(C)
                    .... ....|1... ....|2... ....|3... ....|4... ....|5... ....|6... ....|7... ....|8... ....|9... ....|10.. ....|11.. ....|12.. ....|13.. ....|14.. ....|
prot                M--A--L--A--P--E--R--A--A--P--R--V--L--F--G--E--W--L--L--G--E--I--S--S--G--C--Y--E--G--L--Q--W--L--D--E--A--R--T--C--F--R--V--P--W--K--H--F--A--R--K--
human_prot          ------------------R--A--A--P--R--V--L--F--G--E--W--L--L--G--E--I--S--S--G--C--Y--E--G--L--Q--W--L--D--E--A--R--T--C--F--R--V--P--W--K--H--F--A--R--K--
chimp_prot          ------------------R--A--A--P--R--V--L--F--G--E--W--L--L--G--E--I--S--S--G--C--Y--E--G--L--Q--W--L--D--E--A--R--T--C--F--R--V--P--W--K--H--F--A--R--K--
macaque_prot        ------------------R--A--A--P--R--V--L--F--G--E--W--L--L--G--E--I--S--S--G--C--Y--E--G--L--Q--W--L--D--E--A--R--T--C--F--R--V--P--W--K--H--F--A--R--K--
human_dna           ------------------AGGGCAGCCCCACGCGTGCTGTTCGGAGAGTGGCTCCTTGGAGAGATCAGCAGCGGCTGCTATGAGGGGCTGCAGTGGCTGGACGAGGCCCGCACCTGTTTCCGCGTGCCCTGGAAGCACTTCGCGCGCAAG
chimp_dna           ------------------AGGGCAGCCCCACGCGTGCTGTTCGGAGAGTGGCTCCTTGGAGAGATCAGCAGCGGCTGCTATGAGGGGCTGCAGTGGCTGGACGAGGCCCGCACCTGTTTCCGCGTGCCCTGGAAGCACTTCGCGCGCAAA
macaque_dna         ------------------AGGGCGGCCCCACGCGTGCTGTTCGGAGAGTGGCTCCTTGGAGAGATCAGCAGCGGCTGCTATGAGGGGCTGCAGTGGCTGGACGAGGCCCGCACCTGCTTCCGCGTGCCCTGGAAGCACTTCGCGCGCAAG
hg18                ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
codon_pos           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
hg18_prot           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

                                                                                                     H                                                                    
                    15.. ....|16.. ....|17.. ....|18.. ....|19.. ....|20.. ....|21.. ....|22.. ....|23.. ....|24.. ....|25.. ....|26.. ....|27.. ....|28.. ....|29.. ....|
prot                D--L--S--E--A--D--A--R--I--F--K--A--W--A--V--A--R--G--R--W--P--P--S--S--R--G--G--G--P--P--P--E--A--E--T--A--E--R--A--G--W--K--T--N--F--R--C--A--L--R--
human_prot          D--L--S--E--A--D--A--R--I--F-----A--W--A--V--A--R--G--R--W--P--P--S--S--R--G--G--G-----P--P--E--A--E--T--A--E--R--A--G--W--K--T--N--F--R--C--A--L--R--
chimp_prot          D--L--S--E--A--D--A--R--I--F-----A--W--A--V--A--R--G--R--W--P--P--S--S--R--G--G--D-----P--P--E--A--E--T--A--E--R--A--G--W--K--T--N--F--R--C--A--L--R--
macaque_prot        D--L--S--E--A--D--A--R--I--F-----A--W--A--V--A--R--G--R--W--P--P--S--S--R--G--G--D-----P--P--E--A--E--A--A--E--R--A--G--W--K--T--N--F--R--C--A--L--R--
human_dna           GACCTGAGCGAGGCCGACGCGCGCATCTTC---GCCTGGGCTGTGGCCCGCGGCAGGTGGCCGCCTAGCAGCAGGGGAGGTGGC---CCCCCCGAGGCTGAGACTGCGGAGCGCGCCGGCTGGAAAACCAACTTCCGCTGCGCACTGCGC
chimp_dna           GACCTGAGCGAGGCCGACGCGCGCATCTTC---GCCTGGGCTGTGGCCCGCGGCAGGTGGCCGCCTAGCAGCAGGGGAGGTGAC---CCCCCCGAGGCTGAGACTGCGGAGCGCGCCGGCTGGAAAACCAACTTCCGCTGCGCACTGCGC
macaque_dna         GACCTGAGCGAGGCTGACGCGCGCATCTTC---GCCTGGGCGGTGGCCCGCGGCAGGTGGCCGCCTAGCAGCAGAGGAGGTGAC---CCCCCCGAGGCTGAGGCTGCGGAGCGCGCCGGCTGGAAAACCAACTTCCGCTGCGCACTGCGC
hg18                ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
codon_pos           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
hg18_prot           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

                                            (H)                                                                                                                           
                    30.. ....|31.. ....|32.. ....|33.. ....|34.. ....|35.. ....|36.. ....|37.. ....|38.. ....|39.. ....|40.. ....|41.. ....|42.. ....|43.. ....|44.. ....|
prot                S--T--R--R--F--V--M--L--R--D--N--S--G--D--P--A--D--P--H--K--V--Y--A--L--S--R--E--L--C--W--R--E--G--P--G--T--D--Q--T--E--A--E--A--P--A--A--V--P--P--P--
human_prot          S--T--R--R--F--V--M--L--R--D--N--S--G--D--P--A--D--P--H--K--V--Y--A--------R--E--L--C--W-----E--G--P--G--T--D--Q--T--E--A--E--A--P--A--A--V--P--P--P--
chimp_prot          S--T--R--R--F--V--M--L--R--D--N--S--G--D--P--A--D--P--H--K--V--Y--A--------R--E--L--C--W-----E--G--P--G--T--D--Q--T--E--A--E--A--P--A--A--V--P--P--P--
macaque_prot        S--T--R--R--F--V--M--L--R--D--N--S--G--D--P--A--D--P--H--K--V--Y--A--------P--E--L--G--W-----E--G--P--G--T--D--Q--T--E--A--E--A--P--A--A--V--R--P--P--
human_dna           AGCACGCGTCGCTTCGTGATGCTGCGGGATAACTCGGGGGACCCGGCCGACCCGCACAAGGTGTACGCG------CGGGAGCTGTGCTGG---GAAGGCCCAGGCACGGACCAGACTGAGGCAGAGGCCCCCGCAGCTGTCCCACCACCA
chimp_dna           AGCACGCGTCGCTTCGTGATGCTGCGAGATAACTCGGGGGACCCGGCCGACCCGCACAAGGTGTACGCG------CGGGAGCTGTGCTGG---GAAGGCCCAGGCACGGACCAGACTGAGGCAGAGGCCCCCGCAGCTGTCCCACCACCA
macaque_dna         AGCACGCGCCGCTTCGTGATGCTGCGAGATAACTCGGGGGACCCGGCCGACCCGCACAAGGTGTACGCG------CCGGAGCTGGGCTGG---GAAGGCCCAGGCACGGACCAGACTGAGGCAGAGGCCCCCGCGGCTGTCCGGCCACCG
hg18                ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
codon_pos           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
hg18_prot           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

                                                        H                                   (C)                                                   (H)                     
                    45.. ....|46.. ....|47.. ....|48.. ....|49.. ....|50.. ....|51.. ....|52.. ....|53.. ....|54.. ....|55.. ....|56.. ....|57.. ....|58.. ....|59.. ....|
prot                Q--G--G--P--P--G--P--F--L--A--H--T--H--A--G--L--Q--A--P--G--P--L--P--A--P--A--G--D--K--G--D--L--L--L--Q--A--V--Q--Q--S--C--L--A--D--H--L--L--T--A--S--
human_prot          Q--G--G--P--P--G--P--F--L--A--H--T--H--A--G--L--Q--A--P--G--P--L--P--A--P--A--G--D--K--G--D--L--L--L--Q--A--V--Q--Q--S--C--L--A--D--H--L--L--T--A--S--
chimp_prot          Q--G--G--P--P--G--P--F--L--A--H--T--D--A--G--L--Q--A--P--G--P--L--P--A--P--A--G--D--K--G--D--L--L--L--Q--A--V--Q--Q--S--C--L--A--D--H--L--L--T--A--S--
macaque_prot        Q--G--R--P--P--G--P--F--L--A--H--R--D--A--G--L--Q--A--P--G--P--F--P--A--P--A--G--D--K--G--D--L--L--L--Q--A--V--Q--Q--S--C--L--A--D--H--L--L--T--A--S--
human_dna           CAGGGTGGGCCCCCAGGGCCATTCCTGGCACACACACATGCTGGACTCCAAGCCCCAGGCCCCCTCCCTGCCCCAGCTGGTGACAAGGGGGACCTCCTGCTCCAGGCAGTGCAACAGAGCTGCCTGGCAGACCATCTGCTGACAGCGTCA
chimp_dna           CAGGGTGGGCCCCCAGGGCCATTCCTGGCACACACAGATGCTGGACTCCAAGCCCCAGGCCCCCTCCCTGCCCCGGCTGGTGACAAGGGGGACCTCCTGCTCCAGGCAGTGCAACAGAGCTGCCTGGCGGACCATCTGCTGACAGCGTCA
macaque_dna         CAGGGCAGGCCCCCAGGGCCATTCCTGGCACACAGAGATGCTGGACTCCAAGCCCCAGGCCCCTTCCCTGCCCCAGCTGGTGACAAGGGGGACCTCCTGCTCCAGGCAGTGCAGCAGAGCTGCCTGGCGGACCATCTGCTGACAGCGTCA
hg18                ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
codon_pos           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
hg18_prot           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

                                                                                                           *                                                              
                    60.. ....|61.. ....|62.. ....|63.. ....|64.. ....|65.. ....|66.. ....|67.. ....|68.. ....|69.. ....|70.. ....|71.. ....|72.. ....|73.. ....|74.. ....|
prot                W--G--A--D--P--V--P--T--K--A--P--G--E--G--Q--E--G--L--P--L--T--G--A--C--A--G--G--P--G--L--P--A--G--E--L--Y--G--W--A--V--E--T--T--P--S--P--G--P--Q--P--
human_prot          W--G--A--D--P--V--P--T--K--A--P--G--E--G--Q--E--G--L--P--L--T--G--A--C--A-----G--P--G--L--P--A--G--E--L--Y--G--W--A--V--E--T--T--P--S--P--G--P--Q--P--
chimp_prot          W--G--A--D--P--V--P--T--K--A--P--G--E--G--Q--E--G--L--P--L--T--G--A--C--A-----------G--V--P--A--G--E--L--Y--G--W--A--V--E--T--T--P--S--P--G--P--Q--P--
macaque_prot        W--G--A--D--P--V--P--A--Q--A--P--G--E--G--Q--E--G--L--P--L--T--G--A--C--A-----G--P--G--L--P--A--G--E--L--C--T--W--A--V--E--A--T--P--S--P--G--P--Q--P--
human_dna           TGGGGGGCAGATCCAGTCCCAACCAAGGCTCCTGGAGAGGGACAAGAAGGGCTTCCCCTGACTGGGGCCTGTGCT---GGCCCAGGGCTCCCTGCTGGGGAGCTGTACGGGTGGGCAGTAGAGACGACCCCCAGCCCCGGGCCCCAGCCC
chimp_dna           TGGGGGGCAGATCCAGTCCCAACCAAGGCTCCTGGAGAGGGACAAGAAGGGCTTCCCCTGACTGGGGCCTGTGCT---A---CAGGGGTCCCTGCTGGGGAGCTGTACGGGTGGGCAGTAGAGACGACCCCCAGCCCCGGGCCCCAGCCC
macaque_dna         TGGGGGGCAGACCCAGTCCCAGCCCAGGCTCCTGGAGAGGGACAAGAGGGTCTTCCCCTGACTGGGGCCTGTGCT---GGTCCAGGGCTCCCTGCTGGGGAGCTGTGCACATGGGCAGTAGAAGCAACCCCTAGCCCCGGGCCCCAGCCC
hg18                ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac2             ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
codon_pos           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
hg18_prot           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac_prot         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

                                                                                                     C                                                                    
                    75.. ....|76.. ....|77.. ....|78.. ....|79.. ....|80.. ....|81.. ....|82.. ....|83.. ....|84.. ....|85.. ....|86.. ....|87.. ....|88.. ....|89.. ....|
prot                A--A--L--T--T--G--E--A--A--A--P--E--S--P--H--Q--A--E--P--Y--L--S--P--S--P--S--A--C--T--A--V--Q--E--P--S--P--G--A--L--D--V--T--I--M--Y--K--G--R--T--V--
human_prot          A--A--L--T-----G--E--A--A--A--P--E--S--P--H--Q--A--E--P--Y--L--S--P--S--P--S--A--C--T--A--V-----E--P--S--P--G--A--L--D--V--T--I--M--Y--K--G--R--T--V--
chimp_prot          A--A--L--T-----G--E--A--A--A--P--E--S--P--H--Q--A--E--P--Y--L--S--P--S--P--S--A--R--T--A--V-----E--P--S--P--G--A--L--D--V--T--I--M--Y--K--G--R--T--V--
macaque_prot        A--A--L--M-----G--E--A--T--A--P--E--P--P--H--Q--A--E--P--Y--L--A--P--S--P--S--A--C--T--V--V-----E--P--S--P--G--A--L--D--V--T--I--M--Y--K--G--R--T--V--
human_dna           GCGGCACTAACG---GGCGAGGCCGCGGCCCCAGAGTCCCCGCACCAGGCAGAGCCGTACCTGTCACCCTCCCCAAGCGCCTGCACCGCGGTG---GAGCCCAGCCCAGGGGCGCTGGACGTGACCATCATGTACAAGGGCCGCACGGTG
chimp_dna           GCGGCACTAACG---GGCGAGGCCGCGGCCCCAGAGTCCCCGCACCAGGCAGAGCCGTACCTGTCACCCTCCCCAAGCGCCCGCACCGCGGTG---GAGCCCAGCCCAGGGGCGCTGGACGTGACCATCATGTACAAGGGCCGCACGGTG
macaque_dna         GCGGCGCTAATG---GGCGAGGCCACGGCCCCAGAGCCCCCGCACCAGGCAGAGCCATACCTGGCACCCTCCCCAAGTGCCTGCACTGTGGTG---GAGCCCAGCCCAGGGGCGCTGGACGTGACCATCATGTACAAGGGCCGCACAGTG
hg18                ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTACAAGGGCCGCACGGTG
panTro2             ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTACAAGGGCCGCACGGTG
rheMac2             ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTACAAGGGCCGCACAGTG
codon_pos           ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------012012012012012012012
hg18_prot           ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------M--Y--K--G--R--T--V--
panTro_prot         ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------M--Y--K--G--R--T--V--
rheMac_prot         ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------M--Y--K--G--R--T--V--

                                         (C)                  (C)                  (C)                                                                                    
                    90.. ....|91.. ....|92.. ....|93.. ....|94.. ....|95.. ....|96.. ....|97.. ....|98.. ....|99.. ....|100. ....|101. ....|102. ....|103. ....|104. ....|
prot                L--Q--K--V--V--G--H--P--S--C--T--F--L--Y--G--P--P--D--P--A--V--R--A--T--D--P--Q--Q--V--A--F--P--S--P--A--E--L--P--D--Q--K--Q--L--R-----Y--T--E--E--L--
human_prot          L--Q--K--V--V--G--H--P--S--C--T--F--L--Y--G--P--P--D--P--A--V--R--A--T--D--P--Q--Q--V--A--F--P--S--P--A--E--L--P--D--Q--K--Q--L--------Y--T--E--E--L--
chimp_prot          L--Q--K--V--V--G--H--P--S--C--T--F--L--Y--G--P--P--D--P--A--V--R--A--T--D--P--Q--Q--V--A--F--P--S--P--A--E--L--P--D--Q--K--Q--L--------Y--T--E--E--L--
macaque_prot        L--Q--K--V--V--G--H--P--S--C--M--F--L--Y--G--P--P--D--P--A--V--R--A--T--D--P--Q--Q--V--A--F--P--S--P--A--G--L--L-----Q--S--Q--L--------Y--T--E--E--L--
human_dna           CTGCAGAAGGTGGTGGGACACCCGAGCTGCACGTTCCTATACGGCCCCCCAGACCCAGCTGTCCGGGCCACAGACCCCCAGCAGGTAGCATTCCCCAGCCCTGCCGAGCTCCCGGACCAGAAGCAGCTG------TACACGGAGGAACTG
chimp_dna           CTGCAGAAGGTGGTGGGACACCCTAGCTGCACGTTCCTATACGGGCCCCCAGACCCAGCTGTCCGAGCCACAGACCCCCAGCAGGTAGCATTCCCCAGCCCTGCCGAGCTCCCGGACCAGAAGCAGCTG------TACACGGAGGAACTG
macaque_dna         CTGCAGAAGGTGGTGGGGCACCCGAGCTGCATGTTCCTGTACGGCCCCCCAGACCCAGCTGTCCGGGCCACAGACCCCCAGCAGGTAGCATTCCCCAGCCCTGCTGGGCTCCTCTAGCAGTCGCAGCTG------TACACGGAGGAACTG
hg18                CTGCAGAAGGTGGTGGGACACCCGAGCTGCACGTTCCTATACGGCCCCCCAGACCCAGCTGTCCGGGCCACAGACCCCCAGCAGGTAGCATTCCCCAGCCCTGCCGAGCTCCCGGACCAGAAGCAGCTGCGC---TACACGGAGGAACTG
panTro2             CTGCAGAAGGTGGTGGGACACCCTAGCTGCACGTTCCTATACGGGCCCCCAGACCCAGCTGTCCGAGCCACAGACCCCCAGCAGGTAGCATTCCCCAGCCCTGCCGAGCTCCCGGACCAGAAGCAGCTGCGC---TACACGGAGGAACTG
rheMac2             CTGCAGAAGGTGGTGGGGCACCCGAGCTGCATGTTCCTGTACGGCCCCCCAGACCCAGCTGTCCGGGCCACAGACCCCCAGCAGGTAGCATTCCCCAGCCCTGCTGAGCTCCCCGACCAGAAGCAGCTGCGC---TACACGGAGGAACTG
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012
hg18_prot           L--Q--K--V--V--G--H--P--S--C--T--F--L--Y--G--P--P--D--P--A--V--R--A--T--D--P--Q--Q--V--A--F--P--S--P--A--E--L--P--D--Q--K--Q--L--R-----Y--T--E--E--L--
panTro_prot         L--Q--K--V--V--G--H--P--S--C--T--F--L--Y--G--P--P--D--P--A--V--R--A--T--D--P--Q--Q--V--A--F--P--S--P--A--E--L--P--D--Q--K--Q--L--R-----Y--T--E--E--L--
rheMac_prot         L--Q--K--V--V--G--H--P--S--C--M--F--L--Y--G--P--P--D--P--A--V--R--A--T--D--P--Q--Q--V--A--F--P--S--P--A--E--L--P--D--Q--K--Q--L--R-----Y--T--E--E--L--

                          (C)                                                                                       (H)                                                   
                    105. ....|106. ....|107. ....|108. ....|109. ....|110. ....|111. ....|112. ....|113. ....|114. ....|115. ....|116. ....|117. ....|118. ....|119. ....|
prot                L--R--H--V--A--P--G--L--H--L--E--L--R--G--P--Q--L--W--A--R--R--M--G--K--C--K--V--Y--W--E--V--G--G--P--P--G--S--A--S--P--S--T--P--A--C--L--L--P--R--N--
human_prot          L--R--H--V--A--P--G--L--H--L--E--L--R--G--P--Q--L--W--A--R--R--M--G--K--C--K--V--Y--W--E--V--G--G--P--P--G--S--A--S--P--S--T--P--A--C--L--L--P--R--N--
chimp_prot          L--R--H--V--A--P--G--L--H--L--E--L--R--G--P--Q--L--W--A--R--R--M--G--K--C--K--V--Y--W--E--V--G--G--P--P--G--S--A--S--P--S--T--P--A--C--L--L--P--R--N--
macaque_prot        L--R--H--V--A--P--G--L--Q--L--E--L--R--G--P--Q--L--W--A--R--R--M--G--K--C--K--V--Y--W--E--V--G--G--P--P--G--S--A--S--P--S--T--P--A--C--L--L--P--R--N--
human_dna           CTGCGGCACGTGGCCCCTGGGTTGCACCTGGAGCTTCGGGGGCCACAGCTGTGGGCCCGGCGCATGGGCAAGTGCAAGGTGTACTGGGAGGTGGGCGGACCCCCAGGCTCCGCCAGCCCCTCCACCCCAGCCTGCCTGCTGCCTCGGAAC
chimp_dna           CTGCGGCATGTGGCCCCTGGGTTGCACCTGGAGCTTCGGGGGCCACAGCTGTGGGCCCGGCGCATGGGCAAGTGCAAGGTGTACTGGGAGGTGGGCGGCCCCCCAGGCTCCGCCAGCCCCTCCACCCCAGCCTGCCTGCTGCCTCGGAAC
macaque_dna         CTGAGGCACGTGGCCCCTGGGCTGCAGCTGGAGCTTCGGGGGCCACAGCTGTGGGCCCGGCGCATGGGCAAGTGCAAGGTGTACTGGGAGGTGGGTGGCCCCCCGGGCTCCGCCAGCCCCTCCACCCCAGCCTGCCTGCTGCCTCGGAAC
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panTro2             CTGCGGCATGTGGCCCCTGGGTTGCACCTGGAGCTTCGGGGGCCACAGCTGTGGGCCCGGCGCATGGGCAAGTGCAAGGTGTACTGGGAGGTGGGCGGCCCCCCAGGCTCCGCCAGCCCCTCCACCCCAGCCTGCCTGCTGCCTCGGAAC
rheMac2             CTGAGGCACGTGGCCCCTGGGCTGCAGCTGGAGCTTCGGGGGCCACAGCTGTGGGCCCGGCGCATGGGCAAGTGCAAGGTGTACTGGGAGGTGGGTGGCCCCCCGGGCTCCGCCAGCCCCTCCACCCCAGCCTGCCTGCTGCCTCGGAAC
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           L--R--H--V--A--P--G--L--H--L--E--L--R--G--P--Q--L--W--A--R--R--M--G--K--C--K--V--Y--W--E--V--G--G--P--P--G--S--A--S--P--S--T--P--A--C--L--L--P--R--N--
panTro_prot         L--R--H--V--A--P--G--L--H--L--E--L--R--G--P--Q--L--W--A--R--R--M--G--K--C--K--V--Y--W--E--V--G--G--P--P--G--S--A--S--P--S--T--P--A--C--L--L--P--R--N--
rheMac_prot         L--R--H--V--A--P--G--L--Q--L--E--L--R--G--P--Q--L--W--A--R--R--M--G--K--C--K--V--Y--W--E--V--G--G--P--P--G--S--A--S--P--S--T--P--A--C--L--L--P--R--N--

                                                                                                                                                                          
                    120. ....|121. ....|122. ....|123. ....|124. ....|125. ....|126. ....|127. ....|128. ....|129. ....|130. ....|131. ....|132. ....|133. ....|134. ....|
prot                C--D--T--P--I--F--D--F--R--V--F--F--Q-----E--L--V--E--F--R--A--R--Q--R--R--G--S--P--R--Y--T--I--Y--L--G--F--G--Q--D--L--S--A--G--R--P--K--E--K--S--L--
human_prot          C--D--T--P--I--F--D--F--R--V--F--F--------E--L--V--E--F--R--A--R--Q--R--R--G--S--P--R--Y--T--I--Y--L--G--F--G--Q--D--L--S--A--G--R--P--K--E--K--S--L--
chimp_prot          C--D--T--P--I--F--D--F--R--V--F--F--------E--L--V--E--F--R--A--R--Q--R--R--G--S--P--R--Y--T--I--Y--L--G--F--G--Q--D--L--S--A--G--R--P--K--E--K--S--L--
macaque_prot        C--D--T--P--I--F--D--F--R--V--F--F--------E--L--V--E--F--R--A--R--Q--R--R--G--S--P--C--Y--T--I--Y--L--G--F--G--Q--D--L--S--A--R--R--P--K--E--K--S--L--
human_dna           TGTGACACCCCCATCTTCGACTTCAGAGTCTTCTTC------GAGCTGGTGGAATTCCGGGCACGGCAGCGCCGTGGCTCCCCACGCTATACCATCTACCTGGGCTTCGGGCAGGACCTGTCAGCTGGGAGGCCCAAGGAGAAGAGCCTG
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hg18                TGTGACACCCCCATCTTCGACTTCAGAGTCTTCTTCCAA---GAGCTGGTGGAATTCCGGGCACGGCAGCGCCGTGGCTCCCCACGCTATACCATCTACCTGGGCTTCGGGCAGGACCTGTCAGCTGGGAGGCCCAAGGAGAAGAGCCTG
panTro2             TGTGACACCCCCATCTTCGACTTCAGAGTCTTCTTCGGA---GAGCTGGTGGAATTCCGGGCACGGCAGCGCCGTGGCTCCCCACGCTATACCATCTACCTGGGCTTCGGGCAGGACCTGTCAGCTGGGAGGCCCAAGGAGAAGAGCCTG
rheMac2             TGCGACACCCCCATCTTTGACTTCAGAGTCTTCTTCCAA---GAGCTGGTGGAATTCCGGGCACGGCAGCGCCGTGGCTCCCCCTGCTATACCATCTACCTGGGCTTCGGGCAGGACCTGTCAGCCAGGAGGCCCAAGGAGAAGAGCCTG
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           C--D--T--P--I--F--D--F--R--V--F--F--Q-----E--L--V--E--F--R--A--R--Q--R--R--G--S--P--R--Y--T--I--Y--L--G--F--G--Q--D--L--S--A--G--R--P--K--E--K--S--L--
panTro_prot         C--D--T--P--I--F--D--F--R--V--F--F--G-----E--L--V--E--F--R--A--R--Q--R--R--G--S--P--R--Y--T--I--Y--L--G--F--G--Q--D--L--S--A--G--R--P--K--E--K--S--L--
rheMac_prot         C--D--T--P--I--F--D--F--R--V--F--F--Q-----E--L--V--E--F--R--A--R--Q--R--R--G--S--P--C--Y--T--I--Y--L--G--F--G--Q--D--L--S--A--R--R--P--K--E--K--S--L--

                                                                                                                                   H                                      
                    135. ....|136. ....|137. ....|138. ....|139. ....|140. ....|141. ....|142. ....|143. ....|144. ....|145. ....|146. ....|147. ....|148. ....|149. ....|
prot                V--L--V-----K--L--E--P--W--L--C--R--V--H--L--E--G--T--Q--R--E--G--V--S--S--L--D--S--S--S--L--S--L--C--L--S--S--A--N--S--L--Y--D--D--I--E--C--F--L--M--
human_prot          V--L--V--------L--E--P--W--L--C--R--V--H--L--E--G--T--Q--R--E--G--V--S--S--L--D--S--S--S--L--S--L--C--L--S--S--A--N--S--L--Y--D--D--I--E--C--F--L--M--
chimp_prot          V--L--V--------L--E--P--W--L--C--R--V--H--L--E--G--T--Q--R--E--G--V--S--S--L--D--S--S--S--L--S--L--C--L--S--S--T--N--S--L--Y--D--D--I--E--C--F--L--M--
macaque_prot        V--L--V--------L--E--P--W--L--C--R--V--H--L--E--G--T--Q--R--E--G--V--S--S--L--D--S--S--S--L--S--L--C--L--S--S--T--N--S--L--Y--D--D--I--E--C--L--L--M--
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hg18_prot           V--L--V--K-----L--E--P--W--L--C--R--V--H--L--E--G--T--Q--R--E--G--V--S--S--L--D--S--S--S--L--S--L--C--L--S--S--A--N--S--L--Y--D--D--I--E--C--F--L--M--
panTro_prot         V--L--V--K-----L--E--P--W--L--C--R--V--H--L--E--G--T--Q--R--E--G--V--S--S--L--D--S--S--S--L--S--L--C--L--S--S--T--N--S--L--Y--D--D--I--E--C--F--L--M--
rheMac_prot         V--L--V--K-----L--E--P--W--L--C--R--V--H--L--E--G--T--Q--R--E--G--V--S--S--L--D--S--S--S--L--S--L--C--L--S--S--T--N--S--L--Y--D--D--I--E--C--L--L--M--

                                            
                    150. ....|151. ....|152.
prot                E--L--E--Q--P--A--------
human_prot          E--L--E--Q--P-----------
chimp_prot          E--L--E--Q--P-----------
macaque_prot        E--L--E--Q--P-----------
human_dna           GAGCTGGAGCAGCCC---------
chimp_dna           GAGCTGGAGCAGCCC---------
macaque_dna         GAGCTGGAGCAGCCC---------
hg18                GAGCTGGAGCAGCCCGC---C---
panTro2             GAGCTGGAGCAGCCCGC---C---
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codon_pos           01201201201201201---2---
hg18_prot           E--L--E--Q--P--A--------
panTro_prot         E--L--E--Q--P--A--------
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