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prot M--N--S--F--F--G--T--P--A--A--S--W--C--L--L--E--S--D--V--S--S--A--P--D--K--E--A--G--R--E--R--R--A--L--S--V--Q--Q--R--G--G--P--A--W--S--G--S--L--E--W--
human_prot M--N--S--F--F--G--T--P--A--A--S--W--C--L--L--E--S--D--V--S--S--A--P--D--K--E--A--G--R--E--R--R--A--L--S--V--Q--Q--R--G--G--P--A--W--S--G--S--L--E--W--
chimp_prot M--N--S--F--F--G--T--P--A--A--S--W--C--L--L--E--S--D--V--S--S--A--P--D--K--E--A--G--R--E--R--R--A--L--S--V--Q--Q--R--G--G--A--A--W--S--G--S--L--E--W--
macaque_prot M--N--S--F--F--G--T--P--A--A--S--W--C--L--L--E--S--D--V--L--S-----R--D--R--E--A--G--S--E--R--R--A--L--S--A--L--H--R--G--G--A--A--W--S--G--------------
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macaque_dna ATGAATAGTTTCTTCGGAACCCCAGCGGCCAGCTGGTGCCTCCTGGAGAGTGACGTCTTATCTTAACGGGACAGGGAGGCGGGGAGCGAGCGCAGAGCACTCAGCGCCCTGCACCGCGGCGGGGCAGCCTGGAGCGGA------------
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codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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panTro_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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prot S--R--Q--S--A--G--D--R--R--R--L--G--L--S--R--Q--T--A--K--S--S--W--S--R--S--R--D--R--T--C--C--C--R--R--A--W--W--I--L--V--P--A--A--D--R--A--R--R--E--R--
human_prot S--R--Q--S--A--G--D--R--R--R--L--G--L--S--R--Q--T--A--K--S--S--W--S--R--S--R--D--R--T--C--C--C--R--R--A--W--W--I--L--V--P--A--A--D--R--A--R--R-----R--
chimp_prot S--R--Q--S--A--G--D--R--R--R--L--G--L--S--R--Q--T--A--K--S--S--W--S--R--S--R--D--R--T--C--C--C--R--R--A--W--W--I--L--V--P--A--A--D--R--A--R--R-----R--
macaque_prot ---R--E--P--E--A--D--R--R--L--L--G--L--S--R--Q--T--A--K--S--S--W--S--Q--S--R--D--R--T--C--C--C--G--P--A--W--W--I--L--V--P--A--A--D--R--A--R--R-----R--
human_dna AGCAGGCAGTCCGCGGGGGACAGACGTCGGCTGGGATTGAGCCGGCAGACTGCGAAAAGTAGCTGGAGCCGGAGCAGGGACAGAACCTGTTGCTGCAGACGGGCTTGGTGGATTCTGGTTCCTGCCGCCGACAGGGCTCGCCGG---AGG
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hg18 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
panTro2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
rheMac2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
codon_pos ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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rheMac_prot ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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prot F--I--M--N--E--K--W--D--T--N--S--S--E--N--W--H--P--I--W--N--V--N--D--T--K--H--H--L--Y--S--D--I--N--I--T--Y--V--N--Y--Y--L--H--Q--P--Q--V--A--A--I--F--
human_prot F--I--M--N--E--K--W--D--T--N--S--S--E--N--W--H--P--I--W--N--V--N--D--T--K--H--H--L--Y--S--D--I--N--I--T--Y--V--N--Y--Y--L--H--Q--P--Q--V--A--A--I--F--
chimp_prot F--I--M--N--E--K--W--D--T--N--S--S--E--N--W--H--P--I--W--N--V--N--D--T--K--H--H--L--Y--S--D--I--N--I--T--Y--V--N--Y--Y--L--H--Q--P--Q--V--A--A--I--F--
macaque_prot F--I--M--K--E--K--W--D--T--N--S--S--G--N--W--H--L--I--W--S--V--N--D--T--K--D--H--L--H--S--D--I--N--I--T--Y--V--N--Y--Y--L--H--Q--P--R--V--A--A--I--F--
human_dna TTCATCATGAATGAGAAATGGGACACAAACTCTTCAGAAAACTGGCATCCCATCTGGAATGTCAATGACACAAAGCATCATCTGTACTCAGATATTAATATTACCTATGTGAACTACTATCTTCACCAGCCTCAAGTGGCAGCAATCTTC
chimp_dna TTCATCATGAATGAGAAATGGGACACAAACTCTTCAGAAAACTGGCATCCCATCTGGAATGTCAATGACACAAAGCATCATCTGTACTCAGATATTAATATTACCTATGTGAACTACTATCTTCACCAGCCTCAAGTGGCAGCAATCTTC
macaque_dna TTCATCATGAAGGAGAAATGGGACACAAACTCTTCAGGAAACTGGCATCTCATCTGGAGTGTCAATGACACAAAGGATCATCTGCACTCAGATATTAATATTACCTATGTGAACTACTATCTTCACCAGCCTCGAGTGGCAGCAATCTTC
hg18 ------ATGAATGAGAAATGGGACACAAACTCTTCAGAAAACTGGCATCCCATCTGGAATGTCAATGACACAAAGCATCATCTGTACTCAGATATTAATATTACCTATGTGAACTACTATCTTCACCAGCCTCAAGTGGCAGCAATCTTC
panTro2 ------ATGAATGAGAAATGGGACACAAACTCTTCAGAAAACTGGCATCCCATCTGGAATGTCAATGACACAAAGCATCATCTGTACTCAGATATTAATATTACCTATGTGAACTACTATCTTCACCAGCCTCAAGTGGCAGCAATCTTC
rheMac2 ------ATGAAGGAGAAATGGGACACAAACTCTTCAGGAAACTGGCATCTCATCTGGAGTGTCAATGACACAAAGGATCATCTGCACTCAGATATTAATATTACCTATGTGAACTACTATCTTCACCAGCCTCGAGTGGCAGCAATCTTC
codon_pos ------012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot ------M--N--E--K--W--D--T--N--S--S--E--N--W--H--P--I--W--N--V--N--D--T--K--H--H--L--Y--S--D--I--N--I--T--Y--V--N--Y--Y--L--H--Q--P--Q--V--A--A--I--F--
panTro_prot ------M--N--E--K--W--D--T--N--S--S--E--N--W--H--P--I--W--N--V--N--D--T--K--H--H--L--Y--S--D--I--N--I--T--Y--V--N--Y--Y--L--H--Q--P--Q--V--A--A--I--F--
rheMac_prot ------M--K--E--K--W--D--T--N--S--S--G--N--W--H--L--I--W--S--V--N--D--T--K--D--H--L--H--S--D--I--N--I--T--Y--V--N--Y--Y--L--H--Q--P--R--V--A--A--I--F--
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prot I--I--S--Y--F--L--I--F--F--L--C--M--M--G--N--T--V--V--C--F--I--V--M--R--N--K--H--M--H--T--V--T--N--L--F--I--L--N--L--A--I--S--D--L--L--V--G--I--F--C--
human_prot I--I--S--Y--F--L--I--F--F--L--C--M--M--G--N--T--V--V--C--F--I--V--M--R--N--K--H--M--H--T--V--T--N--L--F--I--L--N--L--A--I--S--D--L--L--V--G--I--F--C--
chimp_prot I--I--S--Y--F--L--I--L--F--L--C--M--M--G--N--T--V--V--C--F--I--V--M--R--N--K--H--M--H--T--V--T--N--L--F--I--L--N--L--A--I--S--D--L--L--V--G--I--F--C--
macaque_prot I--I--S--Y--F--L--I--F--F--L--C--M--V--G--N--T--V--V--C--F--I--V--M--R--N--K--H--M--H--T--V--T--N--L--F--I--L--N--L--A--I--S--D--L--L--V--G--I--F--C--
human_dna ATTATTTCCTACTTTCTGATCTTCTTTTTGTGCATGATGGGAAATACTGTGGTTTGCTTTATTGTAATGAGGAACAAACATATGCACACAGTCACTAATCTCTTCATCTTAAACCTGGCCATAAGTGATTTACTAGTTGGCATATTCTGC
chimp_dna ATTATTTCCTACTTTCTGATCCTCTTTTTGTGCATGATGGGAAATACTGTGGTTTGCTTTATTGTAATGAGGAACAAACATATGCACACAGTCACTAATCTCTTCATCTTAAACCTGGCCATAAGTGATTTACTAGTTGGCATATTCTGC
macaque_dna ATTATTTCCTACTTTCTGATCTTCTTTTTGTGCATGGTGGGAAATACCGTGGTTTGCTTTATTGTAATGAGAAACAAACATATGCACACAGTCACTAATCTCTTCATCTTAAACCTGGCCATAAGTGATTTACTAGTTGGCATATTCTGC
hg18 ATTATTTCCTACTTTCTGATCTTCTTTTTGTGCATGATGGGAAATACTGTGGTTTGCTTTATTGTAATGAGGAACAAACATATGCACACAGTCACTAATCTCTTCATCTTAAACCTGGCCATAAGTGATTTACTAGTTGGCATATTCTGC
panTro2 ATTATTTCCTACTTTCTGATCTTCTTTTTGTGCATGATGGGAAATACTGTGGTTTGCTTTATTGTAATGAGGAACAAACATATGCACACAGTCACTAATCTCTTCATCTTAAACCTGGCCATAAGTGATTTACTAGTTGGCATATTCTGC
rheMac2 ATTATTTCCTACTTTCTGATCTTCTTTTTGTGCATGGTGGGAAATACTGTGGTTTGCTTTATTGTAATGAGAAACAAACATATGCACACAGTCACTAATCTCTTCATCTTAAACCTGGCCATAAGTGATTTACTAGTTGGCATATTCTGC
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hg18_prot I--I--S--Y--F--L--I--F--F--L--C--M--M--G--N--T--V--V--C--F--I--V--M--R--N--K--H--M--H--T--V--T--N--L--F--I--L--N--L--A--I--S--D--L--L--V--G--I--F--C--
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rheMac_prot I--I--S--Y--F--L--I--F--F--L--C--M--V--G--N--T--V--V--C--F--I--V--M--R--N--K--H--M--H--T--V--T--N--L--F--I--L--N--L--A--I--S--D--L--L--V--G--I--F--C--
H
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chimp_prot M--P--I--T--L--L--D--N--I--I--------G--W--P--F--G--N--T--M--C--K--I--S--G--L--V--Q--G--I--S--V--A--A--S--V--F--T--L--V--A--I--A--V--------R--F--R--C--
macaque_prot M--P--I--T--L--L--D--N--I--I--------G--W--P--F--G--N--T--M--C--K--I--S--G--L--V--Q--G--I--S--V--A--A--S--V--F--T--L--V--A--I--A--V--------R--F--R--C--
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macaque_dna ATGCCTATAACACTGCTGGACAATATTAT---A---GGATGGCCATTTGGAAACACGATGTGCAAGATCAGTGGACTGGTCCAGGGAATATCTGTTGCAGCTTCAGTCTTTACATTAGTTGCAATTGCTGTA------AGGTTCCGGTGT
hg18 ATGCCTATAACACTGCTGGACAATATTATAGCA---GGATGGCCATTTGGAAACACGATGTGCAAGATCAGTGGATTGGTCCAGGGAATATCTGTCGCAGCTTCAGTCTTTACGTTAGTTGCAATTGCTGTAGAT---AGGTTCCAGTGT
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hg18_prot M--P--I--T--L--L--D--N--I--I--A-----G--W--P--F--G--N--T--M--C--K--I--S--G--L--V--Q--G--I--S--V--A--A--S--V--F--T--L--V--A--I--A--V--D-----R--F--Q--C--
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prot V--V--Y--P--F--K--P--K--L--T--I--K--T--A--F--V--I--I--M--I--I--W--V--L--A--I--T--I--M--S--P--S--A--V--M--L--H--V--Q--E--E--K--Y--Y--R--V--R--L--N--S--
human_prot V--V--Y--P--F--K--P--K--L--T--I--K--T--A--F--V--I--I--M--I--I--W--V--L--A--I--T--I--M--S--P--S--A--V--M--L--H--V--Q--E--E--K--Y--Y--R--V--R--L--N--S--
chimp_prot V--V--Y--P--F--K--P--K--L--T--V--K--T--A--F--V--I--I--M--I--I--W--V--L--A--I--T--I--M--S--P--S--A--V--M--L--H--V--Q--E--E--K--Y--Y--R--V--R--L--N--S--
macaque_prot V--V--Y--P--F--K--P--K--L--T--I--K--T--A--F--V--I--I--M--I--I--W--V--L--A--I--T--I--M--S--P--S--A--V--M--L--H--V--Q--E--E--K--Y--Y--R--V--R--L--N--S--
human_dna GTGGTCTACCCTTTTAAACCAAAGCTCACTATCAAGACAGCGTTTGTCATTATTATGATCATCTGGGTCCTAGCCATCACCATTATGTCTCCATCTGCAGTAATGTTACATGTGCAAGAAGAAAAATATTACCGAGTGAGACTCAACTCC
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panTro2 GTGGTCTACCCTTTTAAACCAAAGCTCACTGTAAAGACAGCGTTTGTCATTATTATGATCATCTGGGTCCTAGCCATCACCATTATGTCTCCATCTGCAGTAATGTTACATGTGCAAGAAGAAAAATATTACCGAGTGAGACTCAACTCC
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hg18_prot V--V--Y--P--F--K--P--K--L--T--I--K--T--A--F--V--I--I--M--I--I--W--V--L--A--I--T--I--M--S--P--S--A--V--M--L--H--V--Q--E--E--K--Y--Y--R--V--R--L--N--S--
panTro_prot V--V--Y--P--F--K--P--K--L--T--V--K--T--A--F--V--I--I--M--I--I--W--V--L--A--I--T--I--M--S--P--S--A--V--M--L--H--V--Q--E--E--K--Y--Y--R--V--R--L--N--S--
rheMac_prot V--V--Y--P--F--K--P--K--L--T--I--K--T--A--F--V--I--I--M--I--I--W--V--L--A--I--T--I--M--S--P--S--A--V--M--L--H--V--Q--E--E--K--Y--Y--R--V--R--L--N--S--
(C)
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prot Q--N--K--T--S--P--V--Y--W--C--R--E--D--W--P--N--Q--E--M--R--K--I--Y--T--T--V--L--F--A--N--I--Y--L--A--P--L--S--L--I--V--I--M--Y--G--R--I--G--I--S--L--
human_prot Q--N--K--T--S--P--V--Y--W--C--R--E--D--W--P--N--Q--E--M--R--K--I--Y--T--T--V--L--F--A--N--I--Y--L--A--P--L--S--L--I--V--I--M--Y--G--R--I--G--I--S--L--
chimp_prot Q--N--K--T--S--P--V--Y--W--C--R--E--D--W--P--N--Q--E--M--R--K--I--Y--T--T--V--L--F--A--N--I--Y--L--A--P--L--S--L--I--V--I--M--Y--G--R--I--G--I--S--L--
macaque_prot Q--N--E--T--S--P--V--Y--W--C--R--E--D--W--P--N--Q--E--M--R--K--I--Y--T--T--V--L--F--A--N--I--Y--L--A--P--L--S--L--I--V--V--M--Y--G--R--I--G--V--S--L--
human_dna CAGAATAAAACCAGTCCAGTCTACTGGTGCCGGGAAGACTGGCCAAATCAGGAAATGAGGAAGATCTACACCACTGTGCTGTTTGCCAACATCTACCTGGCTCCCCTCTCCCTCATTGTCATCATGTATGGAAGGATTGGAATTTCACTC
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H (C)
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C H
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