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prot                M--I--E--M--A--A--E--K--E--P--F--L--V--P--A--P--P--P--P--L--K--D--E--S--G--G--G--G--G--P--T--V--P--P--H--Q--E--A--A--S--G--E--L--R--G--G--T--E--R--G--
human_prot          M--I--E--M--A--A--E--K--E--P--F--L--V--P--A--P--P--P--P--L--K--D--E--S--G--G--G--G--G--P--T--V--P--P--H--Q--E--A--A--S--G--E--L--R--G--G--T--E--R--G--
chimp_prot          M--I--E--M--A--A--E--K--E--P--F--L--V--P--A--P--P--P--P--L--K--D--E--S--G--G--G--G--G--P--T--V--P--P--H--Q--E--A--A--S--G--E--L--R--G--G--T--E--R--G--
macaque_prot        M--I--E--M--A--A--E--K--E--P--F--L--V--P--A--P--P--P--P--L--K--D--E--S--G--G--G--G--G--P--T--V--P--P--H--Q--E--A--A--S--G--E--L--C--G--G--T--E--R--G--
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panTro2             ATGATCGAGATGGCGGCGGAGAAGGAGCCGTTTCTGGTGCCGGCCCCGCCGCCGCCGCTCAAAGATGAGTCGGGCGGAGGGGGCGGCCCCACGGTGCCACCGCACCAAGAGGCCGCCTCTGGGGAGCTCCGCGGCGGGACGGAGCGTGGT
rheMac2             ATGATCGAGATGGCGGCGGAGAAGGAGCCGTTTCTGGTGCCGGCCCCGCCGCCGCCGCTCAAAGATGAGTCGGGCGGAGGGGGCGGCCCCACTGTGCCACCGCACCAAGAGGCCGCCTCTGGGGAGCTCTGCGGCGGGACGGAGCGTGGT
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           M--I--E--M--A--A--E--K--E--P--F--L--V--P--A--P--P--P--P--L--K--D--E--S--G--G--G--G--G--P--T--V--P--P--H--Q--E--A--A--S--G--E--L--R--G--G--T--E--R--G--
panTro_prot         M--I--E--M--A--A--E--K--E--P--F--L--V--P--A--P--P--P--P--L--K--D--E--S--G--G--G--G--G--P--T--V--P--P--H--Q--E--A--A--S--G--E--L--R--G--G--T--E--R--G--
rheMac_prot         M--I--E--M--A--A--E--K--E--P--F--L--V--P--A--P--P--P--P--L--K--D--E--S--G--G--G--G--G--P--T--V--P--P--H--Q--E--A--A--S--G--E--L--C--G--G--T--E--R--G--

                                                  (H)   C                                                                                               (H)               
                    15.. ....|16.. ....|17.. ....|18.. ....|19.. ....|20.. ....|21.. ....|22.. ....|23.. ....|24.. ....|25.. ....|26.. ....|27.. ....|28.. ....|29.. ....|
prot                P--G--R--C--A--P--S--A--G--S--P--A--A--A--V--G--R--E--S--P--G--A--A--A--T--S--S--S--G--P--Q--A--Q--Q--H--R--G--G--G--P--Q--A--Q--S--H--G--E--A--R--L--
human_prot          P--G--R--C--A--P--S--A--G--S--P--A--A--A--V--G--R--E--S--P--G--A--A--A--T--S--S--S--G--P--Q--A--Q--Q--H--R--G--G--G--P--Q--A--Q--S--H--G--E--A--R--L--
chimp_prot          P--G--R--C--A--P--S--A--G--S--P--A--S--A--V--G--R--E--S--P--G--A--A--A--T--S--P--S--G--P--Q--A--Q--Q--H--R--G--G--G--P--Q--A--Q--S--H--G--E--A--R--L--
macaque_prot        P--G--P--C--A--P--S--A--G--S--P--A--A--G--V--G--R--E--------------------------------G--P--Q--A--Q--Q--H--R--G--G--G--P--Q--A--Q--S--H--G--E--A--R--L--
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rheMac2             CCGGGTCCTTGCGCGCCGTCTGCGGGGTCCCCGGCCGCTGGGGTCGGTCGAGAGAGCCCCGGGGCCGCGGCCACCCCCCCCGGTGGTCCCCAGGCGCAGCAGCACCGAGGAGGCGGCCCCCAGGCGCAGTCGCACGGGGAGGCCCGCCTG
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hg18_prot           P--G--R--C--A--P--S--A--G--S--P--A--A--A--V--G--R--E--S--P--G--A--A--A--T--S--S--S--G--P--Q--A--Q--Q--H--R--G--G--G--P--Q--A--Q--S--H--G--E--A--R--L--
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                                                                                                                                                        (C)               
                    30.. ....|31.. ....|32.. ....|33.. ....|34.. ....|35.. ....|36.. ....|37.. ....|38.. ....|39.. ....|40.. ....|41.. ....|42.. ....|43.. ....|44.. ....|
prot                S--D--P--P--G--R--A--A--P--P--D--V--G--E--E--R--R--G--G--G--G--T--E--L--G--P--P--A--P--P--R--P--R--N--G--Y--Q--P--H--R--P--P--G--G--G--G--G--K--R--R--
human_prot          S--D--P--P--G--R--A--A--P--P--D--V--G--E--E--R--R--G--G--G--G--T--E--L--G--P--P--A--P--P--R--P--R--N--G--Y--Q--P--H--R--P--P--G--G--G--G--G--K--R--R--
chimp_prot          S--D--P--P--G--R--A--A--P--P--D--V--G--E--E--R--R--G--G--G--G--T--E--L--G--P--P--A--P--P--R--P--R--N--G--Y--Q--P--H--R--P--P--G--G--G--G--G--K--R--R--
macaque_prot        S--D--P--P--G--R--A--A--P--P--D--V--G--E--E--R--R--G--G--G--G--T--E--L--G--P--P--A--P--P--R--P--R--N--G--Y--Q--P--H--R--P--P--G--G--G--G--G--K--R--R--
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panTro2             TCGGATCCCCCGGGGCGAGCCGCTCCCCCGGACGTGGGGGAGGAGCGCCGGGGAGGGGGCGGGACAGAGCTGGGTCCCCCTGCTCCTCCTCGACCCCGCAATGGCTATCAGCCCCACCGGCCACCTGGGGGGGGTGGGGGCAAGAGGAGA
rheMac2             TCGGATCCCCCGGGGCGAGCCGCTCCCCCGGACGTGGGGGAGGAGCGCCGGGGAGGGGGCGGGACAGAGCTGGGTCCCCCTGCTCCTCCTCGACCCCGCAATGGCTATCAGCCCCACCGGCCACCTGGGGGGGGCGGGGGCAAGAGGAGA
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hg18_prot           S--D--P--P--G--R--A--A--P--P--D--V--G--E--E--R--R--G--G--G--G--T--E--L--G--P--P--A--P--P--R--P--R--N--G--Y--Q--P--H--R--P--P--G--G--G--G--G--K--R--R--
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                                            (C)                                                                                                                           
                    45.. ....|46.. ....|47.. ....|48.. ....|49.. ....|50.. ....|51.. ....|52.. ....|53.. ....|54.. ....|55.. ....|56.. ....|57.. ....|58.. ....|59.. ....|
prot                N--S--C--N--V--G--G--G--G--G--G--F--K--H--P--A--F--K--R--R--R--R--V--N--S--D--C--D--S--V--L--P--S--N--F--L--L--G--G--N--I--F--D--P--L--N--L--N--S--L--
human_prot          N--S--C--N--V--G--G--G--G--G--G--F--K--H--P--A--F--K--R--R--R--R--V--N--S--D--C--D--S--V--L--P--S--N--F--L--L--G--G--N--I--F--D--P--L--N--L--N--S--L--
chimp_prot          N--S--C--N--V--G--G--G--G--G--G--F--K--H--P--A--F--K--R--R--R--R--V--N--S--D--C--D--S--V--L--P--S--N--F--L--L--G--G--N--I--F--D--P--L--N--L--N--S--L--
macaque_prot        N--S--C--N--V--G--G--G--G--G--G--F--K--H--P--A--F--K--R--R--R--R--V--N--S--D--C--D--S--V--L--P--S--N--F--L--L--G--G--N--I--F--D--P--L--N--L--N--S--L--
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                                         H                                                     (H)                                                                        
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macaque_prot        L--D--E--E--V--S--R--A--L--N--A--E--T--P--K--S--S--P--L--P--A--K--G--R--D--P--V--E--I--L--I--P--K--D--I--T--D--P--L--S--L--N--T--C--T--D--E--G--H--V--
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panTro2             CTGGATGAGGAAGTGAGCCGCGCCCTCAACGCGGAGACCCCTAAGTCATCCCCCCTTCCGGCCAAAGGGCGAGATCCAGTGGAGATCCTCATCCCCAAAGATATTACTGACCCGCTCAGTCTCAATACTTGCACTGATGAGGGCCATGTA
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hg18_prot           L--D--E--E--V--S--R--T--L--N--A--E--T--P--K--S--S--P--L--P--A--K--G--R--D--P--V--E--I--L--I--P--K--D--I--T--D--P--L--S--L--N--T--C--T--D--E--G--H--V--
panTro_prot         L--D--E--E--V--S--R--A--L--N--A--E--T--P--K--S--S--P--L--P--A--K--G--R--D--P--V--E--I--L--I--P--K--D--I--T--D--P--L--S--L--N--T--C--T--D--E--G--H--V--
rheMac_prot         L--D--E--E--V--S--R--A--L--N--A--E--T--P--K--S--S--P--L--P--A--K--G--R--D--P--V--E--I--L--I--P--K--D--I--T--D--P--L--S--L--N--T--C--T--D--E--G--H--V--

                                                                                                              (H)                                 H                       
                    75.. ....|76.. ....|77.. ....|78.. ....|79.. ....|80.. ....|81.. ....|82.. ....|83.. ....|84.. ....|85.. ....|86.. ....|87.. ....|88.. ....|89.. ....|
prot                V--L--A--S--P--L--K--T--G--R--K--R--H--R--H--R--G--Q--H--H--Q--Q--Q--Q--A--A--G--G--S--E--S--H--P--V--P--P--T--A--P--L--T--P--L--L--H--G--E--G--A--S--
human_prot          V--L--A--S--P--L--K--T--G--R--K--R--H--R--H--R--G--Q--H--H--Q--Q--Q--Q--A--A--G--G--S--E--S--H--P--V--P--P--T--A--P--L--T--P--L--L--H--G--E--G--A--S--
chimp_prot          V--L--A--S--P--L--K--T--G--R--K--R--H--R--H--R--G--Q--H--H--Q--Q--Q--Q--A--A--G--G--S--E--S--H--P--V--P--P--T--A--P--L--T--P--S--L--H--G--E--G--A--S--
macaque_prot        V--L--A--S--P--L--K--T--G--R--K--R--H--R--H--R--G--Q--H--H--Q--Q--Q--Q--A--A--G--G--S--E--S--H--P--V--L--P--T--A--P--L--T--P--S--L--H--G--E--G--A--S--
human_dna           GTTCTTGCTTCGCCACTCAAGACTGGTCGGAAGCGGCATAGACACCGGGGACAGCACCACCAGCAGCAGCAGGCAGCCGGAGGGAGTGAGAGTCACCCCGTGCCGCCCACAGCCCCTCTCACCCCCTTACTCCACGGGGAGGGCGCCTCA
chimp_dna           GTTCTTGCTTCGCCACTCAAGACTGGTCGGAAGCGGCATAGACACCGGGGACAGCACCACCAGCAGCAGCAGGCAGCCGGAGGGAGTGAGAGCCACCCCGTGCCGCCCACAGCCCCTCTCACCCCCTCACTCCACGGGGAGGGCGCCTCA
macaque_dna         GTTCTTGCTTCGCCACTCAAGACTGGTCGGAAGCGGCATAGACACCGGGGACAGCACCACCAGCAGCAGCAGGCAGCCGGAGGGAGTGAGAGCCACCCCGTGCTGCCCACAGCCCCTCTCACCCCCTCACTCCACGGGGAGGGCGCCTCA
hg18                GTTCTTGCTTCGCCACTCAAGACTGGTCGGAAGCGGCATAGACACCGGGGACAGCACCACCAGCAGCAGCAGGCAGCCGGAGGGAGTGAGAGTCACCCCGTGCCGCCCACAGCCCCTCTCACCCCCTTACTCCACGGGGAGGGCGCCTCA
panTro2             GTTCTTGCTTCGCCACTCAAGACTGGTCGGAAGCGGCATAGACACCGGGGACAGCACCACCAGCAGCAGCAGGCAGCCGGAGGGAGTGAGAGCCACCCCGTGCCGCCCACAGCCCCTCTCACCCCCTCACTCCACGGGGAGGGCGCCTCA
rheMac2             GTTCTTGCTTCGCCACTCAAGACTGGTCGGAAGCGGCATAGACACCGGGGACAGCACCACCAGCAGCAGCAGGCAGCCGGAGGGAGTGAGAGCCACCCCGTGCTGCCCACAGCCCCTCTCACCCCCTCACTCCACGGGGAGGGCGCCTCA
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           V--L--A--S--P--L--K--T--G--R--K--R--H--R--H--R--G--Q--H--H--Q--Q--Q--Q--A--A--G--G--S--E--S--H--P--V--P--P--T--A--P--L--T--P--L--L--H--G--E--G--A--S--
panTro_prot         V--L--A--S--P--L--K--T--G--R--K--R--H--R--H--R--G--Q--H--H--Q--Q--Q--Q--A--A--G--G--S--E--S--H--P--V--P--P--T--A--P--L--T--P--S--L--H--G--E--G--A--S--
rheMac_prot         V--L--A--S--P--L--K--T--G--R--K--R--H--R--H--R--G--Q--H--H--Q--Q--Q--Q--A--A--G--G--S--E--S--H--P--V--L--P--T--A--P--L--T--P--S--L--H--G--E--G--A--S--

                                                                                                                                                                          
                    90.. ....|91.. ....|92.. ....|93.. ....|94.. ....|95.. ....|96.. ....|97.. ....|98.. ....|99.. ....|100. ....|101. ....|102. ....|103. ....|104. ....|
prot                Q--Q--P--R--H--R--G--Q--N--R--D--A--P--Q--P--Y--E--L--N--T--A--I--N--C--R--D--E--V--V--S--P--L--P--S--A--L--Q--G--P--S--G--S--L--S--A--P--P--A--A--S--
human_prot          Q--Q--P--R--H--R--G--Q--N--R--D--A--P--Q--P--Y--E--L--N--T--A--I--N--C--R--D--E--V--V--S--P--L--P--S--A--L--Q--G--P--S--G--S--L--S--A--P--P--A--A--S--
chimp_prot          Q--Q--P--R--H--R--G--Q--N--R--D--A--P--Q--P--Y--E--L--N--T--A--I--N--C--R--D--E--V--V--S--P--L--P--S--A--L--Q--G--P--S--G--S--L--S--A--P--P--A--A--S--
macaque_prot        Q--Q--P--R--H--R--G--Q--N--R--D--A--P--Q--P--Y--E--L--N--T--A--I--N--C--R--D--E--V--V--S--P--L--P--S--A--L--Q--G--P--S--G--S--L--S--A--P--P--A--A--S--
human_dna           CAGCAGCCGCGGCACAGGGGCCAGAACCGGGATGCCCCCCAACCCTATGAACTCAACACAGCCATCAACTGCAGGGATGAAGTGGTGTCTCCCCTTCCATCTGCTCTGCAGGGTCCCTCAGGCTCCCTATCAGCCCCTCCAGCTGCCTCA
chimp_dna           CAGCAGCCGCGGCACAGGGGCCAGAACCGGGATGCCCCCCAACCCTATGAACTCAACACAGCCATCAACTGCAGGGATGAAGTGGTGTCTCCCCTTCCATCTGCTCTGCAGGGTCCCTCAGGCTCCCTATCAGCCCCTCCAGCTGCCTCA
macaque_dna         CAGCAGCCGCGGCACAGAGGCCAGAACCGGGATGCCCCCCAACCCTATGAACTCAACACAGCCATCAACTGCAGGGATGAAGTGGTGTCTCCGCTTCCATCTGCTCTACAGGGTCCCTCAGGCTCCCTATCAGCCCCTCCAGCTGCCTCA
hg18                CAGCAGCCGCGGCACAGGGGCCAGAACCGGGATGCCCCCCAACCCTATGAACTCAACACAGCCATCAACTGCAGGGATGAAGTGGTGTCTCCCCTTCCATCTGCTCTGCAGGGTCCCTCAGGCTCCCTATCAGCCCCTCCAGCTGCCTCA
panTro2             CAGCAGCCGCGGCACAGGGGCCAGAACCGGGATGCCCCCCAACCCTATGAACTCAACACAGCCATCAACTGCAGGGATGAAGTGGTGTCTCCCCTTCCATCTGCTCTGCAGGGTCCCTCAGGCTCCCTATCAGCCCCTCCAGCTGCCTCA
rheMac2             CAGCAGCCGCGGCACAGAGGCCAGAACCGGGATGCCCCCCAACCCTATGAACTCAACACAGCCATCAACTGCAGGGATGAAGTGGTGTCTCCGCTTCCATCTGCTCTACAGGGTCCCTCAGGCTCCCTATCAGCCCCTCCAGCTGCCTCA
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           Q--Q--P--R--H--R--G--Q--N--R--D--A--P--Q--P--Y--E--L--N--T--A--I--N--C--R--D--E--V--V--S--P--L--P--S--A--L--Q--G--P--S--G--S--L--S--A--P--P--A--A--S--
panTro_prot         Q--Q--P--R--H--R--G--Q--N--R--D--A--P--Q--P--Y--E--L--N--T--A--I--N--C--R--D--E--V--V--S--P--L--P--S--A--L--Q--G--P--S--G--S--L--S--A--P--P--A--A--S--
rheMac_prot         Q--Q--P--R--H--R--G--Q--N--R--D--A--P--Q--P--Y--E--L--N--T--A--I--N--C--R--D--E--V--V--S--P--L--P--S--A--L--Q--G--P--S--G--S--L--S--A--P--P--A--A--S--

                                                                                               C                                                                          
                    105. ....|106. ....|107. ....|108. ....|109. ....|110. ....|111. ....|112. ....|113. ....|114. ....|115. ....|116. ....|117. ....|118. ....|119. ....|
prot                V--I--S--A--P--P--S--S--S--S--R--H--R--K--R--R--R--T--S--S--K--S--E--A--G--A--R--G--G--G--Q--G--S--K--E--K--G--R--G--S--W--G--G--R--H--H--H--H--H--P--
human_prot          V--I--S--A--P--P--S--S--S--S--R--H--R--K--R--R--R--T--S--S--K--S--E--A--G--A--R--G--G--G--Q--G--S--K--E--K--G--R--G--S--W--G--G--R--H--H--H--H--H--P--
chimp_prot          V--I--S--A--P--P--S--S--S--S--R--H--R--K--R--R--R--T--S--S--K--S--E--A--G--N--R--G--G--G--Q--G--S--K--E--K--G--R--G--S--W--G--G--R--H--H--H--H--H--P--
macaque_prot        V--T--S--A--P--P--S--S--S--S--R--H--R--K--R--R--R--T--S--S--K--S--E--A--G--A--R--G--G--G--Q--G--S--K--E--K--G--R--G--S--W--G--G--R--H--H--H--H--H--P--
human_dna           GTTATCTCTGCACCCCCATCTTCCTCCTCCCGACATCGCAAACGTCGCAGGACTTCCAGCAAGTCGGAGGCAGGGGCTAGGGGTGGAGGCCAGGGTTCCAAGGAAAAGGGCCGAGGGAGTTGGGGAGGCCGCCACCACCACCACCACCCA
chimp_dna           GTTATCTCTGCACCCCCATCTTCCTCCTCCCGACATCGCAAACGTCGCAGGACTTCCAGCAAGTCGGAGGCAGGGAATAGGGGTGGAGGCCAGGGTTCCAAGGAAAAGGGCCGAGGGAGTTGGGGAGGCCGCCACCACCACCACCACCCA
macaque_dna         GTTACCTCTGCACCCCCATCTTCCTCCTCCCGACATCGCAAACGTCGCAGGACTTCCAGCAAGTCGGAGGCAGGGGCTAGGGGTGGAGGCCAGGGTTCCAAGGAAAAGGGCCGAGGGAGTTGGGGAGGCCGTCACCACCACCACCACCCA
hg18                GTTATCTCTGCACCCCCATCTTCCTCCTCCCGACATCGCAAACGTCGCAGGACTTCCAGCAAGTCGGAGGCAGGGGCTAGGGGTGGAGGCCAGGGTTCCAAGGAAAAGGGCCGAGGGAGTTGGGGAGGCCGCCACCACCACCACCACCCA
panTro2             GTTATCTCTGCACCCCCATCTTCCTCCTCCCGACATCGCAAACGTCGCAGGACTTCCAGCAAGTCGGAGGCAGGGAATAGGGGTGGAGGCCAGGGTTCCAAGGAAAAGGGCCGAGGGAGTTGGGGAGGCCGCCACCACCACCACCACCCA
rheMac2             GTTACCTCTGCACCCCCATCTTCCTCCTCCCGACATCGCAAACGTCGCAGGACTTCCAGCAAGTCGGAGGCAGGGGCTAGGGGTGGAGGCCAGGGTTCCAAGGAAAAGGGCCGAGGGAGTTGGGGAGGCCGTCACCACCACCACCACCCA
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           V--I--S--A--P--P--S--S--S--S--R--H--R--K--R--R--R--T--S--S--K--S--E--A--G--A--R--G--G--G--Q--G--S--K--E--K--G--R--G--S--W--G--G--R--H--H--H--H--H--P--
panTro_prot         V--I--S--A--P--P--S--S--S--S--R--H--R--K--R--R--R--T--S--S--K--S--E--A--G--N--R--G--G--G--Q--G--S--K--E--K--G--R--G--S--W--G--G--R--H--H--H--H--H--P--
rheMac_prot         V--T--S--A--P--P--S--S--S--S--R--H--R--K--R--R--R--T--S--S--K--S--E--A--G--A--R--G--G--G--Q--G--S--K--E--K--G--R--G--S--W--G--G--R--H--H--H--H--H--P--

                                   (C)                                                                                                                                    
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prot                L--P--A--A--G--F--K--K--Q--Q--R--K--F--Q--Y--G--N--Y--C--K--Y--Y--G--Y--R--N--P--S--C--E--D--G--R--L--R--V--L--K--P--E--W--F--R--G--R--D--V--L--D--L--
human_prot          L--P--A--A--G--F--K--K--Q--Q--R--K--F--Q--Y--G--N--Y--C--K--Y--Y--G--Y--R--N--P--S--C--E--D--G--R--L--R--V--L--K--P--E--W--F--R--G--R--D--V--L--D--L--
chimp_prot          L--P--A--A--G--F--K--K--Q--Q--R--K--F--Q--Y--G--N--Y--C--K--Y--Y--G--Y--R--N--P--S--C--E--D--G--R--L--R--V--L--K--P--E--W--F--R--G--R--D--V--L--D--L--
macaque_prot        L--P--A--A--G--F--K--K--Q--Q--R--K--F--Q--Y--G--N--Y--C--K--Y--Y--G--Y--R--N--P--S--C--E--D--G--R--L--R--V--L--K--P--E--W--F--R--G--R--D--V--L--D--L--
human_dna           CTGCCTGCAGCAGGCTTCAAAAAGCAACAGCGCAAGTTCCAGTATGGGAATTATTGCAAATACTATGGGTACCGCAATCCTTCCTGTGAGGATGGGCGCCTTCGGGTGTTGAAGCCTGAGTGGTTTCGGGGCCGGGACGTCCTAGATCTG
chimp_dna           CTGCCTGCAGCAGGCTTTAAAAAGCAACAGCGCAAGTTCCAGTATGGGAATTATTGCAAATACTATGGGTACCGCAATCCTTCCTGTGAGGATGGGCGCCTTCGGGTGTTGAAGCCTGAGTGGTTTCGGGGCCGGGACGTCCTAGATCTG
macaque_dna         CTGCCTGCAGCAGGCTTCAAAAAGCAACAGCGCAAGTTCCAGTATGGGAATTACTGCAAATACTATGGGTACCGCAATCCTTCCTGTGAGGATGGGCGCCTTCGGGTGTTGAAGCCTGAGTGGTTTCGGGGCCGGGACGTCCTAGATCTG
hg18                CTGCCTGCAGCAGGCTTCAAAAAGCAACAGCGCAAGTTCCAGTATGGGAATTATTGCAAATACTATGGGTACCGCAATCCTTCCTGTGAGGATGGGCGCCTTCGGGTGTTGAAGCCTGAGTGGTTTCGGGGCCGGGACGTCCTAGATCTG
panTro2             CTGCCTGCAGCAGGCTTTAAAAAGCAACAGCGCAAGTTCCAGTATGGGAATTATTGCAAATACTATGGGTACCGCAATCCTTCCTGTGAGGATGGGCGCCTTCGGGTGTTGAAGCCTGAGTGGTTTCGGGGCCGGGACGTCCTAGATCTG
rheMac2             CTGCCTGCAGCAGGCTTCAAAAAGCAACAGCGCAAGTTCCAGTATGGGAATTACTGCAAATACTATGGGTACCGCAATCCTTCCTGTGAGGATGGGCGCCTTCGGGTGTTGAAGCCTGAGTGGTTTCGGGGCCGGGACGTCCTAGATCTG
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           L--P--A--A--G--F--K--K--Q--Q--R--K--F--Q--Y--G--N--Y--C--K--Y--Y--G--Y--R--N--P--S--C--E--D--G--R--L--R--V--L--K--P--E--W--F--R--G--R--D--V--L--D--L--
panTro_prot         L--P--A--A--G--F--K--K--Q--Q--R--K--F--Q--Y--G--N--Y--C--K--Y--Y--G--Y--R--N--P--S--C--E--D--G--R--L--R--V--L--K--P--E--W--F--R--G--R--D--V--L--D--L--
rheMac_prot         L--P--A--A--G--F--K--K--Q--Q--R--K--F--Q--Y--G--N--Y--C--K--Y--Y--G--Y--R--N--P--S--C--E--D--G--R--L--R--V--L--K--P--E--W--F--R--G--R--D--V--L--D--L--

                                                                                                                                                                          
                    135. ....|136. ....|137. ....|138. ....|139. ....|140. ....|141. ....|142. ....|143. ....|144. ....|145. ....|146. ....|147. ....|148. ....|149. ....|
prot                G--C--N--V--G--H--L--T--L--S--I--A--C--K--W--G--P--S--R--M--V--G--L--D--I--D--S--R--L--I--H--S--A--R--Q--N--I--R--H--Y--L--S--E--E--L--R--L--P--P--Q--
human_prot          G--C--N--V--G--H--L--T--L--S--I--A--C--K--W--G--P--S--R--M--V--G--L--D--I--D--S--R--L--I--H--S--A--R--Q--N--I--R--H--Y--L--S--E--E--L--R--L--P--P--Q--
chimp_prot          G--C--N--V--G--H--L--T--L--S--I--A--C--K--W--G--P--S--R--M--V--G--L--D--I--D--S--R--L--I--H--S--A--R--Q--N--I--R--H--Y--L--S--E--E--L--R--L--P--P--Q--
macaque_prot        G--C--N--V--G--H--L--T--L--S--I--A--C--K--W--G--P--S--R--M--V--G--L--D--I--D--S--R--L--I--H--S--A--R--Q--N--I--R--H--Y--L--S--E--E--L--R--L--P--P--Q--
human_dna           GGCTGCAATGTGGGCCATCTGACCCTGAGCATTGCCTGCAAGTGGGGCCCGTCCCGCATGGTGGGCCTGGATATCGATTCCCGGCTCATCCATTCTGCCCGCCAAAACATCCGACACTACCTTTCCGAGGAGCTGCGTCTCCCACCCCAG
chimp_dna           GGCTGCAATGTGGGCCATCTGACCCTGAGCATTGCCTGCAAGTGGGGCCCGTCCCGCATGGTGGGCCTGGATATCGATTCCCGGCTCATCCATTCTGCCCGCCAAAACATCCGACACTACCTTTCCGAGGAGCTGCGTCTCCCACCCCAG
macaque_dna         GGCTGCAATGTGGGCCATCTGACCCTGAGCATTGCCTGCAAGTGGGGCCCGTCCCGCATGGTGGGCTTGGATATAGATTCCCGGCTCATCCATTCTGCCCGTCAGAACATCCGACACTACCTTTCCGAGGAGCTGCGTCTCCCACCCCAG
hg18                GGCTGCAATGTGGGCCATCTGACCCTGAGCATTGCCTGCAAGTGGGGCCCGTCCCGCATGGTGGGCCTGGATATCGATTCCCGGCTCATCCATTCTGCCCGCCAAAACATCCGACACTACCTTTCCGAGGAGCTGCGTCTCCCACCCCAG
panTro2             GGCTGCAATGTGGGCCATCTGACCCTGAGCATTGCCTGCAAGTGGGGCCCGTCCCGCATGGTGGGCCTGGATATCGATTCCCGGCTCATCCATTCTGCCCGCCAAAACATCCGACACTACCTTTCCGAGGAGCTGCGTCTCCCACCCCAG
rheMac2             GGCTGCAATGTGGGCCATCTGACCCTGAGCATTGCCTGCAAGTGGGGCCCGTCCCGCATGGTGGGCTTGGATATAGATTCCCGGCTCATCCATTCTGCCCGTCAGAACATCCGACACTACCTTTCCGAGGAGCTGCGTCTCCCACCCCAG
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           G--C--N--V--G--H--L--T--L--S--I--A--C--K--W--G--P--S--R--M--V--G--L--D--I--D--S--R--L--I--H--S--A--R--Q--N--I--R--H--Y--L--S--E--E--L--R--L--P--P--Q--
panTro_prot         G--C--N--V--G--H--L--T--L--S--I--A--C--K--W--G--P--S--R--M--V--G--L--D--I--D--S--R--L--I--H--S--A--R--Q--N--I--R--H--Y--L--S--E--E--L--R--L--P--P--Q--
rheMac_prot         G--C--N--V--G--H--L--T--L--S--I--A--C--K--W--G--P--S--R--M--V--G--L--D--I--D--S--R--L--I--H--S--A--R--Q--N--I--R--H--Y--L--S--E--E--L--R--L--P--P--Q--

                                                                                               (H)                                                                        
                    150. ....|151. ....|152. ....|153. ....|154. ....|155. ....|156. ....|157. ....|158. ....|159. ....|160. ....|161. ....|162. ....|163. ....|164. ....|
prot                T--L--E--G--D--P--G--A--E--G--E--E--G--T--T--T--V--R--K--R--S--C--F--P--A--S--L--T--A--S--R--G--P--I--A--A--P--Q--V--P--L--D--G--A--D--T--S--V--F--P--
human_prot          T--L--E--G--D--P--G--A--E--G--E--E--G--T--T--T--V--R--K--R--S--C--F--P--A--S--L--T--A--S--R--G--P--I--A--A--P--Q--V--P--L--D--G--A--D--T--S--V--F--P--
chimp_prot          T--L--E--G--D--P--G--A--E--G--E--E--G--T--T--T--V--R--K--R--S--C--F--P--A--S--L--T--A--S--R--G--P--I--A--A--P--Q--V--P--L--D--G--A--D--T--S--V--F--P--
macaque_prot        T--V--E--G--D--P--G--A--E--G--E--E--G--T--T--T--V--R--K--R--S--C--F--P--A--S--L--T--A--S--R--G--P--I--A--A--P--Q--V--P--L--D--G--A--D--T--S--V--F--P--
human_dna           ACTTTGGAAGGGGACCCGGGGGCAGAGGGTGAGGAAGGGACCACCACCGTTCGAAAGAGGAGCTGCTTCCCAGCCTCGCTGACTGCCAGCCGGGGTCCCATCGCTGCCCCCCAAGTGCCCTTGGATGGAGCGGACACATCAGTCTTCCCC
chimp_dna           ACTTTGGAAGGGGACCCGGGGGCAGAGGGTGAGGAAGGGACCACCACCGTTCGAAAGAGGAGCTGCTTCCCAGCCTCACTGACTGCCAGCCGGGGTCCCATCGCTGCCCCCCAAGTGCCCTTGGATGGAGCGGACACATCAGTCTTCCCC
macaque_dna         ACTGTGGAAGGGGACCCGGGGGCAGAGGGTGAGGAAGGGACCACCACCGTTCGAAAGAGGAGCTGCTTCCCAGCCTCACTGACTGCCAGCCGGGGTCCCATCGCTGCCCCCCAAGTGCCCTTGGATGGAGCGGACACATCAGTCTTCCCC
hg18                ACTTTGGAAGGGGACCCGGGGGCAGAGGGTGAGGAAGGGACCACCACCGTTCGAAAGAGGAGCTGCTTCCCAGCCTCGCTGACTGCCAGCCGGGGTCCCATCGCTGCCCCCCAAGTGCCCTTGGATGGAGCGGACACATCAGTCTTCCCC
panTro2             ACTTTGGAAGGGGACCCGGGGGCAGAGGGTGAGGAAGGGACCACCACCGTTCGAAAGAGGAGCTGCTTCCCAGCCTCACTGACTGCCAGCCGGGGTCCCATCGCTGCCCCCCAAGTGCCCTTGGATGGAGCGGACACATCAGTCTTCCCC
rheMac2             ACTGTGGAAGGGGACCCGGGGGCAGAGGGTGAGGAAGGGACCACCACCGTTCGAAAGAGGAGCTGCTTCCCAGCCTCACTGACTGCCAGCCGGGGTCCCATCGCTGCCCCCCAAGTGCCCTTGGATGGAGCGGACACATCAGTCTTCCCC
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           T--L--E--G--D--P--G--A--E--G--E--E--G--T--T--T--V--R--K--R--S--C--F--P--A--S--L--T--A--S--R--G--P--I--A--A--P--Q--V--P--L--D--G--A--D--T--S--V--F--P--
panTro_prot         T--L--E--G--D--P--G--A--E--G--E--E--G--T--T--T--V--R--K--R--S--C--F--P--A--S--L--T--A--S--R--G--P--I--A--A--P--Q--V--P--L--D--G--A--D--T--S--V--F--P--
rheMac_prot         T--V--E--G--D--P--G--A--E--G--E--E--G--T--T--T--V--R--K--R--S--C--F--P--A--S--L--T--A--S--R--G--P--I--A--A--P--Q--V--P--L--D--G--A--D--T--S--V--F--P--

                                                                                                                                                                          
                    165. ....|166. ....|167. ....|168. ....|169. ....|170. ....|171. ....|172. ....|173. ....|174. ....|175. ....|176. ....|177. ....|178. ....|179. ....|
prot                N--N--V--V--F--V--T-----G--N--Y--V--L--D--R--D--D--L--V--E--A--Q--T--P--E--Y--D--V--V--L--C--L--S--L--T--K--W--V--H--L--N--W--G--D--E--G--L--K--R--M--
human_prot          N--N--V--V--F--V--------G--N--Y--V--L--D--R--D--D--L--V--E--A--Q--T--P--E--Y--D--V--V--L--C--L--S--L--T--K--W--V--H--L--N--W--G--D--E--G--L--K--R--M--
chimp_prot          N--N--V--V--F--V--------G--N--Y--V--L--D--R--D--D--L--V--E--A--Q--T--P--E--Y--D--V--V--L--C--L--S--L--T--K--W--V--H--L--N--W--G--D--E--G--L--K--R--M--
macaque_prot        N--N--V--V--F--V--------G--N--Y--V--L--D--R--D--D--L--V--E--A--Q--T--P--E--Y--D--V--V--L--C--L--S--L--T--K--W--V--H--L--N--W--G--D--E--G--L--K--R--M--
human_dna           AACAATGTTGTCTTCGTC------GGTAATTATGTGCTGGATCGAGATGACCTGGTGGAGGCCCAAACACCTGAGTATGATGTGGTGCTCTGCCTCAGCCTCACCAAGTGGGTGCATCTGAACTGGGGAGACGAGGGCCTGAAGCGCATG
chimp_dna           AACAATGTTGTCTTCGTC------GGTAATTATGTGCTGGATCGAGATGACCTGGTGGAGGCCCAAACACCTGAGTATGATGTGGTGCTCTGCCTCAGCCTCACCAAGTGGGTGCATCTGAACTGGGGAGACGAGGGCCTGAAGCGCATG
macaque_dna         AACAATGTTGTCTTCGTC------GGTAATTATGTGCTGGATCGAGATGACCTGGTGGAGGCCCAAACGCCTGAGTATGATGTGGTGCTCTGCCTCAGCCTCACCAAGTGGGTGCATCTGAACTGGGGAGATGAGGGCCTGAAGCGCATG
hg18                AACAATGTTGTCTTCGTCACG---GGTAATTATGTGCTGGATCGAGATGACCTGGTGGAGGCCCAAACACCTGAGTATGATGTGGTGCTCTGCCTCAGCCTCACCAAGTGGGTGCATCTGAACTGGGGAGACGAGGGCCTGAAGCGCATG
panTro2             AACAATGTTGTCTTCGTCACG---GGTAATTATGTGCTGGATCGAGATGACCTGGTGGAGGCCCAAACACCTGAGTATGATGTGGTGCTCTGCCTCAGCCTCACCAAGTGGGTGCATCTGAACTGGGGAGACGAGGGCCTGAAGCGCATG
rheMac2             AACAATGTTGTCTTCGTCACG---GGTAATTATGTGCTGGATCGAGATGACCTGGTGGAGGCCCAAACGCCTGAGTATGATGTGGTGCTCTGCCTCAGCCTCACCAAGTGGGTGCATCTGAACTGGGGAGATGAGGGCCTGAAGCGCATG
codon_pos           012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           N--N--V--V--F--V--T-----G--N--Y--V--L--D--R--D--D--L--V--E--A--Q--T--P--E--Y--D--V--V--L--C--L--S--L--T--K--W--V--H--L--N--W--G--D--E--G--L--K--R--M--
panTro_prot         N--N--V--V--F--V--T-----G--N--Y--V--L--D--R--D--D--L--V--E--A--Q--T--P--E--Y--D--V--V--L--C--L--S--L--T--K--W--V--H--L--N--W--G--D--E--G--L--K--R--M--
rheMac_prot         N--N--V--V--F--V--T-----G--N--Y--V--L--D--R--D--D--L--V--E--A--Q--T--P--E--Y--D--V--V--L--C--L--S--L--T--K--W--V--H--L--N--W--G--D--E--G--L--K--R--M--

                                   (C)                                                                                                            (C)                     
                    180. ....|181. ....|182. ....|183. ....|184. ....|185. ....|186. ....|187. ....|188. ....|189. ....|190. ....|191. ....|192. ....|193. ....|194. ....|
prot                F--R--R--I--Y--R--H--L--R--P--G--G--I--L--V--L--E--P--Q--P--W--S--S--Y--G--K--R--K--T--L--T-----E--T--I--Y--K--N--Y--Y--R--I--Q--L--K--P--E--Q--F--S--
human_prot          F--R--R--I--Y--R--H--L--R--P--G--G--I--L--V--L--E--P--Q--P--W--S--S--Y--G--K--R--K--T--L--------E--T--I--Y--K--N--Y--Y--R--I--Q--L--K--P--E--Q--F--S--
chimp_prot          F--R--R--I--Y--R--H--L--R--P--G--G--I--L--V--L--E--P--Q--P--W--S--S--Y--G--K--R--K--T--L--------E--T--I--Y--K--N--Y--Y--R--I--Q--L--K--P--E--Q--F--S--
macaque_prot        F--R--R--I--Y--R--H--L--R--P--G--G--I--L--V--L--E--P--Q--P--W--S--S--Y--G--K--R--K--T--L--------E--T--I--Y--K--N--Y--Y--R--I--Q--L--K--P--E--Q--F--S--
human_dna           TTTCGCCGGATCTACCGGCACCTACGCCCTGGGGGCATCCTGGTCCTAGAGCCCCAACCCTGGTCGTCGTATGGCAAGAGAAAGACTCTT------GAAACGATCTACAAGAACTACTACCGAATCCAATTGAAGCCAGAGCAGTTCAGT
chimp_dna           TTTCGCCGGATCTACAGGCACCTACGCCCTGGGGGCATCCTGGTCCTAGAGCCCCAACCCTGGTCGTCGTATGGCAAGAGAAAGACTCTT------GAAACGATCTACAAGAACTACTACCGAATCCAGTTGAAGCCAGAGCAGTTCAGT
macaque_dna         TTTCGCCGGATCTACCGGCACCTACGCCCTGGAGGCATCCTGGTCCTAGAGCCCCAACCCTGGTCGTCGTATGGCAAGAGAAAGACCCTT------GAAACAATCTACAAGAACTACTACCGAATCCAACTGAAGCCAGAGCAGTTCAGT
hg18                TTTCGCCGGATCTACCGGCACCTACGCCCTGGGGGCATCCTGGTCCTAGAGCCCCAACCCTGGTCGTCGTATGGCAAGAGAAAGACTCTTACA---GAAACGATCTACAAGAACTACTACCGAATCCAATTGAAGCCAGAGCAGTTCAGT
panTro2             TTTCGCCGGATCTACAGGCACCTACGCCCTGGGGGCATCCTGGTCCTAGAGCCCCAACCCTGGTCGTCGTATGGCAAGAGAAAGACTCTTACA---GAAACGATCTACAAGAACTACTACCGAATCCAGTTGAAGCCAGAGCAGTTCAGT
rheMac2             TTTCGCCGGATCTACCGGCACCTACGCCCTGGAGGCATCCTGGTCCTAGAGCCCCAACCCTGGTCGTCGTATGGCAAGAGAAAGACCCTTACG---GAAACAATCTACAAGAACTACTACCGAATCCAACTGAAGCCAGAGCAGTTCAGT
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           F--R--R--I--Y--R--H--L--R--P--G--G--I--L--V--L--E--P--Q--P--W--S--S--Y--G--K--R--K--T--L--T-----E--T--I--Y--K--N--Y--Y--R--I--Q--L--K--P--E--Q--F--S--
panTro_prot         F--R--R--I--Y--R--H--L--R--P--G--G--I--L--V--L--E--P--Q--P--W--S--S--Y--G--K--R--K--T--L--T-----E--T--I--Y--K--N--Y--Y--R--I--Q--L--K--P--E--Q--F--S--
rheMac_prot         F--R--R--I--Y--R--H--L--R--P--G--G--I--L--V--L--E--P--Q--P--W--S--S--Y--G--K--R--K--T--L--T-----E--T--I--Y--K--N--Y--Y--R--I--Q--L--K--P--E--Q--F--S--

                                                                                                                                                        
                    195. ....|196. ....|197. ....|198. ....|199. ....|200. ....|201. ....|202. ....|203. ....|204. ....|205. ....|206. ....|207. ....|20
prot                S--Y--L--T--S--P--D--V--G--F--S--S--Y--E--L--V--A--T--P--H--N--T--S--K-----G--F--Q--R--P--V--Y--L--F--H--K--A--R--S--P--S--H--------
human_prot          S--Y--L--T--S--P--D--V--G--F--S--S--Y--E--L--V--A--T--P--H--N--T--S--------G--F--Q--R--P--V--Y--L--F--H--K--A--R--S--P--S-----------
chimp_prot          S--Y--L--T--S--P--D--V--G--F--S--S--Y--E--L--V--A--T--P--H--N--T--S--------G--F--Q--R--P--V--Y--L--F--H--K--A--R--S--P--S-----------
macaque_prot        S--Y--L--T--S--P--D--V--G--F--S--S--Y--E--L--V--A--T--P--H--N--T--S--------G--F--Q--R--P--V--Y--L--F--H--K--A--R--S--P--S-----------
human_dna           TCCTACCTGACATCCCCAGACGTGGGCTTCTCCAGCTATGAGCTTGTGGCCACACCCCACAACACCTCT------GGCTTCCAGCGTCCTGTGTACCTGTTCCACAAGGCCCGATCCCCCAGC---------
chimp_dna           TCCTACCTGACATCCCCAGACGTGGGCTTCTCCAGCTATGAGCTTGTGGCCACACCCCACAACACCTCT------GGCTTCCAGCGTCCTGTGTACCTGTTCCACAAGGCCCGATCCCCCAGC---------
macaque_dna         TCCTACCTGACATCCCCAGACGTGGGCTTCTCCAGCTATGAGCTTGTGGCCACACCCCACAACACCTCT------GGCTTCCAGCGTCCTGTGTACCTGTTCCACAAGGCCCGATCCCCCAGC---------
hg18                TCCTACCTGACATCCCCAGACGTGGGCTTCTCCAGCTATGAGCTTGTGGCCACACCCCACAACACCTCTAAA---GGCTTCCAGCGTCCTGTGTACCTGTTCCACAAGGCCCGATCCCCCAGCCA---C---
panTro2             TCCTACCTGACATCCCCAGACGTGGGCTTCTCCAGCTATGAGCTTGTGGCCACACCCCACAACACCTCTAAA---GGCTTCCAGCGTCCTGTGTACCTGTTCCACAAGGCCCGATCCCCCAGCCA---C---
rheMac2             TCCTACCTGACATCCCCAGACGTGGGCTTCTCCAGCTATGAGCTTGTGGCCACACCCCACAACACCTCTAAA---GGCTTCCAGCGTCCTGTGTACCTGTTCCACAAGGCCCGATCCCCCAGCCA---C---
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---01201201201201201201201201201201201201201201201201---2---
hg18_prot           S--Y--L--T--S--P--D--V--G--F--S--S--Y--E--L--V--A--T--P--H--N--T--S--K-----G--F--Q--R--P--V--Y--L--F--H--K--A--R--S--P--S--H--------
panTro_prot         S--Y--L--T--S--P--D--V--G--F--S--S--Y--E--L--V--A--T--P--H--N--T--S--K-----G--F--Q--R--P--V--Y--L--F--H--K--A--R--S--P--S--H--------
rheMac_prot         S--Y--L--T--S--P--D--V--G--F--S--S--Y--E--L--V--A--T--P--H--N--T--S--K-----G--F--Q--R--P--V--Y--L--F--H--K--A--R--S--P--S--H--------