C                                      C                                (H)                              
                    .... ....|1... ....|2... ....|3... ....|4... ....|5... ....|6... ....|7... ....|8... ....|9... ....|10.. ....|11.. ....|12.. ....|13.. ....|14.. ....|
prot                M--G--S--R--P--C--S--P--S--A--C--L--A--P--W--W--G--Q--Q--P--G--G--P--G--P--A--K--R--S--R--L--E--E--P--A--G--P--E--S--R--A--A--P--S--P--E--D--P--A--G--
human_prot          M--G--S--R--P--C--S--P--S--A--C--L--A--P--W--W--G--Q--Q--P--G--G--P--G--P--A--K--R--S--R--L--E--E--P--A--G--P--E--S--R--A--A--P--S--P--E--D--P--A--G--
chimp_prot          M--G--S--R--P--C--S--P--S--A--C--L--A--P--W--G--G--Q--Q--P--G--G--P--G--P--A--K--R--L--R--L--E--E--P--A--G--P--E--S--R--A--A--P--S--P--E--D--P--A--G--
macaque_prot        M--G--S--R--P--R--S--P--S--A--C--L--A--P--W--W--G--Q--Q--P--G--G--P--G--P--A--K--R--S--R--L--E--E--P--A--G--P--E--P--R--V--A--P--S--P--E--D--P--A--G--
human_dna           ATGGGCAGCCGGCCCTGCAGCCCCAGCGCCTGCCTTGCGCCCTGGTGGGGACAGCAGCCAGGAGGACCAGGCCCTGCCAAGCGCAGCCGATTGGAGGAGCCCGCGGGCCCCGAATCCCGAGCGGCGCCCAGCCCGGAAGACCCGGCGGGG
chimp_dna           ATGGGCAGCCGGCCCTGCAGCCCCAGCGCCTGCCTTGCGCCCTGGGGGGGACAGCAGCCAGGAGGACCAGGCCCTGCCAAGCGCCTCCGATTGGAGGAGCCCGCGGGCCCCGAATCCCGCGCGGCGCCCAGCCCGGAAGACCCGGCGGGG
macaque_dna         ATGGGCAGCCGGCCCCGCAGTCCCAGCGCCTGCCTTGCGCCCTGGTGGGGACAGCAGCCAGGAGGACCAGGCCCTGCCAAGCGCAGCCGATTGGAGGAGCCCGCGGGCCCCGAACCCCGCGTGGCGCCCAGCCCGGAAGACCCGGCGGGG
hg18                ATGGGCAGCCGGCCCTGCAGCCCCAGCGCCTGCCTTGCGCCCTGGTGGGGACAGCAGCCAGGAGGACCAGGCCCTGCCAAGCGCAGCCGATTGGAGGAGCCCGCGGGCCCCGAATCCCGAGCGGCGCCCAGCCCGGAAGACCCGGCGGGG
panTro2             ATGGGCAGCCGGCCCTGCAGCCCCAGCGCCTGCCTTGCGCCCTGGGGGGGACAGCAGCCAGGAGGACCAGGCCCTGCCAAGCGCCTCCGATTGGAGGAGCCCGCGGGCCCCGAATCCCGCGCGGCGCCCAGCCCGGAAGACCCGGCGGGG
rheMac2             ATGGGCAGCCGGCCCCGCAGTCCCAGCGCCTGCCTTGCGCCCTGGTGGGGACAGCAGCCAGGAGGACCAGGCCCTGCCAAGCGCAGCCGATTGGAGGAGCCCGCGGGCCCCGAACCCCGCGTGGCGCCCAGCCCGGAAGACCCGGCGGGG
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           M--G--S--R--P--C--S--P--S--A--C--L--A--P--W--W--G--Q--Q--P--G--G--P--G--P--A--K--R--S--R--L--E--E--P--A--G--P--E--S--R--A--A--P--S--P--E--D--P--A--G--
panTro_prot         M--G--S--R--P--C--S--P--S--A--C--L--A--P--W--G--G--Q--Q--P--G--G--P--G--P--A--K--R--L--R--L--E--E--P--A--G--P--E--S--R--A--A--P--S--P--E--D--P--A--G--
rheMac_prot         M--G--S--R--P--R--S--P--S--A--C--L--A--P--W--W--G--Q--Q--P--G--G--P--G--P--A--K--R--S--R--L--E--E--P--A--G--P--E--P--R--V--A--P--S--P--E--D--P--A--G--

                                                  C                                                                                                                       
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prot                T--P--A--V--D--A--L--T--S--M--V--V--L--D--A--G--C--A--L--R--V--P--L--E--D--V--D--L--V--L--E--L--A--P--M--S--V--L--R--V--S--L--G--G--H--T--L--I--V--I--
human_prot          T--P--A--V--D--A--L--T--S--M--V--V--L--D--A--G--C--A--L--R--V--P--L--E--D--V--D--L--V--L--E--L--A--P--M--S--V--L--R--V--S--L--G--G--H--T--L--I--V--I--
chimp_prot          T--P--A--V--D--A--L--T--S--M--M--V--L--D--A--G--C--A--L--R--V--P--L--E--D--V--D--L--V--L--E--L--A--P--M--S--V--L--R--V--S--L--G--G--H--T--L--I--V--I--
macaque_prot        I--P--A--V--D--A--L--T--S--V--V--V--L--A--A--G--C--A--L--R--V--P--L--E--N--V--D--L--V--L--E--L--A--P--M--S--V--L--R--V--S--L--G--G--H--T--L--I--L--I--
human_dna           ACCCCGGCCGTGGACGCGCTCACCTCCATGGTGGTCCTGGACGCGGGCTGTGCCCTGCGTGTGCCCCTGGAGGACGTCGACCTGGTGCTGGAGCTCGCGCCAATGTCGGTCCTGCGAGTGTCTCTTGGTGGACACACCCTCATCGTGATC
chimp_dna           ACCCCGGCCGTGGACGCGCTCACCTCCATGATGGTCCTGGACGCGGGCTGTGCCCTGCGTGTGCCCCTGGAGGACGTCGACCTGGTGCTGGAGCTCGCGCCAATGTCGGTCCTGCGAGTGTCTCTTGGTGGACACACCCTCATCGTGATC
macaque_dna         ATCCCGGCCGTGGACGCGCTCACCTCCGTGGTGGTCCTGGCCGCGGGCTGTGCCCTGCGTGTGCCCCTGGAGAACGTCGACCTGGTGCTGGAGCTCGCGCCAATGTCGGTCCTGCGAGTGTCTCTTGGTGGACACACCCTCATCCTGATC
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panTro2             ACCCCGGCCGTGGACGCGCTCACCTCCATGATGGTCCTGGACGCGGGCTGTGCCCTGCGTGTGCCCCTGGAGGACGTCGACCTGGTGCTGGAGCTCGCGCCAATGTCGGTCCTGCGAGTGTCTCTTGGTGGACACACCCTCATCGTGATC
rheMac2             ATCCCGGCCGTGGACGCGCTCACCTCCGTGGTGGTCCTGGCCGCGGGCTGTGCCCTGCGTGTGCCCCTGGAGAACGTCGACCTGGTGCTGGAGCTCGCGCCAATGTCGGTCCTGCGAGTGTCTCTTGGTGGACACACCCTCATCCTGATC
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           T--P--A--V--D--A--L--T--S--M--V--V--L--D--A--G--C--A--L--R--V--P--L--E--D--V--D--L--V--L--E--L--A--P--M--S--V--L--R--V--S--L--G--G--H--T--L--I--V--I--
panTro_prot         T--P--A--V--D--A--L--T--S--M--M--V--L--D--A--G--C--A--L--R--V--P--L--E--D--V--D--L--V--L--E--L--A--P--M--S--V--L--R--V--S--L--G--G--H--T--L--I--V--I--
rheMac_prot         I--P--A--V--D--A--L--T--S--V--V--V--L--A--A--G--C--A--L--R--V--P--L--E--N--V--D--L--V--L--E--L--A--P--M--S--V--L--R--V--S--L--G--G--H--T--L--I--L--I--

                                                                                                                                                                          
                    30.. ....|31.. ....|32.. ....|33.. ....|34.. ....|35.. ....|36.. ....|37.. ....|38.. ....|39.. ....|40.. ....|41.. ....|42.. ....|43.. ....|44.. ....|
prot                P--E--V--L--L--S--S--V--D--E--C--S--G--A--Q--G--D--W--S--A--G--L--E--V--D--V--F--L--G--A--H--G--E--D--V--V--V--E--Q--E--V--------C--A--S--V--P--E--I--
human_prot          P--E--V--L--L--S--S--V--D--E--C--S--G--A--Q--G--D--W--S--A--G--L--E--V--D--V--F--L--G--A--H--G--E--D--V--V--V--E--Q--E-----------C--A--S--V--P--E--I--
chimp_prot          P--E--V--L--L--S--S--V--D--E--C--S--G--A--Q--G--D--W--S--A--G--L--E--V--D--V--F--L--G--A--H--G--E--D--V--V--V--E--Q--E-----------C--A--S--V--P--E--I--
macaque_prot        P--E--V--L--L--S--S--V--D--E--R--S--G--A--Q--G--D--S--S--A--G--L--E--V--D--V--F--L--G--A--H--G--E--D--V--V--V--Q--Q--E-----------C--A--S--V--P--E--I--
human_dna           CCCGAGGTCCTCCTGAGCTCCGTCGACGAATGCTCAGGAGCGCAGGGCGACTGGTCTGCCGGCCTGGAAGTGGACGTTTTCCTGGGCGCTCACGGGGAAGACGTCGTCGTCGAGCAGGAA---------TGCGCATCTGTCCCAGAGATC
chimp_dna           CCCGAGGTCCTCCTGAGCTCCGTCGACGAATGCTCAGGAGCGCAGGGCGACTGGTCTGCCGGCCTGGAAGTGGACGTTTTCCTGGGCGCTCACGGGGAAGACGTCGTCGTCGAGCAGGAA---------TGCGCATCTGTCCCAGAGATC
macaque_dna         CCGGAGGTCCTCCTAAGCTCCGTCGACGAACGCTCAGGAGCGCAGGGCGACTCGTCTGCCGGCCTGGAAGTGGACGTTTTCCTGGGCGCTCACGGGGAAGACGTCGTCGTCCAGCAGGAA---------TGCGCATCTGTCCCAGAGATC
hg18                CCCGAGGTCCTCCTGAGCTCCGTCGACGAATGCTCAGGAGCGCAGGGCGACTGGTCTGCCGGCCTGGAAGTGGACGTTTTCCTGGGCGCTCACGGGGAAGACGTCGTCGTCGAGCAGGAAG---TC---TGCGCATCTGTCCCAGAGATC
panTro2             CCCGAGGTCCTCCTGAGCTCCGTCGACGAATGCTCAGGAGCGCAGGGCGACTGGTCTGCCGGCCTGGAAGTGGACGTTTTCCTGGGCGCTCACGGGGAAGACGTCGTCGTCGAGCAGGAAGTCTTC---TGCGCATCTGTCCCAGAGATC
rheMac2             CCGGAGGTCCTCCTAAGCTCCGTCGACGAACGCTCAGGAGCGCAGGGCGACTCGTCTGCCGGCCTGGAAGTGGACGTTTTCCTGGGCGCTCACGGGGAAGACGTCGTCGTCCAGCAGGAAGTCTTC---TGCGCATCTGTCCCAGAGATC
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hg18_prot           P--E--V--L--L--S--S--V--D--E--C--S--G--A--Q--G--D--W--S--A--G--L--E--V--D--V--F--L--G--A--H--G--E--D--V--V--V--E--Q--E--V--------C--A--S--V--P--E--I--
panTro_prot         P--E--V--L--L--S--S--V--D--E--C--S--G--A--Q--G--D--W--S--A--G--L--E--V--D--V--F--L--G--A--H--G--E--D--V--V--V--E--Q--E--V--F-----C--A--S--V--P--E--I--
rheMac_prot         P--E--V--L--L--S--S--V--D--E--R--S--G--A--Q--G--D--S--S--A--G--L--E--V--D--V--F--L--G--A--H--G--E--D--V--V--V--Q--Q--E--V--F-----C--A--S--V--P--E--I--

                                                                                                                                                                          
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prot                A--A--E--E--E--A--Y--E--E--D--A--D--S--E--F--P--E--L--W--M--D--S--A--A--G--S--A--A--G--L--Y--P--S--A--R--S--M--F--S--P--Y--R--E--G--P--I--R--G--P--C--
human_prot          A--A--E--E--E--A--Y--E--E--D--A--D--S--E--F--P--E--L--W--M--D--S--A--A--G--S--A--A--G--L--Y--P--S--A--R--S--M--F--S--P--Y--R--E--G--P--I--R--G--P--C--
chimp_prot          A--A--E--E--E--A--Y--E--E--D--A--D--S--E--F--P--E--L--W--M--D--S--A--A--G--S--A--A--G--L--Y--P--S--A--R--S--M--F--S--P--Y--R--E--G--P--I--R--G--P--C--
macaque_prot        A--A--Q--E--E--A--Y--E--E--D--A--D--S--E--F--P--E--L--R--M--D--S--A--S--G--S--A--A--G--L--Y--P--S--A--R--S--M--F--S--P--Y--R--E--G--P--I--P--G--P--C--
human_dna           GCTGCCGAGGAAGAGGCCTACGAGGAGGACGCGGACTCTGAGTTCCCGGAGCTCTGGATGGACTCCGCAGCCGGCTCAGCCGCTGGGCTCTACCCCTCCGCTAGAAGTATGTTCAGCCCCTACCGGGAGGGCCCCATCCGAGGGCCCTGT
chimp_dna           GCTGCCGAGGAAGAGGCCTACGAGGAGGACGCGGACTCTGAGTTCCCGGAGCTCTGGATGGACTCCGCAGCCGGCTCAGCCGCTGGGCTCTACCCCTCCGCTAGAAGTATGTTCAGCCCCTACCGGGAGGGCCCCATCCGAGGGCCCTGT
macaque_dna         GCTGCCCAGGAAGAGGCCTACGAGGAGGACGCGGACTCTGAATTCCCGGAGCTCCGCATGGACTCCGCATCCGGCTCAGCCGCTGGGCTCTACCCCTCCGCTAGAAGTATGTTCAGCCCCTATCGGGAGGGCCCCATCCCAGGGCCCTGT
hg18                GCTGCCGAGGAAGAGGCCTACGAGGAGGACGCGGACTCTGAGTTCCCGGAGCTCTGGATGGACTCCGCAGCCGGCTCAGCCGCTGGGCTCTACCCCTCCGCTAGAAGTATGTTCAGCCCCTACCGGGAGGGCCCCATCCGAGGGCCCTGT
panTro2             GCTGCCGAGGAAGAGGCCTACGAGGAGGACGCGGACTCTGAGTTCCCGGAGCTCTGGATGGACTCCGCAGCCGGCTCAGCCGCTGGGCTCTACCCCTCCGCTAGAAGTATGTTCAGCCCCTACCGGGAGGGCCCCATCCGAGGGCCCTGT
rheMac2             GCTGCCCAGGAAGAGGCCTACGAGGAGGACGCGGACTCTGAATTCCCGGAGCTCCGCATGGACTCCGCATCCGGCTCAGCCGCTGGGCTCTACCCCTCCGCTAGAAGTATGTTCAGCCCCTATCGGGAGGGCCCCATCCCAGGGCCCTGT
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           A--A--E--E--E--A--Y--E--E--D--A--D--S--E--F--P--E--L--W--M--D--S--A--A--G--S--A--A--G--L--Y--P--S--A--R--S--M--F--S--P--Y--R--E--G--P--I--R--G--P--C--
panTro_prot         A--A--E--E--E--A--Y--E--E--D--A--D--S--E--F--P--E--L--W--M--D--S--A--A--G--S--A--A--G--L--Y--P--S--A--R--S--M--F--S--P--Y--R--E--G--P--I--R--G--P--C--
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prot                A--L--A--P--N--P--S--S--E--R--R--S--P--R--P--I--F--D--L--E--F--H--L--L--E--P--V--P--S--S--P--L--Q--P--L--P--P--S--P--S--P--G--P--H--A--R--P--E--L--P--
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chimp_prot          A--L--A--P--N--P--S--S--E--R--R--S--P--R--P--I--F--D--L--E--F--H--L--L--E--P--V--P--S--S--P--L--Q--P--L--P--P--S--P--S--P--G--P--H--A--R--P--E--L--P--
macaque_prot        A--P--A--S--N--P--S--S--E--R--R--S--P--S--P--I--F--D--P--E--F--H--L--L--E--P--V--P--S--S--P--L--Q--P--L--P--P--S--P--S--P--G--P--H--E--R--P--E--L--P--
human_dna           GCTCTGGCCCCCAACCCCAGTTCAGAGAGACGCTCTCCACGCCCCATCTTCGACCTGGAATTCCATCTTCTGGAGCCTGTCCCCAGCTCACCTCTCCAACCTCTACCTCCCTCTCCGAGTCCAGGTCCCCACGCGCGCCCGGAGCTCCCA
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panTro2             GCTCTGGCCCCCAACCCCAGTTCAGAGAGACGCTCTCCACGCCCCATCTTCGACCTGGAATTCCATCTTCTGGAGCCTGTCCCCAGCTCACCTCTCCAACCTCTACCTCCCTCTCCGAGTCCAGGTCCCCACGCGCGCCCGGAGCTCCCA
rheMac2             GCTCCGGCCTCCAACCCCAGTTCAGAGAGACGCTCTCCAAGCCCCATCTTCGACCCGGAATTCCACCTTCTGGAGCCTGTCCCCAGCTCACCTCTCCAACCTCCACCTCCCTCTCCAAGTCCGGGTCCCCACGAGCGCCCGGAGCTCCCA
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           A--L--A--P--N--P--S--S--E--R--R--S--P--R--P--I--F--D--L--E--F--H--L--L--E--P--V--P--S--S--P--L--Q--P--L--P--P--S--P--S--P--G--P--H--A--R--P--E--L--P--
panTro_prot         A--L--A--P--N--P--S--S--E--R--R--S--P--R--P--I--F--D--L--E--F--H--L--L--E--P--V--P--S--S--P--L--Q--P--L--P--P--S--P--S--P--G--P--H--A--R--P--E--L--P--
rheMac_prot         A--P--A--S--N--P--S--S--E--R--R--S--P--S--P--I--F--D--P--E--F--H--L--L--E--P--V--P--S--S--P--L--Q--P--P--P--P--S--P--S--P--G--P--H--E--R--P--E--L--P--

                                                                    
                    75.. ....|76.. ....|77.. ....|78.. ....|79.. ...
prot                E--R--P--P--C--K--V--R--R--R--L--F--Q--E--------
human_prot          E--R--P--P--C--K--V--R--R--R--L--F--Q-----------
chimp_prot          E--R--P--P--C--K--V--R--R--R--L--F--Q-----------
macaque_prot        E--R--P--P--C--K--A--R--R--R--L--F--Q-----------
human_dna           GAGCGCCCTCCGTGCAAGGTCCGAAGACGCCTGTTCCAG---------
chimp_dna           GAGCGCCCTCCGTGCAAGGTCCGAAGACGCCTGTTCCAG---------
macaque_dna         GAGCGCCCTCCGTGCAAGGCCCGGAGACGCCTGTTCCAG---------
hg18                GAGCGCCCTCCGTGCAAGGTCCGAAGACGCCTGTTCCAGGA---A---
panTro2             GAGCGCCCTCCGTGCAAGGTCCGAAGACGCCTGTTCCAGGA---A---
rheMac2             GAGCGCCCTCCGTGCAAGGCCCGGAGACGCCTGTTCCAGGA---A---
codon_pos           01201201201201201201201201201201201201201---2---
hg18_prot           E--R--P--P--C--K--V--R--R--R--L--F--Q--E--------
panTro_prot         E--R--P--P--C--K--V--R--R--R--L--F--Q--E--------
rheMac_prot         E--R--P--P--C--K--A--R--R--R--L--F--Q--E--------