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H
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C
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prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--R-----G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R--
human_prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--------G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R--
chimp_prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--I--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--------G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R--
macaque_prot G--F--F--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--T--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--------G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R--
human_dna GGTTTTCTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCTCTGGCCTCACCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCT------GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCAAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA
chimp_dna GGTTTTCTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCTCTGGCCTCATCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCT------GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCAAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA
macaque_dna GGCTTCTTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCACTGGCCTCACCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCT------GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCCAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA
hg18 GGTTTTCTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCTCTGGCCTCACCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCTCGA---GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCAAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA
panTro2 GGTTTTCTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCTCTGGCCTCATCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCTCGA---GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCAAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA
rheMac2 GGCTTCTTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCACTGGCCTCACCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCTCGA---GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCCAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA
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hg18_prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--R-----G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R--
panTro_prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--I--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--R-----G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R--
rheMac_prot G--F--F--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--T--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--R-----G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R--
(C)
105. ....|106. ....|107. ....|108. ....|109. ....|110. ....|111. ....|112. ....|113. ....|114. ....|115. ....|116. ....|117. ....|118. ....|119. ....|
prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--N-----A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--L-----L--L--G--A--L--
human_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--------A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--------L--L--G--A--L--
chimp_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--------A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--------L--L--G--A--L--
macaque_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--------A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--------L--L--G--A--L--
human_dna TACCTGGACCTGAGCAAGAATCCTGGGCTCCTCGCCACGGATGAGGCC------GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAACGCCCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGAC------CTTCTCGGTGCCCTG
chimp_dna TACCTGGACCTGAGCAAGAATCCTGGGCTCCTCGCCACGGATGAGGCC------GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAACGCCCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGAT------CTTCTCGGTGCCCTG
macaque_dna TACCTGGACCTGAGCAAGAACCCTGGGCTCCTCGCCACGGACGAGGCC------GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAATGCTCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGAC------CTTCTCGGTGCCCTA
hg18 TACCTGGACCTGAGCAAGAATCCTGGGCTCCTCGCCACGGATGAGGCCAAT---GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAACGCCCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGACTTG---CTTCTCGGTGCCCTG
panTro2 TACCTGGACCTGAGCAAGAATCCTGGGCTCCTCGCCACGGATGAGGCCAAT---GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAACGCCCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGATTTG---CTTCTCGGTGCCCTG
rheMac2 TACCTGGACCTGAGCAAGAACCCTGGGCTCCTCGCCACGGACGAGGCCAAT---GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAATGCTCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGACTTG---CTTCTCGGTGCCCTA
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hg18_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--N-----A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--L-----L--L--G--A--L--
panTro_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--N-----A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--L-----L--L--G--A--L--
rheMac_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--N-----A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--L-----L--L--G--A--L--
(*)(*) (H)
120. ....|121. ....|122. ....|123. ....|124. ....|125. ....|126. ....|127. ....|128. ....|129. ....|130. ....|131. ....|132. ....|133. ....|134. ....|
prot L--H--G--C--C--S--H--L--T--Y--L--N--L--A--R--N--S--C--S-----H--R--K--G--R--E--A--P--P--A--F--K--Q--F--F--S--S--A--Y--T--L--S--H--V--N--L--S--A--T--K--
human_prot L--H--G--C--C--S--H--L--T--Y--L--N--L--A--R--N--S--C--S--------R--K--G--R--E--A--P--P--A--F--K--Q--F--F--S--S--A--Y--T--L--S--H--V--N--L--S--A--T--K--
chimp_prot L--H--G--C--C--S--H--L--T--Y--L--N--L--A--R--N--S--C--S--------R--K--G--R--E--A--P--P--A--F--K--Q--F--F--S--S--A--Y--T--L--S--H--V--N--L--S--A--T--K--
macaque_prot L--H--G--C--C--S--H--L--T--Y--L--N--L--A--R--N--S--C--S--------R--K--G--R--E--S--P--P--A--F--K--Q--F--F--S--S--A--Y--T--L--S--H--V--N--L--S--A--T--K--
human_dna CTCCACGGCTGCTGCTCCCACCTCACCTACCTCAACCTGGCTCGCAACAGCTGCTC---C---AGGAAGGGTCGAGAGGCCCCGCCGGCCTTCAAGCAGTTCTTCAGCAGCGCCTACACACTGAGCCACGTCAATCTGTCGGCCACAAAG
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hg18_prot L--H--G--C--C--S--H--L--T--Y--L--N--L--A--R--N--S--C--S--H-----R--K--G--R--E--A--P--P--A--F--K--Q--F--F--S--S--A--Y--T--L--S--H--V--N--L--S--A--T--K--
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(H) (H)
135. ....|136. ....|137. ....|138. ....|139. ....|140. ....|141. ....|142. ....|143. ....|144. ....|145. ....|146. ....|147. ....|148. ....|149. ....|
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chimp_prot L--P--L--E--A--------R--A--L--L--Q--G--L--S--L--N--S--H--L--S--D--L--H--L--D--L--S--S--C--------L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C--
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panTro2 CTGCCCCTGGAGGCCCTC---AGGGCGCTGCTTCAGGGCCTCTCCCTCAACAGTCACCTCAGTGACCTGCACCTGGATCTCAGCAGCTGTGAG---CTCCGCTCAGCGGGAGCCCAAGCCTTGCAGGAGCAGCTGGGAGCTGTCACCTGT
rheMac2 CTGCCCCTGGANNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---CTCCGCTCAGCGGGAGCCCAAGCCTTGCAGGAGCAGCTGGGAGCTGTCACCTGT
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rheMac_prot L--P--L--_--_--_-----_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_-----L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C--
(C)
150. ....|151. ....|152. ....|153. ....|154. ....|155. ....|156. ....|157. ....|158. ....|159. ....|160. ....|161. ....|162. ....|163. ....|164. ....|
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human_prot V--G--S--L--D--L--S--D--------G--F--D--S--D--L--L--T--L--V--P--A--L--G--K--N--K--S--L--K--H--L--F--L--G--K--N--F--N--V--------K--------T--L--E--E--I--
chimp_prot V--G--S--L--D--L--S--D--------G--F--D--S--D--L--L--T--L--V--P--A--L--G--K--N--K--S--L--K--H--L--F--L--G--K--N--F--N--V--------K--------T--L--E--E--I--
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human_dna GTAGGCAGCCTGGATCTGTCAGAC------GGGTTCGACTCGGACCTCCTGACACTGGTGCCTGCACTTGGCAAGAACAAGTCCCTCAAGCACCTGTTTTTGGGCAAGAACTTCAATGT------CAAG------ACCCTGGAGGAGATC
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165. ....|166. ....|167. ....|168. ....|169. ....|170. ....|171. ....|172. ....|173. ....|174. ....|175. ....|176. ....|177. ....|178. ....|179. ....|
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180. ....|181. ....|182. ....|183. ....|184. ....|185. ....|186. ....|187. ....|188. ....|189. ....|190. ....|191. ....|192. ....|193. ....|194. ....|
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(H)
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H
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(H)
270. ....|271. ....|272. ....|273. ....|274. ....|275. ....|276. ....|277. ....|278. ....|279. ....|280. ....|281. ....|282. ....|283. ....|284. ....|
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macaque_prot G--C--P--G--Q--G--Q--D--L--S--S--R--G--R--G--R--N--H--D--H--E--E--T--T--D--D--E--L--G--T--N--------D--T--M--A--I--K--K--Q--K--R--C--R--K--I--R--P--V--
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285. ....|286. ....|287. ....|288. ....|289. ....|290. ....|291. ....|292. ....|293. ....|294. ....|295. ....|296. ....|297. ....|298. ....|299. ....|
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chimp_prot S--A--F--------------G--S--P--Q--D--M--E--S--Q--L--G--N--L--G--I--P--P--G--W--F--S--G--L--G--G--S--Q--P--T--A--S--G--S--W--E--G--L--S--E--L--P--T--H--
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H (C)
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(C) (H)
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macaque_prot G--D--R--G--P--G--S--P--T--T--G--L--L--L--P--P--P--P--P--P--P--P--T--Q--E--S--P--P--S--P--D--P--P--S--L--G--N--N--S--S--P--C--W--S--P--E--E--E--S--G--
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(H)
345. ....|346. ....|347. ....|348. ....|349. ....|350. ....|351. ....|352. ....|353. ....|354. ....|355. ....|356. ....|357. ....|358. ....|359. ....|
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C
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macaque_prot A--K--G--W--S--F--D--G--K--R--------G--------P--D--Q--E--G--S--T--Q--A--W--Q--K--R--R--S--S--D--D--------G--P--G--S--W--K--P--P--P--P--P--Q--S--T--K--
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(H) H
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