prot E--P--V--G--H--A--D--T--G--L--E--N--I--P--N--F--S--------D--M--V--K--L--V--E--V--P--N--D--G--G--P--L--G--I--H--V--V--P--F--S--A--R--G-----R--T--L--G-- human_dna GAACCTGTTGGACATGCTGACACGGGTTTGGAGCATATACCCAACTTTTCT------GATATGGTAAAGCTCGTAGAAGTCCCCAACGATGGAGGGCCTCTGGGAATCCACGTAGTGCCTTTCAGTGCTCGAGGC---AGAACCCTGGGG chimp_dna GAACCTGTTGGACATGCTGACACGGGTTTGGAGCATATACCCAACTTTTCT------GATATGGTAAAGCTCGTAGAAGTCCCCAACGATGGAGGGCCTCTGGGAATCCATGTAGTGCCTTTCAGTGCTCGAGGC---AGAACCCTGGGG macaque_dna GAACCTGTTGGACATGCTGACACGGGTTTGGAGAATATACCCAACTTTTCT------GATATGGTAAAGCTCGTAGAAGTCCCCAACGATGGAGGGCCTCTGGGAATCCATGTAGTGCCTTTCAGTGCTCGAGGC---AGAACCCTGGGG hg18 -------------ATGC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- panTro2 -------------ATGC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- rheMac2 -------------ATGC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- codon_pos -------------0120------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- hg18_prot -------------M--Q------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- panTro_prot -------------M--Q------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- rheMac_prot -------------M--Q------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- H 90.. ....|91.. ....|92.. ....|93.. ....|94.. ....|95.. ....|96.. ....|97.. ....|98.. ....|99.. ....|100. ....|101. ....|102. ....|103. ....|104. ....| prot L--L--V--K--R--L--E--K--G--G--K--A--E--H--E--N--L--F--R--E--N--D--C--I--V--R--I--N--D--G--D--L--R--N--R--R--F--E--Q--A--Q--H--M--F--R--Q--A--M--R--T-- human_prot L--L--V--K--R--L--E--K--G--G--K--A--E--H--E--N--L--F--R--E--N--D--C--I--V--R--I--N--D--G--D--L--R--N--R--R--F--------A--Q--H--M--F--R--Q--A--M--R--T-- chimp_prot L--L--V--K--R--L--E--K--G--G--K--A--E--H--E--N--L--F--H--E--N--D--C--I--V--R--I--N--D--G--D--L--R--N--R--R--F--------A--Q--H--M--F--R--Q--A--M--R--T-- macaque_prot L--L--V--K--R--L--E--K--G--G--K--A--E--H--E--N--L--F--H--E--N--D--C--I--V--R--I--N--D--G--D--L--R--N--R--R--F--------A--Q--H--M--F--R--Q--A--M--R--T-- human_dna TTATTAGTAAAACGATTGGAGAAAGGTGGTAAAGCTGAACATGAAAATCTTTTTCGTGAGAATGATTGCATTGTCAGGATTAATGATGGCGACCTTCGAAATAGAAGATTT------GCACAACATATGTTTCGCCAAGCCATGCGTACA chimp_dna TTATTAGTAAAACGATTGGAGAAAGGTGGTAAAGCTGAACATGAAAATCTTTTTCATGAGAATGATTGCATTGTCAGGATTAATGATGGCGACCTTCGAAATAGAAGATTT------GCACAACATATGTTTCGCCAAGCCATGCGTACA macaque_dna TTATTAGTAAAACGATTGGAGAAAGGTGGTAAAGCTGAACATGAAAATCTTTTTCATGAGAATGATTGCATTGTCAGGATTAATGATGGCGACCTTCGAAATAGAAGATTT------GCACAACATATGTTTCGCCAAGCCATGCGTACA hg18 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------AGATT---------------------------------------- panTro2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------AGATT---------------------------------------- rheMac2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------AGATT---------------------------------------- codon_pos ---------------------------------------------------------------------------------------------------------12012---------------------------------------- hg18_prot -----------------------------------------------------------------------------------------------------------I------------------------------------------ panTro_prot -----------------------------------------------------------------------------------------------------------I------------------------------------------ rheMac_prot -----------------------------------------------------------------------------------------------------------I------------------------------------------ (C) 105. ....|106. ....|107. ....|108. ....|109. ....|110. ....|111. ....|112. ....|113. ....|114. ....|115. ....|116. ....|117. ....|118. ....|119. ....| prot P--I--I--W--F--H--V--V--P--A--A--N--K--E--Q--Y--E--Q--L--S--Q--S--E--K--N--N--Y--Y--S--S--R--F--S--P--D--S--Q--Y--I--D--N--R--S--V--N--S--A--G--L--H-- human_prot P--I--I--W--F--H--V--V--P--A--A--N--K--E--Q--Y--E--Q--L--S--Q--S--E--K--N--N--Y--Y--S--S--R--F--S--P--D--S--Q--Y--I--D--N--R--S--V--N--S--A--G--L--H-- chimp_prot P--I--I--W--F--H--V--V--P--A--A--N--K--E--Q--Y--E--Q--L--S--Q--S--E--K--N--N--Y--Y--S--S--R--F--S--P--D--S--Q--Y--I--D--N--R--S--V--N--S--A--G--L--H-- macaque_prot P--I--I--W--F--H--V--V--P--A--A--N--K--E--Q--Y--E--Q--L--S--Q--S--E--K--N--N--Y--Y--S--S--R--F--S--P--D--S--Q--Y--I--D--N--R--S--V--N--S--A--G--L--H-- human_dna CCCATCATTTGGTTCCATGTGGTTCCTGCAGCAAATAAAGAGCAGTATGAACAACTATCCCAAAGTGAGAAGAACAATTACTATTCAAGCCGTTTTAGCCCTGACAGCCAGTATATTGACAACAGGAGTGTGAACAGTGCAGGGCTTCAC chimp_dna CCCATCATTTGGTTCCATGTGGTTCCCGCAGCAAATAAAGAGCAGTATGAACAACTATCCCAAAGTGAGAAGAACAATTACTATTCAAGCCGTTTTAGCCCTGACAGCCAGTATATTGACAACAGGAGTGTGAACAGTGCAGGGCTTCAC macaque_dna CCCATCATTTGGTTCCATGTGGTTCCTGCAGCAAATAAAGAACAGTATGAACAACTATCTCAAAGTGAGAAGAACAATTACTATTCAAGCCGTTTTAGCCCTGACAGCCAGTATATTGACAACAGGAGTGTGAACAGTGCAGGGCTTCAC hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 120. ....|121. ....|122. ....|123. ....|124. ....|125. ....|126. ....|127. ....|128. ....|129. ....|130. ....|131. ....|132. ....|133. ....|134. ....| prot T--V--Q--R--A--P--R--L--N--H--P--P--E--Q--I--D--S--H--S--R--L--P--H--S--A--H--P--S--G--K--P--P--S--A--P--A--S--A--P--Q--N--V--F--S--T--T--V--S--S--G-- human_prot T--V--Q--R--A--P--R--L--N--H--P--P--E--Q--I--D--S--H--S--R--L--P--H--S--A--H--P--S--G--K--P--P--S--A--P--A--S--A--P--Q--N--V--F--S--T--T--V--S--S--G-- chimp_prot T--V--Q--R--A--P--R--L--N--H--P--P--E--Q--I--D--S--H--S--R--L--P--H--S--A--H--P--S--G--K--P--P--S--A--P--A--S--A--P--Q--N--V--F--S--T--T--V--S--S--G-- macaque_prot T--V--Q--R--A--P--R--L--N--H--P--P--E--Q--I--D--S--H--S--R--L--P--H--S--A--H--P--S--G--K--P--P--S--A--P--A--S--A--P--Q--N--V--F--S--A--T--V--S--S--G-- human_dna ACGGTGCAGAGAGCACCCCGACTGAACCACCCGCCTGAGCAGATAGACTCTCACTCAAGACTACCTCATAGCGCACACCCCTCGGGAAAACCACCATCCGCTCCAGCCTCGGCACCTCAGAATGTATTTAGTACGACTGTAAGCAGTGGT chimp_dna ACGGTGCAGAGAGCACCCCGACTGAACCACCCGCCTGAGCAGATAGACTCTCACTCAAGACTACCTCATAGCGCACACCCCTCGGGAAAACCACCATCCGCTCCAGCCTCGGCACCTCAGAATGTATTTAGTACGACTGTAAGCAGTGGT macaque_dna ACGGTGCAGAGAGCACCCCGACTGAACCACCCGCCTGAGCAGATAGACTCTCACTCACGACTACCTCATAGCGCACACCCCTCGGGAAAACCACCATCCGCTCCAGCCTCGGCACCTCAGAATGTATTTAGTGCGACTGTAAGCAGTGGT hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 135. ....|136. ....|137. ....|138. ....|139. ....|140. ....|141. ....|142. ....|143. ....|144. ....|145. ....|146. ....|147. ....|148. ....|149. ....| prot Y--N--T--K--K--I--G--K--R--L--N--I--Q--L--K--K--G--T--E--G--L--G--F--S--I--T--S--R--D--V--T--I--G--G--S--A--P--I--Y--V--K--N--I--L--P--R--G--A--A--I-- human_prot Y--N--T--K--K--I--G--K--R--L--N--I--Q--L--K-----G--T--E--G--L--G--F--S--I--T--S--R--D--V--T--I--G--G--S--A--P--I--Y--V--K--N--I--L--P--R--G--A--A--I-- chimp_prot Y--N--T--K--K--I--G--K--R--L--N--I--Q--L--K-----G--T--E--G--L--G--F--S--I--T--S--R--D--V--T--I--G--G--S--A--P--I--Y--V--K--N--I--L--P--R--G--A--A--I-- macaque_prot Y--N--T--K--K--I--G--K--R--L--N--I--Q--L--K-----G--T--E--G--L--G--F--S--I--T--S--R--D--V--T--I--G--G--S--A--P--I--Y--V--K--N--I--L--P--R--G--A--A--I-- human_dna TATAACACCAAAAAAATAGGCAAGAGGCTTAATATCCAGCTTAAG---GGTACAGAAGGTTTGGGATTCAGCATCACTTCCAGAGATGTAACAATAGGTGGCTCAGCTCCAATCTATGTGAAAAACATTCTCCCCCGGGGGGCGGCCATT chimp_dna TATAACACCAAAAAAATAGGCAAGAGGCTTAATATCCAGCTTAAG---GGTACAGAAGGTTTGGGATTCAGCATCACTTCCAGAGATGTAACAATAGGTGGCTCAGCTCCAATCTATGTGAAAAACATTCTCCCCCGGGGGGCGGCCATT macaque_dna TATAACACCAAAAAAATAGGCAAGAGGCTTAATATCCAGCTTAAG---GGTACAGAAGGTTTGGGATTCAGCATCACTTCCAGAGATGTAACAATAGGTGGCTCAGCTCCAATCTATGTGAAGAACATCCTCCCCCGGGGGGCGGCCATT hg18 -------CCAAAA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- panTro2 -------CCAAAA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- rheMac2 -------CCAAAA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- codon_pos -------012012----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- hg18_prot -------P--K------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- panTro_prot -------P--K------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- rheMac_prot -------P--K------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- (H) 150. ....|151. ....|152. ....|153. ....|154. ....|155. ....|156. ....|157. ....|158. ....|159. ....|160. ....|161. ....|162. ....|163. ....|164. ....| prot Q--D--G--R--L--K--A--G--D--R--L--I--E--V--N--G--V--D--L--V--G--K--S--Q--E--E--V--V--S--L--L--R--S--T--K--M--E--G--T--V--S--L--L--V--F--R--Q--E--D--A-- human_prot Q--D--G--R--L--K--A--G--D--R--L--I-----V--N--G--V--D--L--V--G--K--S--Q--E--E--V--V--S--L--L--R--S--T--K--M--E--G--T--V--S--L--L--V--F--R--Q--E--D--A-- chimp_prot Q--D--G--R--L--K--A--G--D--R--L--I-----V--N--G--V--D--L--V--G--K--S--Q--E--E--V--V--S--L--L--R--S--T--K--M--E--G--T--V--S--L--L--V--F--R--Q--E--D--A-- macaque_prot Q--D--G--R--L--K--A--G--D--R--L--I-----V--N--G--V--D--L--A--G--K--S--Q--E--E--V--V--S--L--L--R--S--T--K--M--E--G--T--V--S--L--L--V--F--R--Q--E--D--A-- human_dna CAGGATGGCCGACTTAAGGCAGGAGACAGACTTATA---GTAAATGGAGTAGATTTAGTGGGCAAATCCCAAGAGGAAGTTGTTTCGCTGTTGAGAAGCACCAAGATGGAAGGAACTGTGAGCCTTCTGGTCTTTCGCCAGGAAGACGCC chimp_dna CAGGATGGCCGACTTAAGGCAGGAGACAGACTTATA---GTAAATGGAGTAGATTTAGTGGGCAAATCCCAAGAGGAAGTTGTTTCCCTGTTGAGAAGCACCAAGATGGAAGGAACTGTGAGCCTTCTGGTCTTTCGCCAGGAAGACGCC macaque_dna CAGGATGGCCGACTTAAGGCAGGAGACAGACTTATA---GTAAATGGAGTAGATTTAGCAGGCAAATCCCAAGAGGAAGTTGTTTCCCTGTTGAGAAGCACCAAGATGGAAGGAACTGTGAGCCTTCTGGTCTTTCGCCAGGAAGACGCC hg18 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAA-ACG-- panTro2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAA-ACG-- rheMac2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GAA-ACG-- codon_pos ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------012-012-- hg18_prot 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F--H--P--R--E-----N--A--E--P--S--Q--M--Q--I--P--K--E-----K--P--E--D--E--D--I--V--L--T--P--D--G--T--R--E--F--L--T--F--E--V--P--L--N--D--S--G--S--A--G-- macaque_prot F--H--P--R--E-----N--A--E--P--S--Q--M--Q--I--P--K--E-----K--A--E--D--E--D--I--V--L--T--P--D--G--T--R--E--F--L--T--F--E--V--P--L--N--D--S--G--S--A--G-- human_dna TTCCACCCAAGGGAA---AATGCAGAGCCAAGCCAGATGCAGATTCCAAAAGAA---AAAGCAGAAGATGAGGATATTGTTCTTACACCTGATGGCACCAGGGAATTTCTGACATTTGAAGTCCCACTTAATGATTCAGGATCTGCAGGC chimp_dna TTCCACCCAAGGGAA---AATGCAGAGCCAAGCCAGATGCAGATTCCAAAAGAA---AAACCCGAAGATGAGGATATTGTTCTTACACCTGATGGCACCAGGGAATTTCTGACATTTGAAGTTCCACTTAATGATTCAGGATCTGCCGGC macaque_dna TTCCACCCAAGGGAA---AATGCAGAGCCAAGCCAGATGCAGATTCCAAAAGAA---AAAGCAGAAGATGAGGATATTGTTCTCACACCTGATGGCACGAGAGAATTTCTGACGTTTGAAGTCCCACTTAATGATTCGGGATCTGCCGGC hg18 ---------------------------------------------------------AAAGCAGAAGATGAGGATATTGTTCTTACACCTGATGGCACCAGGGAATTTCTGACATTTGAAGTCCCACTTAATGATTCAGGATCTGCAGGC panTro2 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CTTGGTGTCAGTGTCAAAGGTAACCGGTCAAAAGAGAACCATGCAGATTTGGGAATCTTTGTCAAGTCCATTATTAATGGAGGAGCAGCATCT------GATGGAAGGCTTCGGGTGAATGATCAACTGATAGCAGTAAATGGAGAATCC macaque_dna CTTGGTGTCAGTGTCAAAGGTAACCGGTCAAAAGAGAACCACGCAGATTTGGGAATCTTTGTCAAGTCCATTATTAATGGAGGAGCAGCATCT------GATGGAAGGCTTCGGGTGAATGATCAACTGATAGCAGTAAATGGAGAATCC hg18 CTTGGTGTCAGTGTCAAAGGTAACCGGTCAAAAGAGAACCACGCAGATTTGGGAATCTTTGTCAAGTCCATTATTAATGGAGGAGCAGCATCTAAA---GATGGAAGGCTTCGGGTGAATGATCAACTGATAGCAGTAAATGGAGAATCC panTro2 CTTGGTGTCAGTGTCAAAGGTAACCGGTCAAAAGAGAACCATGCAGATTTGGGAATCTTTGTCAAGTCCATTATTAATGGAGGAGCAGCATCTAAA---GATGGAAGGCTTCGGGTGAATGATCAACTGATAGCAGTAAATGGAGAATCC rheMac2 CTTGGTGTCAGTGTCAAAGGTAACCGGTCAAAAGAGAACCACGCAGATTTGGGAATCTTTGTCAAGTCCATTATTAATGGAGGAGCAGCATCTAAA---GATGGAAGGCTTCGGGTGAATGATCAACTGATAGCAGTAAATGGAGAATCC codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot L--G--V--S--V--K--G--N--R--S--K--E--N--H--A--D--L--G--I--F--V--K--S--I--I--N--G--G--A--A--S--K-----D--G--R--L--R--V--N--D--Q--L--I--A--V--N--G--E--S-- panTro_prot L--G--V--S--V--K--G--N--R--S--K--E--N--H--A--D--L--G--I--F--V--K--S--I--I--N--G--G--A--A--S--K-----D--G--R--L--R--V--N--D--Q--L--I--A--V--N--G--E--S-- rheMac_prot L--G--V--S--V--K--G--N--R--S--K--E--N--H--A--D--L--G--I--F--V--K--S--I--I--N--G--G--A--A--S--K-----D--G--R--L--R--V--N--D--Q--L--I--A--V--N--G--E--S-- 195. ....|196. ....|197. ....|198. ....|199. ....|200. ....|201. ....|202. ....|203. ....|204. ....|205. ....|206. ....|207. ....|208. ....|209. ....| prot L--L--G--K--T--N--Q--D--A--M--E--T--L--R--R--S--M--S--T--E--G--N--K--R--G--M--I--Q--L--I--V--A--R--R--I--S--K--C--N--E-----L--K--S--P--G--S--P--P--G-- human_prot L--L--G--K--T--N--Q--D--A--M--E--T--L--R--R--S--M--S--T--E--G--N--K--R--G--M--I--Q--L--I--V--A--R--R--I--S--K--C--N--------L--K--S--P--G--S--P--P--G-- chimp_prot L--L--G--K--T--N--Q--D--A--M--E--T--L--R--R--S--M--S--T--E--G--N--K--R--G--M--I--Q--L--I--V--A--R--R--I--S--K--C--N--------L--K--S--P--G--S--P--P--G-- macaque_prot L--L--G--K--T--N--Q--D--A--M--E--T--L--R--R--S--M--S--T--E--G--N--K--R--G--M--I--Q--L--I--V--A--R--R--I--S--K--C--S--------L--K--S--P--G--S--P--P--G-- human_dna CTGTTGGGCAAGACAAACCAAGATGCCATGGAAACCCTAAGAAGGTCTATGTCTACTGAAGGCAATAAACGAGGAATGATCCAGCTTATTGTTGCAAGGAGAATAAGCAAGTGCAAT------CTGAAGTCACCTGGGAGCCCCCCTGGA chimp_dna CTGTTGGGCAAGACAAACCAAGATGCCATGGAAACCCTAAGAAGGTCTATGTCTACTGAAGGCAATAAACGAGGAATGATCCAGCTTATTGTTGCAAGGAGAATAAGCAAGTGCAAT------CTGAAGTCACCTGGGAGCCCCCCTGGA macaque_dna CTGTTGGGCAAGACAAACCAAGATGCCATGGAAACCCTAAGAAGGTCTATGTCTACTGAAGGCAATAAACGAGGAATGATCCAGCTTATTGTTGCAAGGAGAATAAGCAAGTGCAGT------CTAAAGTCACCTGGGAGCCCCCCTGGA hg18 CTGTTGGGCAAGACAAACCAAGATGCCATGGAAACCCTAAGAAGGTCTATGTCTACTGAAGGCAATAAACGAGGAATGATCCAGCTTATTGTTGCAAGGAGAATAAGCAAGTGCAATGAG---CTGAAGTCACCTGGGAGCCCCCCTGGA panTro2 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....|214. ....|215. ....|216. ....|217. ....|218. ....|219. ....|220. ....|221. ....|222. ....|223. ....|224. ....| prot P--E--L--P--I--E--T--A--L--D--D--R--E--R--R--I--S--H--S--L--Y--S--G--I--E--G--L--D--E--S--P--S--R--N--A--A--L--S--R--I--M--G--E--S--G--K--Y--Q--L--S-- human_prot P--E--L--P--I--E--T--A--L--D--D--R--E--R--R--I--S--H--S--L--Y--S--G--I--E--G--L--D--E--S--P--S--R--N--A--A--L--S--R--I--M--G--E-----G--K--Y--Q--L--S-- chimp_prot P--E--L--P--I--E--T--A--L--D--D--R--E--R--R--I--S--H--S--L--Y--S--G--I--E--G--L--D--E--S--P--S--R--N--A--A--L--S--R--I--M--G--E-----G--K--Y--Q--L--S-- macaque_prot P--E--L--P--V--E--T--A--L--D--D--R--E--R--R--I--S--H--S--L--Y--S--G--I--E--G--L--D--E--S--P--S--R--N--A--A--L--S--R--I--M--G--E-----G--K--Y--Q--L--S-- human_dna CCTGAGCTGCCCATTGAAACAGCGTTGGATGATAGAGAACGAAGAATTTCCCATTCCCTCTACAGTGGGATTGAGGGGCTTGATGAATCGCCCAGCAGAAATGCTGCCCTCAGTAGGATAATGGGTGAG---GGTAAATACCAGCTGTCC chimp_dna 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P--E--L--P--I--E--T--A--L--D--D--R--E--R--R--I--S--H--S--L--Y--S--G--I--E--G--L--D--E--S--P--S--R--N--A--A--L--S--R--I--M--G-------------------------- panTro_prot P--E--L--P--I--E--T--A--L--D--D--R--E--R--R--I--S--H--S--L--Y--S--G--I--E--G--L--D--E--S--P--S--R--N--A--A--L--S--R--I--M--G-------------------------- rheMac_prot P--E--L--P--V--E--T--A--L--D--D--R--E--R--R--I--S--H--S--L--Y--S--G--I--E--G--L--D--E--S--P--S--R--N--A--A--L--S--R--I--M--G-------------------------- 225. ....|226. ....|227. ....|228. ....|229. ....|230. ....|231. ....|232. ....|233. ....|234. ....|235. ....|236. ....|237. ....|238. ....|239. ....| prot P--T--V--N--M--P--Q--D--D--T--V--I--I--E--D--D--R--L--P--V--L--P--P--H--L--S--D--Q--S--S--S--S--S--H--D--D--V--G--F--V--T--A--D--A--G--T--W--A--K--A-- human_prot P--T--V--N--M--P--Q--D--D--T--V--I--I--E--D--D--R--L--P--V--L--P--P--H--L--S--D--Q--S--S--S--S--S--H--D--D--V--G--F--V--T--A--D--A--G--T--W--A--K--A-- chimp_prot P--T--V--N--M--P--Q--D--D--T--V--I--I--E--D--D--R--L--P--V--L--P--P--H--L--S--D--Q--S--S--S--S--S--H--D--D--V--G--F--V--T--A--D--A--G--T--W--A--K--A-- macaque_prot P--T--V--N--M--P--Q--D--D--T--V--I--I--E--D--D--R--L--P--V--L--P--P--H--L--S--D--Q--S--S--S--S--S--H--D--D--V--G--F--V--T--A--D--A--G--T--W--A--K--A-- human_dna CCTACAGTGAATATGCCCCAAGATGACACTGTCATTATAGAAGATGACAGGTTGCCAGTGCTTCCTCCACATCTCTCTGACCAGTCCTCTTCCAGCTCCCATGATGATGTGGGGTTTGTGACGGCAGATGCTGGTACTTGGGCCAAGGCT chimp_dna CCTACAGTGAATATGCCCCAAGATGACACTGTCATTATAGAAGATGACAGGTTGCCAGTGCTTCCTCCACATCTCTCTGACCAGTCCTCTTCCAGCTCCCATGATGATGTGGGGTTTGTGACGGCAGATGCTGGTACTTGGGCCAAGGCT macaque_dna CCTACAGTGAATATGCCCCAAGATGACACTGTCATTATAGAAGATGACAGGTTGCCAGTGCTTCCTCCACATCTCTCTGACCAGTCCTCTTCCAGCTCGCATGATGATGTGGGGTTCGTGACGGCAGATGCTGGTACTTGGGCCAAGGCT hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 240. ....|241. ....|242. ....|243. 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------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T----- panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T----- rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T----- C C (H)(H) 255. ....|256. ....|257. ....|258. ....|259. ....|260. ....|261. ....|262. ....|263. ....|264. ....|265. ....|266. ....|267. ....|268. ....|269. ....| prot K--S--K--S--M--D--L--G--I--A--D--E--T--K--L--N--T--V--D--D--Q--K--A--G--S--P--S--R--D--V--G--P--S--L--G--L--K--K--S--S--S--L--E--S--L--Q--T--A--V--A-- human_prot K--S--K--S--M--D--L--------A--D--E--T--K--L--N--T--V--D--D--Q--K-----G--S--P--S--R--D--V--G--P--S--L--G--L--K--K--S--S--S--L--E--S--L--Q--T--A--V--A-- chimp_prot K--S--K--S--M--D--L--------A--D--E--T--K--L--S--T--V--D--D--P--K-----G--S--P--S--R--D--V--G--P--S--L--G--L--K--K--S--S--S--L--E--S--L--Q--T--A--V--A-- macaque_prot K--S--K--S--M--D--L--------A--D--E--T--K--L--N--T--V--D--D--Q--K-----G--S--P--S--R--D--V--G--P--S--L--G--L--K--K--S--S--S--L--E--S--L--Q--T--A--V--A-- human_dna AAATCAAAAAGCATGGATTTA------GCTGACGAGACTAAACTCAATACAGTGGATGACCAGAAA---GGTTCTCCCAGCAGAGATGTGGGTCCTTCCCTGGGTCTGAAGAAGTCAAGCTCGTTGGAGAGTCTGCAGACCGCAGTTGCC chimp_dna AAATCAAAAAGCATGGATTTA------GCTGACGAGACTAAACTCAGTACAGTGGATGACCCGAAA---GGTTCTCCCAGCAGAGATGTGGGTCCTTCCCTGGGTCTGAAGAAGTCAAGCTCATTAGAGAGTCTGCAGACCGCAGTTGCC macaque_dna AAATCAAAAAGCATGGATTTA------GCTGACGAGACTAAACTCAATACAGTGGATGACCAGAAA---GGTTCTCCCAGCAGAGATGTGGGTCCTTCCCTGGGTCTGAAAAAGTCAAGCTCATTAGAGAGTCTGCAGACCGCAGTTGCC hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 270. ....|271. ....|272. ....|273. ....|274. ....|275. ....|276. ....|277. ....|278. ....|279. ....|280. ....|281. ....|282. ....|283. ....|284. ....| prot E--V--T--L--N--G--D--I--P--F--H--R--P--R--P--R--I--I--R--G--R--G--C--N--E--S--F--R--A--A--I--D--K--S--Y--D--K--P--A--V--D--D--D--D--E--G--M--E--T--L-- human_prot E--V--T--L--N--G--D--I--P--F--H--R--P--R--P--R--I--I--R--G--R--G--C--N--E--S--F--R--A--A--I--D--K--S--Y--D--K--P--A--V--D--D--D--D--E--G--M--E-------- chimp_prot E--V--T--L--N--G--D--I--P--F--H--R--P--R--P--R--I--I--R--G--R--G--C--N--E--S--F--R--A--A--I--D--K--S--Y--D--K--P--A--V--D--D--D--D--E--G--M--E-------- macaque_prot E--V--T--L--N--G--D--I--P--F--H--R--P--R--P--R--I--I--R--G--R--G--C--N--E--S--F--R--A--A--I--D--K--S--Y--D--K--P--V--V--D--D--D--D--E--G--M--E-------- human_dna GAGGTGACTTTGAATGGGGATATTCCTTTCCATCGTCCACGGCCGCGGATAATCAGAGGCAGGGGATGCAATGAGAGCTTCAGAGCTGCCATCGACAAATCTTATGATAAACCCGCGGTAGATGATGATGATGAAGGCATGGAG------ chimp_dna GAGGTGACTTTGAATGGGGATATTCCTTTCCATCGTCCACGGCCGCGGATAATCAGAGGCAGGGGATGCAATGAGAGCTTCAGAGCTGCCATCGACAAATCTTATGATAAACCCGCGGTAGATGATGATGATGAAGGCATGGAG------ macaque_dna GAGGTGACTTTGAATGGGGATATTCCTTTCCATCGCCCACGGCCACGGATAATCAGAGGCAGGGGATGCAATGAGAGCTTCAGAGCTGCCATCGACAAATCTTATGATAAACCCGTGGTAGATGATGATGATGAAGGCATGGAG------ hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 285. ....|286. ....|287. ....|288. ....|289. ....|290. ....|291. ....|292. ....|293. ....|294. ....|295. ....|296. ....|297. ....|298. ....|299. ....| prot E--E--D--T--E--E--S--S--R--S--G--R--E--S--V--S--T--A--S--D--Q--P--S--H--S--L--E--R--Q--M--N--G--N--Q--E--K--G--D--K--T--D--R--K--K--D--K--T--G--K--E-- human_prot E--E--D--T--E--E--S--S--R--S--G--R--E--S--V--S--T--A--S--D--Q--P--S--H--S--L--E--R--Q--M--N--G--N----------------------------------------------------- chimp_prot E--E--D--T--E--E--S--S--R--S--G--R--E--S--V--S--T--A--S--D--Q--P--S--H--S--L--E--R--Q--M--N--G--N----------------------------------------------------- macaque_prot E--E--D--T--E--E--S--S--R--S--G--R--E--S--V--S--T--A--S--D--Q--P--S--H--S--L--E--R--Q--M--N--G--N----------------------------------------------------- human_dna GAAGAAGACACAGAAGAAAGTTCAAGATCAGGGAGAGAGTCTGTATCCACAGCCAGTGATCAGCCTTCCCACTCTCTGGAGAGACAAATGAATGGAAAC--------------------------------------------------- chimp_dna GAAGAAGACACAGAAGAAAGTTCAAGATCAGGGAGAGAGTCTGTATCCACAGCCAGTGATCAGCCTTCCCACTCTCTGGAGAGACAAATGAATGGAAAC--------------------------------------------------- macaque_dna GAAGAAGACACAGAAGAAAGTTCAAGATCAGGGAGAGAGTCTGTATCCACAGCCAGTGATCAGCCTTCCCACTCTCTGGAGAGACAAATGAATGGAAAC--------------------------------------------------- hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 300. ....|301. ....|302. ....|303. ....|304. ....|305. ....|306. ....|307. ....|308. ....|309. ....|310. ....|311. ....|312. ....|313. ....|314. ....| prot K--K--K--D--R--D--K--E--K--D--K--M--K--A--K--K--G--M--L--K--G--L--G--D--M--F--R--F--G--K--H--R--K--D--D--K--I--E--K--T--G--K--I--K--I--Q--E--S--F--T-- human_prot ------------------------------------------------------L--K--G--L--G--D--M-----R--F--G--K--H--R--K--D--D--K--I--E--K--T--G--K--I--K--I--Q--E--S--F--T-- chimp_prot ------------------------------------------------------L--K--G--L--G--D--M-----R--F--G--K--H--R--K--D--D--K--I--E--K--T--G--K--I--K--I--Q--E--S--F--T-- macaque_prot ------------------------------------------------------L--K--G--L--G--D--M-----R--F--G--K--H--R--K--D--D--K--I--E--K--T--G--K--I--K--I--Q--E--S--F--T-- human_dna ------------------------------------------------------CTGAAGGGCTTGGGAGACATG---AGGTTTGGCAAACATCGAAAAGATGACAAGATTGAGAAAACGGGTAAAATAAAAATACAGGAATCCTTTACA chimp_dna ------------------------------------------------------CTGAAGGGCTTGGGAGACATG---AGGTTTGGCAAACATCGAAAAGATGACAAGATTGAGAAAACGGGTAAAATAAAAATACAGGAATCCTTTACA macaque_dna ------------------------------------------------------CTGAAGGGCTTGGGAGACATG---AGGTTTGGCAAACATCGAAAAGATGACAAGATTGAGAAAACGGGTAAAATAAAAATACAGGAATCCTTTACG hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ (H) 315. ....|316. ....|317. ....|318. ....|319. ....|320. ....|321. ....|322. ....|323. ....|324. ....|325. ....|326. ....|327. ....|328. ....|329. ....| prot S--E--E--E--R--I--R--M--K--Q--E--Q--E--R--I--Q--A--K--T--R--E--F--R--E--R--Q--A--R--E--R--D--Y--A--E--I--Q--D--F--H--R--T--F--G--C--D--D--E--L--M--Y-- human_prot S--E--E--E--R--I--R--M--K--Q--E--Q-----R--I--Q--A--K--T--R--E--F--R--E--R--Q--A--R--E--R--D--Y--A--E--I--Q--D--F--H--R--T--F--G--C--D--D--E--L--M--Y-- chimp_prot S--E--E--E--R--I--R--M--K--Q--E--Q-----R--I--Q--A--K--T--R--E--F--R--E--R--Q--A--R--E--R--D--Y--A--E--I--Q--D--F--H--R--T--F--G--C--D--D--E--L--M--Y-- macaque_prot S--E--E--E--R--M--R--M--K--Q--E--Q-----R--I--Q--A--K--T--R--E--F--R--E--R--Q--A--R--E--R--D--Y--A--E--I--Q--D--F--H--R--T--F--G--C--D--D--E--L--M--Y-- human_dna TCAGAAGAGGAGAGGATACGAATGAAGCAGGAGCAG---AGGATTCAAGCCAAAACTCGAGAATTTAGGGAACGACAAGCTCGAGAGCGTGACTATGCTGAAATTCAAGATTTTCATCGGACATTTGGCTGTGATGATGAGTTAATGTAT chimp_dna TCAGAAGAGGAGAGGATACGAATGAAGCAGGAGCAG---AGGATTCAAGCCAAAACTCGAGAATTTAGGGAACGACAAGCTCGAGAGCGTGACTATGCTGAAATTCAAGATTTTCATCGGACATTTGGCTGTGATGATGAGTTGATGTAT macaque_dna TCAGAAGAGGAGAGGATGCGAATGAAGCAGGAACAG---AGGATTCAAGCCAAAACTCGAGAATTTAGGGAACGACAAGCTCGAGAGCGTGACTATGCTGAAATCCAAGATTTTCATCGGACGTTTGGCTGTGATGATGAATTGATGTAT hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ (C) 330. ....|331. ....|332. ....|333. ....|334. ....|335. ....|336. ....|337. ....|338. ....|339. ....|340. ....|341. ....|342. ....|343. ....|344. ....| prot G--G--V--S--S--Y--E--G--S--M--A--L--N--A--R--P--Q--S--P--R--E--G--H--M--M--D--A--L--Y--A--Q--V--K--K--P--R--N--S--K--P--S--P--V--D--S--N--R--S--T--P-- human_prot G--G--V--S--S--Y--E--G--S--M--A--L--N--A--R--P--Q--S--P--R--E--G--H--M--M--D--A--L--Y--A--Q--V--K--K--P--R--N--S--K--P--S--P--V-----S--N--R--S--T--P-- chimp_prot G--G--V--S--S--Y--E--G--S--M--A--L--N--A--R--P--Q--S--P--R--E--G--H--M--M--D--A--L--Y--A--Q--V--K--K--P--R--N--S--K--P--S--P--V-----S--N--R--S--T--P-- macaque_prot G--G--V--S--S--Y--E--G--S--M--A--L--N--A--R--P--Q--S--P--R--E--G--H--M--M--D--A--L--Y--A--Q--V--K--K--P--R--N--S--K--P--S--P--V-----S--N--R--S--T--P-- human_dna GGGGGAGTTTCTTCTTATGAAGGTTCCATGGCTCTCAACGCTAGACCTCAGAGCCCACGAGAAGGGCATATGATGGATGCTTTGTATGCCCAAGTCAAGAAGCCGCGGAATTCCAAACCCTCACCTGTA---AGTAACAGATCAACTCCT chimp_dna GGGGGAGTTTCTTCTTATGAAGGTTCCATGGCTCTCAACGCTAGACCTCAGAGCCCACGAGAAGGGCATATGATGGATGCTTTGTATGCCCAAGTCAAGAAGCCGCGGAATTCCAAACCCTCACCTGTG---AGTAACAGATCAACTCCT macaque_dna GGGGGAGTTTCTTCTTATGAAGGTTCCATGGCTCTCAACGCTAGACCTCAGAGCCCACGAGAAGGGCACATGATGGATGCTTTGTATGCCCAAGTCAAGAAGCCGCGGAATTCCAAACCCTCACCTGTA---AGTAACAGATCAACTCCT hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ (C) (H) 345. ....|346. ....|347. ....|348. ....|349. ....|350. ....|351. ....|352. ....|353. ....|354. ....|355. ....|356. ....|357. ....|358. ....|359. ....| prot S--N--H--D--R--I--Q--R--L--R--Q--E--F--Q--Q--A--K--Q--D--E--D--V--E--D--R--R--R--T--Y--S--F--E--Q--P--W--P--N--A--R--P--A--T--Q--S--G--R--H--S--V--S-- human_prot S--N--H--D--R--I--Q--R--L--R--Q--E--F--Q--Q--A--K--Q--D--E--D--V--E--D--R--R--R--T--Y--S--F--E--Q--P-----P--N--A--R--P--A--T--Q--S--G--R--H--S--V--S-- chimp_prot S--N--H--D--R--I--Q--R--L--R--Q--E--F--Q--Q--A--K--Q--D--E--D--V--E--D--R--R--R--T--Y--S--F--E--Q--P-----P--N--A--R-----A--T--Q--S--G--R--H--S--V--S-- macaque_prot S--N--H--D--R--I--Q--R--L--R--Q--E--F--Q--Q--A--K--Q--D--E--D--V--E--D--R--R--R--T--Y--S--F--E--Q--P-----P--N--A--R--P--A--A--Q--S--G--R--H--S--V--S-- human_dna AGCAATCATGATCGGATACAGCGTCTGAGGCAAGAATTTCAGCAAGCAAAGCAAGATGAAGATGTAGAAGATCGTCGGCGGACCTATAGTTTTGAGCAACCC---CCGAACGCACGGCCGGCGACGCAGAGCGGGCGACACTCGGTGTCC chimp_dna AGCAACCATGATCGGATACAGCGTCTGAGGCAAGAATTTCAGCAAGCAAAGCAAGATGAAGATGTAGAAGATCGTCGGCGGACCTATAGTTTTGAGCAACCC---CCGAACGCACGG-CGGCGACGCAGAGCGGGCGGCACTCGGTGTCC macaque_dna AGCAATCATGATCGGATACAGCGTCTGAGGCAAGAATTTCAGCAAGCAAAGCAGGATGAAGATGTAGAAGATCGTCGACGGACCTACAGCTTTGAGCAACCC---CCGAACGCACGGCCGGCGGCGCAGAGCGGGCGGCACTCGGTGTCC hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 360. ....|361. ....|362. ....|363. ....|364. ....|365. ....|366. ....|367. ....|368. ....|369. ....|370. ....|371. ....|372. ....|373. ....|374. ....| prot V--E--V--Q--M--Q--R--Q--R--Q--E--E--R--E--S--S--Q--Q--A--Q--R--Q--Y--S--S--L--P--R--Q--S--R--K--N--A--S--S--V--S--Q--D--S--W--E--Q--N--Y--S--P--G--E-- human_prot V--E--V--Q--M--Q--R--Q--R--Q--E--E--R--E--S--S--Q--Q--A--Q--R--Q--Y--S--S--L-----R--Q--S--R--K--N--A--S--S--V--S--Q--D--S--W--E--Q--N--Y--S--P--G--E-- chimp_prot V--E--V--Q--M--Q--R--Q--R--Q--E--E--R--E--S--S--Q--Q--A--Q--R--Q--Y--S--S--L-----R--Q--S--R--K--N--A--S--S--V--S--Q--D--S--W--E--Q--N--Y--S--P--G--E-- macaque_prot V--E--V--Q--M--Q--R--Q--R--Q--E--E--R--E--S--S--Q--Q--A--Q--R--Q--Y--S--S--L-----R--Q--S--R--K--N--A--S--S--V--S--Q--D--S--W--E--Q--N--Y--S--P--G--E-- human_dna GTGGAGGTGCAGATGCAGCGGCAGCGGCAGGAGGAGCGCGAGAGCTCCCAGCAGGCCCAGCGCCAGTACAGCTCTCTG---AGGCAAAGCAGGAAAAATGCCAGCTCGGTCTCCCAGGACTCTTGGGAGCAGAACTACTCCCCTGGGGAA chimp_dna GTGGAGGTGCAGATGCAGCGGCAGCGGCAGGAGGAGCGCGAGAGCTCCCAGCAGGCCCAGCGCCAGTACAGCTCTCTG---AGGCAAAGCAGGAAAAATGCCAGCTCGGTCTCCCAGGACTCTTGGGAGCAGAACTACTCCCCTGGGGAA macaque_dna GTGGAGGTGCAGATGCAGCGGCAGCGGCAGGAGGAGCGCGAGAGCTCCCAGCAGGCCCAGCGCCAGTACAGCTCTCTG---AGGCAAAGCAGGAAAAACGCCAGCTCGGTCTCCCAGGACTCTTGGGAGCAGAACTACTCCCCCGGGGAA hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ (H) 375. ....|376. ....|377. ....|378. ....|379. ....|380. ....|381. ....|382. ....|383. ....|384. ....|385. ....|386. ....|387. ....|388. ....|389. ....| prot G--F--Q--S--A--K--E--N--P--R--Y--S--S--Y--Q--G--S--R--N--G--Y--L--G--G--H--G--F--N--A--R--V--M--L--E--T--Q--E--L--L--R--Q--E--Q--R--R--K--E--Q--Q--M-- human_prot G--F--Q--S--A--K--E--N--P--R--Y--S--S--Y--Q--G--S--R--N--G--Y--L--G--G--H--G--F--N--A--R--V--M--L--E--T--Q--E--L--L--R--Q--E--Q--R--R--K--E--Q--Q--M-- chimp_prot G--F--Q--S--A--K--E--N--P--R--Y--S--S--Y--Q--G--S--R--N--G--Y--L--G--G--H--G--F--N--A--R--V--M--L--E--T--Q--E--L--L--R--Q--E--Q--R--R--K--E--Q--Q--M-- macaque_prot G--F--Q--S--A--K--E--N--P--R--Y--S--S--Y--Q--G--S--R--N--G--Y--L--G--G--H--G--F--N--A--R--V--M--L--E--T--Q--E--L--L--R--Q--E--Q--R--R--K--E--Q--Q--M-- human_dna GGCTTCCAGAGTGCCAAAGAGAACCCCAGGTACTCCAGCTACCAAGGCTCCAGGAACGGCTACCTGGGAGGACATGGCTTCAACGCCAGGGTCATGCTGGAAACTCAGGAGCTCCTTCGCCAGGAACAGAGGCGGAAGGAGCAGCAGATG chimp_dna GGCTTCCAGAGTGCCAAAGAGAACCCCAGGTACTCCAGCTACCAAGGCTCCAGGAACGGCTACCTGGGAGGACACGGCTTCAACGCCAGGGTCATGCTGGAAACTCAGGAGCTCCTTCGCCAGGAACAGAGGCGGAAGGAGCAGCAGATG macaque_dna GGCTTCCAGAGTGCCAAAGAGAACCCCAGGTACTCCAGCTACCAAGGCTCCAGGAACGGCTACCTGGGAGGACACGGCTTCAACGCCAGGGTCATGCTGGAAACTCAGGAGCTCCTTCGCCAGGAACAGAGGCGGAAGGAGCAGCAGATG hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ (C) (C) 390. ....|391. ....|392. ....|393. ....|394. ....|395. ....|396. ....|397. ....|398. ....|399. ....|400. ....|401. ....|402. ....|403. ....|404. ....| prot K--K--Q--P--P--S--E--G--P--S--N--Y--D--S--Y--K--K--V--Q--D--P--S--Y--A--P--P--K--G--P--F--R--Q--D--V--P--P--S--P--S--Q--V--A--R--L--N--R--L--Q--T--P-- human_prot K--K--Q--P--P--S--E--G--P--S--N--Y--D--S--Y--K--K--V--Q--D--P--S--Y--A--P--P--K--G--P--F--R--Q--D--V--P--P--S--P--S--Q--V--A--R--L--N--R--L--Q--T--P-- chimp_prot K--K--Q--P--P--S--E--G--P--S--N--Y--D--S--Y--K--K--V--Q--D--P--S--Y--A--P--P--K--G--P--F--R--Q--D--V--P--P--S--P--S--Q--V--A--R--L--N--R--L--Q--T--P-- macaque_prot K--K--Q--P--P--S--E--G--P--S--N--Y--D--S--Y--K--K--V--Q--D--P--S--Y--A--P--P--K--G--P--F--R--Q--D--V--P--P--S--P--S--Q--V--A--R--L--N--R--L--Q--T--P-- human_dna AAGAAGCAGCCTCCTTCCGAGGGGCCCAGCAACTATGACTCGTATAAGAAAGTCCAGGACCCCAGTTACGCCCCTCCCAAGGGGCCCTTCCGGCAAGATGTGCCCCCCTCCCCTTCTCAGGTTGCGAGGCTGAACAGACTTCAGACTCCT chimp_dna AAGAAGCAGCCTCCTTCCGAGGGGCCCAGCAACTATGACTCATATAAGAAAGTCCAGGACCCCAGTTACGCCCCTCCCAAGGGGCCCTTCCGGCAAGACGTGCCCCCCTCCCCTTCTCAGGTTGCGAGGCTGAACAGACTTCAGACTCCT macaque_dna AAGAAGCAGCCTCCTTCCGAGGGGCCGAGCAACTATGACTCGTATAAGAAAGTCCAGGACCCTAGTTACGCCCCTCCCAAGGGGCCCTTCCGGCAAGATGTGCCGCCCTCCCCTTCTCAGGTTGCGAGGCTGAACAGACTTCAGACTCCT hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ hg18_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 405. ....|406. ....|407. .. prot E--K--G--R--P--F--Y-----S-- human_prot E--K--G--R--P--F--Y-------- chimp_prot E--K--G--R--P--F--Y-------- macaque_prot E--K--G--R--P--F--Y-------- human_dna GAGAAAGGGAGGCCCTTCTA---T--- chimp_dna GAGAAAGGGAGGCCCTTCTA---T--- macaque_dna GAGAAAGGGAGGCCCTTCTA---C--- hg18 --------------------------- panTro2 --------------------------- rheMac2 --------------------------- codon_pos --------------------------- hg18_prot --------------------------- panTro_prot --------------------------- 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