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prot                M--L--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
human_prot          ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
chimp_prot          ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
macaque_prot        ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
human_dna           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
chimp_dna           ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
macaque_dna         ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
hg18                ATGGCCACCCAGACCTGCACCCCTACCTTCTCCACTGGGTCTATCAAGGGCCTCTGTGGCACAGCAGGCGGCATCTCTCGGGTGTCCTCCATCCGTTCTGTGGGCTCCTGCAGGGTCCCCAGTCTCGCCGGTGCTGCAGGGTACATCTCT
panTro2             ATGGCCACCCAGACCTGCACCCCGACCTTCTCCGTTGGGTCTATCAAGGGCCTCTGTGGCACAGCAGGCGGCATCTCTCGGGTGTCCTCCATCCACTCTGTGGGCTCCTGCAGGGTCCCCAGTCTCGCCGGTGCTGCAGGGTACATCTCT
rheMac2             ATGGCCACCCAGACCTGCACCCCGACCTTCTCCACTGGGTCTGTCAAGGGCCTCTGTGGCACAGCAGGCGGCATCTCTCGGGTGTCCTCCATCCACTCTGTGGGCTCCTGCAGGGTCCCCAGTCTCGCCGGTGCCGCGGGGTACATCTCT
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           M--A--T--Q--T--C--T--P--T--F--S--T--G--S--I--K--G--L--C--G--T--A--G--G--I--S--R--V--S--S--I--R--S--V--G--S--C--R--V--P--S--L--A--G--A--A--G--Y--I--S--
panTro_prot         M--A--T--Q--T--C--T--P--T--F--S--V--G--S--I--K--G--L--C--G--T--A--G--G--I--S--R--V--S--S--I--H--S--V--G--S--C--R--V--P--S--L--A--G--A--A--G--Y--I--S--
rheMac_prot         M--A--T--Q--T--C--T--P--T--F--S--T--G--S--V--K--G--L--C--G--T--A--G--G--I--S--R--V--S--S--I--H--S--V--G--S--C--R--V--P--S--L--A--G--A--A--G--Y--I--S--

                                   C                                                  H                                                                                   
                    15.. ....|16.. ....|17.. ....|18.. ....|19.. ....|20.. ....|21.. ....|22.. ....|23.. ....|24.. ....|25.. ....|26.. ....|27.. ....|28.. ....|29.. ....|
prot                ------------R--S--G--L--S--G--L--G--S--C--L--P--G--S--Y--L--S--S--E--C--H--T--S--G--F--V--G--S--G--G--W--F--C--E--G--S--F--N--G--S--E--K--E--T--M--Q--
human_prot          ------------R--S--G--L--S--G--L--G--S--C--L--P--G--S--Y--L--S--S--E--C--H--T--S--G--F--V--G--S--G--G--W--F--C--E--G--S--F--N--G--S--E--K--E--T--M--Q--
chimp_prot          ------------R--L--G--L--S--G--L--G--S--C--L--P--G--S--Y--L--S--S--G--C--H--T--S--G--F--V--G--S--G--G--W--F--C--E--G--S--F--N--G--S--E--K--E--T--M--Q--
macaque_prot        ------------R--S--G--L--S--G--L--G--S--C--L--P--G--S--Y--L--S--S--G--C--H--S--S--G--F--V--G--S--G--G--W--F--C--E--G--S--F--N--G--S--E--K--E--T--M--R--
human_dna           ------------AGGTCGGGCCTCTCTGGCCTTGGGAGCTGCTTGCCTGGCTCCTACCTGTCTTCTGAGTGCCACACCTCTGGCTTTGTGGGGAGCGGGGGCTGGTTCTGCGAGGGCTCCTTCAACGGCAGCGAGAAGGAGACTATGCAG
chimp_dna           ------------AGGCTGGGCCTCTCTGGCCTTGGGAGCTGCTTGCCTGGCTCCTACCTGTCTTCTGGGTGCCACACCTCTGGCTTTGTGGGGAGCGGGGGCTGGTTCTGCGAGGGCTCCTTCAACGGCAGCGAGAAGGAGACTATGCAG
macaque_dna         ------------AGGTCGGGCCTCTCTGGCCTTGGGAGTTGCTTGCCTGGCTCCTACCTGTCTTCTGGGTGCCACTCCTCTGGCTTTGTGGGGAGCGGGGGCTGGTTCTGCGAGGGCTCCTTCAATGGCAGCGAGAAGGAGACCATGCGG
hg18                TCTGCT------AGGTCGGGCCTCTCTGGCCTTGGGAGCTGCTTGCCTGGCTCCTACCTGTCTTCTGAGTGCCACACCTCTGGCTTTGTGGGGAGCGGGGGCTGGTTCTGCGAGGGCTCCTTCAACGGCAGCGAGAAGGAGACTATGCAG
panTro2             TCTGCT------AGGCTGGGCCTCTCTGGCCTTGGGAGCTGCTTGCCTGGCTCCTACCTGTCTTCTGGGTGCCACACCTCTGGCTTTGTGGGGAGCGGGGGCTGGTTCTGCGAGGGCTCCTTCAACGGCAGCGAGAAGGAGACTATGCAG
rheMac2             TCTGCT------AGGTCGGGCCTCTCTGGCCTTGGGAGTTGCTTGCCTGGCTCCTACCTGTCTTCTGGGTGCCACTCCTCTGGCTTTGTGGGGAGCGGGGGCTGGTTCTGCGAGGGCTCCTTCAATGGCAGCGAGAAGGAGACCATGCAG
codon_pos           012012------012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           S--A--------R--S--G--L--S--G--L--G--S--C--L--P--G--S--Y--L--S--S--E--C--H--T--S--G--F--V--G--S--G--G--W--F--C--E--G--S--F--N--G--S--E--K--E--T--M--Q--
panTro_prot         S--A--------R--L--G--L--S--G--L--G--S--C--L--P--G--S--Y--L--S--S--G--C--H--T--S--G--F--V--G--S--G--G--W--F--C--E--G--S--F--N--G--S--E--K--E--T--M--Q--
rheMac_prot         S--A--------R--S--G--L--S--G--L--G--S--C--L--P--G--S--Y--L--S--S--G--C--H--S--S--G--F--V--G--S--G--G--W--F--C--E--G--S--F--N--G--S--E--K--E--T--M--Q--

                                                                                                     H              H                                                     
                    30.. ....|31.. ....|32.. ....|33.. ....|34.. ....|35.. ....|36.. ....|37.. ....|38.. ....|39.. ....|40.. ....|41.. ....|42.. ....|43.. ....|44.. ....|
prot                F--L--N--D--R--L--A--N--Y--L--E--K--V--R--Q--L--E--R--E--N--A--E--L--E--S--R--I--Q--E--W--Y--E--F--Q--I--P--Y--I--C--P--D--Y--Q--S--Y--F--K--T--I--E--
human_prot          F--L--N--D--R--L--A--N--Y--L--E--K--V--R--Q--L--E--R--E--N--A--E--L--E--S--R--I--Q--E--W--Y--E--F--Q--I--P--Y--I--C--P--D--Y--Q--S--Y--F--K--T--I--E--
chimp_prot          F--L--N--D--R--L--A--N--Y--L--E--K--V--R--Q--L--E--R--E--N--A--E--L--E--S--R--I--R--E--W--Y--E--S--Q--I--P--Y--I--C--P--D--Y--Q--S--Y--F--K--T--I--E--
macaque_prot        F--L--N--D--R--L--A--N--Y--L--E--K--V--R--Q--L--E--R--E--N--A--E--L--E--S--R--I--R--E--W--Y--E--S--Q--I--P--Y--I--C--P--D--Y--Q--S--Y--F--K--T--I--E--
human_dna           TTCCTGAACGACCGCCTGGCCAACTACCTGGAGAAGGTGCGTCAGCTGGAGCGGGAGAACGCGGAGCTGGAGAGCCGCATCCAGGAGTGGTACGAGTTTCAGATCCCATACATCTGCCCAGACTACCAGTCCTACTTCAAGACCATCGAA
chimp_dna           TTCCTGAACGACCGCCTGGCCAACTACCTGGAGAAGGTGCGTCAGCTGGAGCGGGAGAACGCGGAGCTGGAGAGCCGCATCCGGGAGTGGTACGAGTCTCAGATCCCATACATCTGCCCAGACTACCAGTCCTACTTCAAGACCATCGAA
macaque_dna         TTCCTGAATGACCGCCTGGCCAACTACCTGGAGAAGGTGCGTCAGCTGGAGCGGGAGAACGCGGAGCTGGAGAGCCGCATCCGGGAGTGGTACGAGTCTCAGATCCCATACATCTGCCCAGACTACCAGTCCTACTTCAAGACCATCGAA
hg18                TTCCTGAACGACCGCCTGGCCAACTACCTGGAGAAGGTGCGTCAGCTGGAGCGGGAGAACGCGGAGCTGGAGAGCCGCATCCAGGAGTGGTACGAGTTTCAGATCCCATACATCTGCCCAGACTACCAGTCCTACTTCAAGACCATCGAA
panTro2             TTCCTGAACGACCGCCTGGCCAACTACCTGGAGAAGGTGCGTCAGCTGGAGCGGGAGAACGCGGAGCTGGAGAGCCGCATCCGGGAGTGGTACGAGTCTCAGATCCCATACATCTGCCCAGACTACCAGTCCTACTTCAAGACCATCGAA
rheMac2             TTCCTGAATGACCGCCTGGCCAACTACCTGGAGAAGGTGCGTCAGCTGGAGCGGGAGAACGCGGAGCTGGAGAGCCGCATCCGGGAGTGGTACGAGTCTCAGATCCCATACATCTGCCCAGACTACCAGTCCTACTTCAAGACCATCGAA
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           F--L--N--D--R--L--A--N--Y--L--E--K--V--R--Q--L--E--R--E--N--A--E--L--E--S--R--I--Q--E--W--Y--E--F--Q--I--P--Y--I--C--P--D--Y--Q--S--Y--F--K--T--I--E--
panTro_prot         F--L--N--D--R--L--A--N--Y--L--E--K--V--R--Q--L--E--R--E--N--A--E--L--E--S--R--I--R--E--W--Y--E--S--Q--I--P--Y--I--C--P--D--Y--Q--S--Y--F--K--T--I--E--
rheMac_prot         F--L--N--D--R--L--A--N--Y--L--E--K--V--R--Q--L--E--R--E--N--A--E--L--E--S--R--I--R--E--W--Y--E--S--Q--I--P--Y--I--C--P--D--Y--Q--S--Y--F--K--T--I--E--

                                                                                                  (H)                                                                     
                    45.. ....|46.. ....|47.. ....|48.. ....|49.. ....|50.. ....|51.. ....|52.. ....|53.. ....|54.. ....|55.. ....|56.. ....|57.. ....|58.. ....|59.. ....|
prot                D--F--Q--Q-----K--I--L--L--T--K--S--E--N--A--R--L--V--L--Q--I--D--N--A--K--L--A--A--D--D--F--R--------T--K--Y--E--T--E--L--S--L--R--Q--L--V--E--A--D--
human_prot          D--F--Q--Q--------I--L--L--T--K--S--E--N--A--R--L--V--L--Q--I--D--N--A--K--L--A--A--D--D--F--R--------------Y--E--T--E--L--S--L--R--Q--L--V--E--A--D--
chimp_prot          D--F--Q--Q--------I--L--L--T--K--S--E--N--A--R--L--V--L--Q--I--D--N--A--K--L--A--A--D--D--F--R--------------Y--E--T--E--L--S--L--R--Q--L--V--E--A--D--
macaque_prot        D--F--Q--Q--------I--L--L--T--K--S--E--N--A--R--L--V--L--Q--I--D--N--A--K--L--A--A--D--D--F--R--------------Y--E--T--E--L--S--L--R--Q--L--V--E--A--D--
human_dna           GATTTCCAGC---AG---ATCCTGCTGACTAAGTCTGAGAATGCCAGGCTGGTCCTGCAGATTGATAATGCCAAGCTGGCTGCTGACGACTTCCG------G------TATGAGACAGAGCTGTCTCTGCGGCAGCTAGTGGAGGCCGAC
chimp_dna           GATTTCCAGC---AG---ATCCTGCTGACTAAGTCTGAGAATGCCAGGCTGGTCCTGCAGATTGATAATGCCAAGCTGGCCGCTGACGACTTCCG------G------TATGAGACAGAGCTGTCTCTGCGGCAGCTAGTGGAGGCCGAC
macaque_dna         GATTTCCAGC---AG---ATCCTGCTGACTAAGTCTGAGAATGCCAGGCTGGTCCTGCAGATTGATAATGCCAAGCTGGCCGCTGACGACTTCCG------G------TACGAGACAGAGCTGTCCCTGCGGCAGCTGGTGGAGGCCGAC
hg18                GATTTCCAGCAGAAG---ATCCTGCTGACTAAGTCTGAGAATGCCAGGCTGGTCCTGCAGATTGATAATGCCAAGCTGGCTGCTGACGACTTCCGGACCAAG------TATGAGACAGAGCTGTCTCTGCGGCAGCTAGTGGAGGCCGAC
panTro2             GATTTCCAGCAGAAG---ATCCTGCTGACTAAGTCTGAGAATGCCAGGCTGGTCCTGCAGATTGATAATGCCAAGCTGGCCGCTGACGACTTCCGGACCAAG------TATGAGACAGAGCTGTCTCTGCGGCAGCTAGTGGAGGCCGAC
rheMac2             GATTTCCAGCAGAAG---ATCCTGCTGACTAAGTCTGAGAATGCCAGGCTGGTCCTGCAGATTGATAATGCCAAGCTGGCCGCTGACGACTTCCGGACCAAG------TACGAGACAGAGCTGTCCCTGCGGCAGCTGGTGGAGGCCGAC
codon_pos           012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012------012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           D--F--Q--Q--K-----I--L--L--T--K--S--E--N--A--R--L--V--L--Q--I--D--N--A--K--L--A--A--D--D--F--R--T--K--------Y--E--T--E--L--S--L--R--Q--L--V--E--A--D--
panTro_prot         D--F--Q--Q--K-----I--L--L--T--K--S--E--N--A--R--L--V--L--Q--I--D--N--A--K--L--A--A--D--D--F--R--T--K--------Y--E--T--E--L--S--L--R--Q--L--V--E--A--D--
rheMac_prot         D--F--Q--Q--K-----I--L--L--T--K--S--E--N--A--R--L--V--L--Q--I--D--N--A--K--L--A--A--D--D--F--R--T--K--------Y--E--T--E--L--S--L--R--Q--L--V--E--A--D--

                                                                                                                                                                          
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prot                I--N--G--L--R--R--I--L--D--E--L--T--L--C--K--A--D--L--E--A--Q--V--E--S--L--K--E--E--L--M--C--L--K--K--N--H-----E--E--E--V--S--V--L--R--C--Q--L--G--D--
human_prot          I--N--G--L--R--R--I--L--D--E--L--T--L--C--K--A--D--L--E--A--Q--V--E--S--L--K--E--E--L--M--C--L--K--K--N--H-----E-----E--V--S--V--L--R--C--Q--L--G--D--
chimp_prot          I--N--G--L--R--R--I--L--D--E--L--T--L--C--K--A--D--L--E--A--Q--V--E--S--L--K--E--E--L--M--C--L--K--K--N--H-----E-----E--V--S--V--L--R--C--Q--L--G--D--
macaque_prot        I--N--G--L--R--R--I--L--D--E--L--T--L--C--K--A--D--L--E--A--Q--V--E--S--L--K--E--E--L--M--C--L--K--K--N--H-----E-----E--V--S--V--L--R--C--Q--L--G--D--
human_dna           ATCAACGGCCTGCGTAGGATCCTGGATGAGCTGACCCTGTGCAAGGCTGACCTGGAGGCTCAGGTGGAGTCCCTGAAGGAGGAGCTGATGTGCCTCAAGAAGAATCAC---GAG---GAAGTCAGTGTACTCCGTTGCCAACTTGGGGAC
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macaque_dna         ATCAACGGCCTGCGTAGGATCCTGGATGAGCTGACGCTGTGCAAGGCTGACCTGGAGGCTCAGGTGGAGTCCCTGAAGGAGGAGCTGATGTGCCTCAAGAAGAACCAC---GAG---GAAGTCAGTGTGCTCCGTTGTCAACTTGGGGAT
hg18                ATCAACGGCCTGCGTAGGATCCTGGATGAGCTGACCCTGTGCAAGGCTGACCTGGAGGCTCAGGTGGAGTCCCTGAAGGAGGAGCTGATGTGCCTCAAGAAGAATCACGAGGAG---GAAGTCAGTGTACTCCGTTGCCAACTTGGGGAC
panTro2             ATCAACGGCCTGCGTAGGATCCTGGATGAGCTGACCCTGTGCAAGGCTGACCTGGAGGCTCAGGTGGAGTCCCTGAAGGAGGAGCTGATGTGCCTCAAGAAGAATCACGAGGAG---GAAGTCAGTGTACTCCGTTGCCAACTTGGGGAC
rheMac2             ATCAACGGCCTGCGTAGGATCCTGGATGAGCTGACGCTGTGCAAGGCTGACCTGGAGGCTCAGGTGGAGTCCCTGAAGGAGGAGCTGATGTGCCTCAAGAAGAACCACGAGGAG---GAAGTCAGTGTGCTCCGTTGTCAACTTGGGGAT
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hg18_prot           I--N--G--L--R--R--I--L--D--E--L--T--L--C--K--A--D--L--E--A--Q--V--E--S--L--K--E--E--L--M--C--L--K--K--N--H--E--E-----E--V--S--V--L--R--C--Q--L--G--D--
panTro_prot         I--N--G--L--R--R--I--L--D--E--L--T--L--C--K--A--D--L--E--A--Q--V--E--S--L--K--E--E--L--M--C--L--K--K--N--H--E--E-----E--V--S--V--L--R--C--Q--L--G--D--
rheMac_prot         I--N--G--L--R--R--I--L--D--E--L--T--L--C--K--A--D--L--E--A--Q--V--E--S--L--K--E--E--L--M--C--L--K--K--N--H--E--E-----E--V--S--V--L--R--C--Q--L--G--D--

                                      (C)                                                                                                                                 
                    75.. ....|76.. ....|77.. ....|78.. ....|79.. ....|80.. ....|81.. ....|82.. ....|83.. ....|84.. ....|85.. ....|86.. ....|87.. ....|88.. ....|89.. ....|
prot                R--L--N--V--E--V--D--A--A--P--P--V--D--L--N--K--I--L--E--D--M--R--C--Q--Y--E--A--L--V--E--N--N--R--R--D--V--E--A--W--F--N--T--Q--T--E--E--L--N--Q--Q--
human_prot          R--L--N--V--E--V--D--A--A--P--P--V--D--L--N--K--I--L--E--D--M--R--C--Q--Y--E--A--L--V--E--N--N--R--R--D--V--E--A--W--F--N--T--Q--T--E--E--L--N--Q--Q--
chimp_prot          R--L--N--V--E--V--D--A--A--P--P--V--D--L--N--K--I--L--E--D--M--R--C--Q--Y--E--A--L--V--E--N--N--R--R--D--V--E--A--W--F--N--T--Q--T--E--E--L--N--Q--Q--
macaque_prot        R--L--N--V--E--V--D--A--A--P--P--V--D--L--N--K--I--L--E--D--M--R--C--Q--Y--E--A--L--V--E--N--N--R--R--D--V--E--A--W--F--N--T--Q--T--E--E--L--N--Q--Q--
human_dna           CGACTGAATGTGGAGGTGGACGCTGCTCCCCCAGTGGATCTCAACAAGATCCTGGAGGATATGAGATGCCAGTACGAGGCCCTGGTGGAGAATAACCGCAGAGATGTGGAGGCCTGGTTCAACACCCAGACTGAGGAGCTGAACCAGCAG
chimp_dna           CGACTGAATGTGGAGGTGGATGCTGCTCCCCCAGTGGATCTCAACAAGATCCTGGAGGATATGAGATGCCAGTACGAGGCCCTGGTGGAGAATAACCGCAGAGATGTGGAGGCCTGGTTCAACACCCAGACTGAGGAGCTGAACCAGCAG
macaque_dna         CGACTAAATGTGGAGGTGGACGCTGCTCCCCCAGTGGATCTCAACAAGATCCTGGAGGATATGAGATGCCAGTACGAGGCACTGGTGGAGAATAACCGCAGAGATGTGGAGGCCTGGTTCAACACCCAGACCGAGGAGCTGAACCAGCAG
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panTro2             CGACTGAATGTGGAGGTGGATGCTGCTCCCCCAGTGGATCTCAACAAGATCCTGGAGGATATGAGATGCCAGTACGAGGCCCTGGTGGAGAATAACCGCAGAGATGTGGAGGCCTGGTTCAACACCCAGACTGAGGAGCTGAACCAGCAG
rheMac2             CGACTAAATGTGGAGGTGGACGCTGCTCCCCCAGTGGATCTCAACAAGATCCTGGAGGATATGAGATGCCAGTACGAGGCACTGGTGGAGAATAACCGCAGAGATGTGGAGGCCTGGTTCAACACCCAGACCGAGGAGCTGAACCAGCAG
codon_pos           012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           R--L--N--V--E--V--D--A--A--P--P--V--D--L--N--K--I--L--E--D--M--R--C--Q--Y--E--A--L--V--E--N--N--R--R--D--V--E--A--W--F--N--T--Q--T--E--E--L--N--Q--Q--
panTro_prot         R--L--N--V--E--V--D--A--A--P--P--V--D--L--N--K--I--L--E--D--M--R--C--Q--Y--E--A--L--V--E--N--N--R--R--D--V--E--A--W--F--N--T--Q--T--E--E--L--N--Q--Q--
rheMac_prot         R--L--N--V--E--V--D--A--A--P--P--V--D--L--N--K--I--L--E--D--M--R--C--Q--Y--E--A--L--V--E--N--N--R--R--D--V--E--A--W--F--N--T--Q--T--E--E--L--N--Q--Q--

                                                                                (C)                                                                                       
                    90.. ....|91.. ....|92.. ....|93.. ....|94.. ....|95.. ....|96.. ....|97.. ....|98.. ....|99.. ....|100. ....|101. ....|102. ....|103. ....|104. ....|
prot                V--V--S--S--S--E--Q--L--Q--C--C--Q--T--E--I--I--E--L--R--R--T--V--N--A--L--E--I--E-----L--Q--A--Q--H--S--M-----R--N--S--L--E--S--T--L--A--E--T--E--A--
human_prot          V--V--S--S--S--E--Q--L--Q--C--C--Q--T--E--I--I--E--L--R--R--T--V--N--A--L--E--I--------L--Q--A--Q--H--S--------R--N--S--L--E--S--T--L--A--E--T--E--A--
chimp_prot          V--V--S--S--S--E--Q--L--Q--C--C--Q--T--E--I--I--E--L--R--R--T--V--N--A--L--E--I--------L--Q--A--Q--H--S--------R--N--S--L--E--S--T--L--A--E--T--E--A--
macaque_prot        V--V--S--S--S--E--Q--L--Q--C--C--Q--T--E--I--I--E--L--R--R--T--V--N--S--L--E--I--------L--Q--A--Q--H--S--------R--N--S--L--E--S--T--L--V--E--T--E--A--
human_dna           GTGGTGTCCAGCTCGGAGCAGCTGCAGTGCTGCCAGACGGAGATCATCGAGCTGAGACGTACGGTCAACGCGCTAGAGATT------CTGCAGGCTCAGCACAGC------CGGAATTCCTTGGAATCCACCCTGGCCGAAACCGAGGCC
chimp_dna           GTGGTGTCCAGCTCGGAGCAGCTGCAGTGCTGCCAGACGGAGATCATCGAGCTGAGACGTACAGTCAACGCCCTAGAGATT------CTGCAGGCTCAGCACAGC------CGGAATTCCTTGGAATCCACCCTGGCCGAAACCGAGGCC
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panTro2             GTGGTGTCCAGCTCGGAGCAGCTGCAGTGCTGCCAGACGGAGATCATCGAGCTGAGACGTACAGTCAACGCCCTAGAGATTGAG---CTGCAGGCTCAGCACAGCATG---CGGAATTCCTTGGAATCCACCCTGGCCGAAACCGAGGCC
rheMac2             GTGGTGTCCAGCTCGGAGCAGCTGCAGTGCTGCCAGACGGAGATCATCGAGCTGAGACGCACGGTCAACAGCCTGGAGATTGAG---CTGCAGGCCCAGCACAGCATG---AGGAATTCCTTGGAATCCACCCTGGTGGAAACTGAGGCC
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hg18_prot           V--V--S--S--S--E--Q--L--Q--C--C--Q--T--E--I--I--E--L--R--R--T--V--N--A--L--E--I--E-----L--Q--A--Q--H--S--M-----R--N--S--L--E--S--T--L--A--E--T--E--A--
panTro_prot         V--V--S--S--S--E--Q--L--Q--C--C--Q--T--E--I--I--E--L--R--R--T--V--N--A--L--E--I--E-----L--Q--A--Q--H--S--M-----R--N--S--L--E--S--T--L--A--E--T--E--A--
rheMac_prot         V--V--S--S--S--E--Q--L--Q--C--C--Q--T--E--I--I--E--L--R--R--T--V--N--S--L--E--I--E-----L--Q--A--Q--H--S--M-----R--N--S--L--E--S--T--L--V--E--T--E--A--

                                            C                                                                                                                             
                    105. ....|106. ....|107. ....|108. ....|109. ....|110. ....|111. ....|112. ....|113. ....|114. ....|115. ....|116. ....|117. ....|118. ....|119. ....|
prot                R--Y--S--S--Q--L--A--Q--M--Q--C--L--I--S--N--V--E--A--Q--L--S--E--I--R--C--D--L--E--R--Q--N--Q--E--Y--Q--V--L--L--D--V--K--A--R--L--E--G--E--I--A--T--
human_prot          R--Y--S--S--Q--L--A--Q--M--Q--C--L--I--S--N--V--E--A--Q--L--S--E--I--R--C--D--L--E--R--Q--N--Q--E--Y--Q--V--L--L--D--V--K--A--R--L--E--G--E--I--A--T--
chimp_prot          R--Y--S--S--Q--L--A--Q--V--Q--C--L--I--S--N--V--E--A--Q--L--S--E--I--R--C--D--L--E--R--Q--N--Q--E--Y--Q--V--L--L--D--V--K--A--R--L--E--G--E--I--A--T--
macaque_prot        R--Y--S--S--Q--L--A--Q--M--Q--C--L--I--S--N--V--E--A--Q--L--S--E--I--R--C--D--L--E--R--Q--N--Q--E--Y--Q--V--L--L--D--V--K--A--R--L--E--G--E--I--A--T--
human_dna           CGCTACAGCTCCCAGCTGGCCCAGATGCAGTGCCTGATCAGCAACGTGGAGGCCCAGCTGTCTGAGATCCGCTGCGACCTGGAGCGGCAGAACCAGGAGTACCAGGTGTTACTGGACGTCAAGGCCCGGCTGGAGGGCGAGATCGCTACC
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panTro2             CGCTACAGCTCCCAGCTGGCCCAGGTGCAGTGCCTGATCAGCAACGTGGAGGCCCAGCTGTCTGAGATCCGCTGCGACCTGGAGCGGCAGAACCAGGAGTACCAGGTGTTACTGGACGTCAAGGCCCGGCTGGAGGGCGAGATCGCTACC
rheMac2             CGCTACAGCTCCCAGCTGGCCCAGATGCAGTGCCTGATCAGCAACGTGGAGGCCCAGCTGTCTGAGATCCGCTGCGACCTGGAGCGGCAGAACCAGGAGTACCAGGTGCTACTGGACGTCAAGGCCCGGCTGGAGGGCGAGATCGCTACC
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hg18_prot           R--Y--S--S--Q--L--A--Q--M--Q--C--L--I--S--N--V--E--A--Q--L--S--E--I--R--C--D--L--E--R--Q--N--Q--E--Y--Q--V--L--L--D--V--K--A--R--L--E--G--E--I--A--T--
panTro_prot         R--Y--S--S--Q--L--A--Q--V--Q--C--L--I--S--N--V--E--A--Q--L--S--E--I--R--C--D--L--E--R--Q--N--Q--E--Y--Q--V--L--L--D--V--K--A--R--L--E--G--E--I--A--T--
rheMac_prot         R--Y--S--S--Q--L--A--Q--M--Q--C--L--I--S--N--V--E--A--Q--L--S--E--I--R--C--D--L--E--R--Q--N--Q--E--Y--Q--V--L--L--D--V--K--A--R--L--E--G--E--I--A--T--

                          H                                         H                                                                       H                             
                    120. ....|121. ....|122. ....|123. ....|124. ....|125. ....|126. ....|127. ....|128. ....|129. ....|130. ....|131. ....|132. ....|133. ....|134. ....|
prot                Y--R--H--L--L--E--G--E--D--C--K--------L--P--P--Q--P-----C--A--T--A--C--K--P--V--I--R--V--P--S--V--P--P--V--P--C--V--P--S--V--P--C--T--P--A--P--Q--V--
human_prot          Y--R--H--L--L--E--G--E--D--------------L--P--P--Q--P--------A--T--A--C--K--P--V--I--R--V--P--S--V--P--P--V--P--C--V--P--S--V--P--C--T--P--A--P--Q--V--
chimp_prot          Y--R--R--L--L--E--G--E--D--------------L--P--P--P--P--------A--T--A--C--K--P--V--I--R--V--P--S--V--P--P--V--P--C--V--P--A--V--P--C--T--P--A--P--Q--V--
macaque_prot        Y--R--R--L--L--E--G--E--D--------------L--P--S--P--P--------A--M--A--C--K--P--A--I--R--V--P--S--V--P--L--V--P--C--A--P--A--V--P--C--T--S--A--P--Q--V--
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chimp_dna           TACCGCCGCCTGCTGGAGGGAGAGGAC------------CTTCCTCCCCCACC---T---GCCACGGCATGCAAGCCTGTTATTAGAGTTCCTTCTGTCCCCCCGGTGCCCTGTGTCCCCGCTGTGCCCTGCACCCCGGCTCCCCAGGTT
macaque_dna         TACCGCCGCCTGCTGGAGGGAGAGGAC------------CTTCCTTCCCCACC---T---GCCATGGCATGCAAGCCTGCTATTAGAGTTCCTTCTGTCCCCCTGGTGCCCTGTGCCCCTGCTGTGCCCTGCACCTCGGCTCCCCAGGTT
hg18                TACCGCCACCTGCTGGAGGGAGAGGACTGCAAG------CTTCCTCCCCAACCTTGT---GCCACGGCATGCAAGCCTGTTATTAGAGTTCCTTCTGTCCCCCCGGTGCCCTGTGTCCCCTCTGTGCCCTGCACCCCGGCTCCCCAGGTT
panTro2             TACCGCCGCCTGCTGGAGGGAGAGGACTGCAAG------CTTCCTCCCCCACCTTGT---GCCACGGCATGCAAGCCTGTTATTAGAGTTCCTTCTGTCCCCCCGGTGCCCTGTGTCCCCGCTGTGCCCTGCACCCCGGCTCCCCAGGTT
rheMac2             TACCGCCGCCTGCTGGAGGGAGAGGACTGCAAG------CTTCCTTCCCCACCTTGT---GCCATGGCATGCAAGCCTGCTATTAGAGTTCCTTCTGTCCCCCTGGTGCCCTGTGCCCCTGCTGTGCCCTGCACCTCGGCTCCCCAGGTT
codon_pos           012012012012012012012012012012012------012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012
hg18_prot           Y--R--H--L--L--E--G--E--D--C--K--------L--P--P--Q--P--C-----A--T--A--C--K--P--V--I--R--V--P--S--V--P--P--V--P--C--V--P--S--V--P--C--T--P--A--P--Q--V--
panTro_prot         Y--R--R--L--L--E--G--E--D--C--K--------L--P--P--P--P--C-----A--T--A--C--K--P--V--I--R--V--P--S--V--P--P--V--P--C--V--P--A--V--P--C--T--P--A--P--Q--V--
rheMac_prot         Y--R--R--L--L--E--G--E--D--C--K--------L--P--S--P--P--C-----A--M--A--C--K--P--A--I--R--V--P--S--V--P--L--V--P--C--A--P--A--V--P--C--T--S--A--P--Q--V--

                                                                                                              
                    135. ....|136. ....|137. ....|138. ....|139. ....|140. ....|141. ....|142. ....|143. ....|
prot                G--T--Q--I--R--T--I--T--E--E--I--R--D--G--K--V--I--S--S--R--E--H--V--Q--S--R--P--L--------
human_prot          G--T--Q--I--R--T--I--T--E--E--I--R--D--G--K--V--I--S--S--R--E--H--V--Q--S--R--P-----------
chimp_prot          G--T--Q--I--R--T--I--T--E--E--I--R--D--G--K--V--I--S--S--R--E--H--V--Q--S--R--P-----------
macaque_prot        G--T--Q--I--R--T--I--T--E--E--I--R--D--G--K--V--I--S--S--R--E--H--V--Q--S--R--P-----------
human_dna           GGCACTCAGATCCGCACCATCACCGAGGAGATCAGAGATGGGAAAGTCATCTCCTCCAGGGAGCACGTGCAGTCCCGCCCG---------
chimp_dna           GGCACTCAGATCCGCACCATCACCGAGGAGATCAGAGATGGGAAAGTCATCTCCTCCAGGGAGCACGTGCAGTCCCGCCCG---------
macaque_dna         GGCACTCAGATCCGCACCATCACCGAGGAGATCAGAGATGGGAAAGTCATCTCCTCCAGGGAGCACGTGCAGTCCCGCCCG---------
hg18                GGCACTCAGATCCGCACCATCACCGAGGAGATCAGAGATGGGAAAGTCATCTCCTCCAGGGAGCACGTGCAGTCCCGCCCGCT---G---
panTro2             GGCACTCAGATCCGCACCATCACCGAGGAGATCAGAGATGGGAAAGTCATCTCCTCCAGGGAGCACGTGCAGTCCCGCCCGCT---G---
rheMac2             GGCACTCAGATCCGCACCATCACCGAGGAGATCAGAGATGGGAAAGTCATCTCCTCCAGGGAGCACGTGCAGTCCCGCCCGCT---G---
codon_pos           01201201201201201201201201201201201201201201201201201201201201201201201201201201201---2---
hg18_prot           G--T--Q--I--R--T--I--T--E--E--I--R--D--G--K--V--I--S--S--R--E--H--V--Q--S--R--P--L--------
panTro_prot         G--T--Q--I--R--T--I--T--E--E--I--R--D--G--K--V--I--S--S--R--E--H--V--Q--S--R--P--L--------
rheMac_prot         G--T--Q--I--R--T--I--T--E--E--I--R--D--G--K--V--I--S--S--R--E--H--V--Q--S--R--P--L--------