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ATGGCCAAGCCCAGCGTGGAGCTCACCCGCGAGTGC------GACAGCATCCGGAGGTGCCTGAGCCAAGGGGCCGTGCTCCAACAACATCATGTGAAGTTGGAGACAAAGCCCAAGAAGTTTGAGGACCGAG---TG---GCCCTGACC macaque_dna ATGGCCAAGCCAAGCGTGGAGCTCACCCGCGAGTTG------GACAGTATCCGGAGGTGCCTGAGCCAAGGGGCCGTGCTCCAACAACATCGTGTGAAGTTGGAGACAAAACCCAAGAAGTTTGAGGACCGAG---TG---GCCTTGACC hg18 ATGGCCAAGCCCAGCGTGGAGCTCACCCGCGAGTTGCAA---GACAGCATCCGGAGGTGCCTGAGCCAAGGGGCCGTGCTCCAACAACATCATGTGAAGTTGGAGACAAAGCCCAAGAAGTTTGAGGACCGAGTGCTG---GCCCTGACC panTro2 ATGGCCAAGCCCAGCGTGGAGCTCACCCGCGAGTGCAAG---GACAGCATCCGGAGGTGCCTGAGCCAAGGGGCCGTGCTCCAACAACATCATGTGAAGTTGGAGACAAAGCCCAAGAAGTTTGAGGACCGAGTGCTG---GCCCTGACC rheMac2 ATGGCCAAGCCCAGCGTGGAGCTCACCCGCGAGTTGCAA---GACAGTATCCGGAGGTGCCTGAGCCAAGGGGCCGTGCTCCAACAACATCGTGTGAAGTTGGAGACAAAACCCAAGAAGTTTGAGGACCGAGTGCTG---GCCTTGACC codon_pos 012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012 hg18_prot M--A--K--P--S--V--E--L--T--R--E--L--Q-----D--S--I--R--R--C--L--S--Q--G--A--V--L--Q--Q--H--H--V--K--L--E--T--K--P--K--K--F--E--D--R--V--L-----A--L--T-- panTro_prot M--A--K--P--S--V--E--L--T--R--E--C--K-----D--S--I--R--R--C--L--S--Q--G--A--V--L--Q--Q--H--H--V--K--L--E--T--K--P--K--K--F--E--D--R--V--L-----A--L--T-- rheMac_prot M--A--K--P--S--V--E--L--T--R--E--L--Q-----D--S--I--R--R--C--L--S--Q--G--A--V--L--Q--Q--H--R--V--K--L--E--T--K--P--K--K--F--E--D--R--V--L-----A--L--T-- H 15.. ....|16.. ....|17.. ....|18.. ....|19.. ....|20.. ....|21.. ....|22.. ....|23.. ....|24.. ....|25.. ....|26.. ....|27.. ....|28.. ....|29.. ....| prot S--W--R--L--H--L--F--L--L--K--V--P--A--K-----V--E--S--S--F--N--V--L--E--I--R--A--F--N--T--L--S--Q--N--Q--I--L--V--E--T--E--R--G--M--V--S--M--R--L--P-- human_prot S--W--R--L--H--L--F--L--L--K--V--P--A--------V--E--S--S--F--N--V--L--E--I--R--A--F--N--T--L--S--Q--N--Q--I--L--V--E--T--E--R--G--M--V--S--M--R--L--P-- chimp_prot S--W--R--L--H--L--F--P--L--K--V--P--A--------V--E--S--S--F--N--V--L--E--I--R--A--F--N--T--L--S--Q--N--Q--I--L--V--E--T--E--R--G--M--V--S--M--R--L--P-- macaque_prot S--W--R--L--H--L--F--P--L--K--V--P--A--------V--E--S--S--F--N--V--L--E--I--R--A--F--N--T--L--S--Q--N--Q--I--L--V--E--T--E--R--G--M--V--S--M--R--L--P-- human_dna TCCTGGCGCCTCCACCTCTTCCTCCTTAAAGTCCCGGCC------GTGGAGAGCTCCTTCAATGTCCTGGAGATCCGTGCCTTCAACACGCTCAGTCAGAATCAGATCCTGGTGGAGACGGAGCGTGGCATGGTGAGCATGCGACTGCCA chimp_dna TCCTGGCGCCTCCACCTCTTCCCCCTTAAAGTCCCGGCC------GTGGAGAGCTCCTTCAATGTCCTGGAGATCCGTGCCTTCAACACGCTCAGTCAGAATCAGATCCTGGTGGAGACGGAGCGTGGCATGGTGAGCATGCGACTGCCA macaque_dna TCCTGGCGCCTCCACCTCTTCCCCCTGAAAGTCCCAGCC------GTGGAGAGCTCCTTCAATGTCCTGGAGATCCGTGCCTTCAACACGCTCAGTCAGAACCAGATCCTGGTGGAGACGGAGCGTGGCATGGTGAGCATGCGGCTGCCA hg18 TCCTGGCGCCTCCACCTCTTCCTCCTTAAAGTCCCGGCCAAG---GTGGAGAGCTCCTTCAATGTCCTGGAGATCCGTGCCTTCAACACGCTCAGTCAGAATCAGATCCTGGTGGAGACGGAGCGTGGCATGGTGAGCATGCGACTGCCA panTro2 TCCTGGCGCCTCCACCTCTTCCCCCTTAAAGTCCCGGCCAAG---GTGGAGAGCTCCTTCAATGTCCTGGAGATCCGTGCCTTCAACACGCTCAGTCAGAATCAGATCCTGGTGGAGACGGAGCGTGGCATGGTGAGCATGCGACTGCCA rheMac2 TCCTGGCGCCTCCACCTCTTCCCCCTGAAAGTCCCAGCCAAG---GTGGAGAGCTCCTTCAATGTCCTGGAGATCCGTGCCTTCAACACGCTCAGTCANNNNNNNATCCTGGTGGAGACGGAGCGTGGCATGGTGAGCATGCGGCTGCCA codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot S--W--R--L--H--L--F--L--L--K--V--P--A--K-----V--E--S--S--F--N--V--L--E--I--R--A--F--N--T--L--S--Q--N--Q--I--L--V--E--T--E--R--G--M--V--S--M--R--L--P-- panTro_prot S--W--R--L--H--L--F--P--L--K--V--P--A--K-----V--E--S--S--F--N--V--L--E--I--R--A--F--N--T--L--S--Q--N--Q--I--L--V--E--T--E--R--G--M--V--S--M--R--L--P-- rheMac_prot S--W--R--L--H--L--F--P--L--K--V--P--A--K-----V--E--S--S--F--N--V--L--E--I--R--A--F--N--T--L--S--_--_--_--I--L--V--E--T--E--R--G--M--V--S--M--R--L--P-- 30.. ....|31.. ....|32.. ....|33.. 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TCAGCTGAAAGTGTGGACCAGGTGACACGACATGTGAGCTCTGCCCTGTCCAAGGTCTGCCCTGGC------------TGTTTGATCCGGCGTGGAAACGCAGACACCCCAGAGGGGCCCCGAGATACATCCCCCAACTCTGAGACTTCC macaque_dna TCAGCTGAAAGTGTGGACCAGGTGACACGACATGTGAGCTCTGCCCTGTCCAAGGTCTGCCCTGGC------------TGTTTGATCCGGCGTGGAAACGCAGACACCCCAGAGGGGCCCCGAGACACATCCCCCAACTCTGAGACTTCC hg18 TCAGCTGAAAGTGTGGACCAGGTGACACGACATGTGAGCTCTGCCCTGTCCAAGGTCTGCCCTGGCCCTGGG------TGTTTGATCCGGCGTGGAAACGCAGACACCCCAGAGGGGCCCCGAGATACATCCCCCAACTCTGAGACTTCC panTro2 TCAGCTGAAAGTGTGGACCAGGTGACACGACATGTGAGCTCTGCCCTGTCCAAGGTCTGCCCTGGCCCTGGG------TGTTTGATCCGGCGTGGAAACGCAGACACCCCAGAGGGGCCCCGAGATACATCCCCCAACTCTGAGACTTCC rheMac2 TCAGCTGAAAGTGTGGACCAGGTGACACGACATGTGAGCTCTGCCCTGTCCAAGGTCTGCCCTGGCCCTGGG------TGTTTGATCCGGCGTGGAAACGCAGACACCCCAGAGGGGCCCCGAGACACATCCCCCAACTCTGAGACTTCC codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012------012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot S--A--E--S--V--D--Q--V--T--R--H--V--S--S--A--L--S--K--V--C--P--G--P--G--------C--L--I--R--R--G--N--A--D--T--P--E--G--P--R--D--T--S--P--N--S--E--T--S-- panTro_prot S--A--E--S--V--D--Q--V--T--R--H--V--S--S--A--L--S--K--V--C--P--G--P--G--------C--L--I--R--R--G--N--A--D--T--P--E--G--P--R--D--T--S--P--N--S--E--T--S-- rheMac_prot S--A--E--S--V--D--Q--V--T--R--H--V--S--S--A--L--S--K--V--C--P--G--P--G--------C--L--I--R--R--G--N--A--D--T--P--E--G--P--R--D--T--S--P--N--S--E--T--S-- 45.. ....|46.. ....|47.. ....|48.. ....|49.. ....|50.. ....|51.. ....|52.. ....|53.. ....|54.. ....|55.. ....|56.. ....|57.. ....|58.. ....|59.. ....| prot T--S--T--T--H--S--V-----C--G--G--F--S--E--T--Y--A--A--L--C--D--Y--N--G--L--H--C--R--E--E--V--Q--W-----D--V--D--T--I--Y--H--A--E--D--N--R--E--F--N--L-- human_prot T--S--T--T--H--S--V--------G--G--F--S--E--T--Y--A--A--L--C--D--Y--N--G--L--H--C--R--E--E--V--Q--------D--V--D--T--I--Y--H--A--E--D--N--R--E--F--N--L-- chimp_prot T--S--T--T--H--S--V--------G--G--F--S--E--T--Y--A--A--L--C--D--Y--N--G--L--H--C--R--E--E--V--Q--------D--V--D--T--I--Y--H--A--E--D--N--R--E--F--N--L-- macaque_prot T--S--T--T--H--S--V--------G--G--F--S--E--T--Y--A--A--L--C--D--Y--N--G--L--H--C--R--E--E--V--Q--------D--V--D--T--I--Y--H--A--E--D--N--R--E--F--N--L-- human_dna ACATCTACCACCCACAGTGT---C---GGTGGCTTCTCTGAGACCTACGCTGCTCTGTGTGACTACAATGGGCTACACTGCCGTGAGGAGGTTCAA------GATGTGGACACCATCTACCATGCTGAAGATAACCGGGAGTTCAATCTT chimp_dna ACATCTACCACCCACAGTGT---C---GGTGGCTTCTCTGAGACCTACGCTGCTCTGTGTGACTACAATGGGCTACACTGCCGTGAGGAGGTTCAA------GATGTGGACACCATCTACCATGCTGAAGATAACCGGGAGTTCAATCTT macaque_dna ACATCTACCACCCACAGTGT---C---GGTGGCTTCTCTGAGACCTACGCTGCTCTGTGTGACTACAATGGGTTACACTGCCGTGAGGAGGTTCAG------GATGTGGACACCATCTACCATGCTGAAGATAACCGGGAGTTCAATCTC hg18 ACATCTACCACCCACAGTGTCTGC---GGTGGCTTCTCTGAGACCTACGCTGCTCTGTGTGACTACAATGGGCTACACTGCCGTGAGGAGGTTCAATGG---GATGTGGACACCATCTACCATGCTGAAGATAACCGGGAGTTCAATCTT panTro2 ACATCTACCACCCACAGTGTCTGC---GGTGGCTTCTCTGAGACCTACGCTGCTCTGTGTGACTACAATGGGCTACACTGCCGTGAGGAGGTTCAATGG---GATGTGGACACCATCTACCATGCTGAAGATAACCGGGAGTTCAATCTT rheMac2 ACATCTACCACCCACAGTGTCTGC---GGTGGCTTCTCTGAGACCTACGCTGCTCTGTGTGACTACAATGGGTTACACTGCCGTGAGGAGGTTCAGTGG---GATGTGGACACCATCTACCATGCTGAAGATAACCGGGAGTTCAATCTC codon_pos 012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot T--S--T--T--H--S--V--C-----G--G--F--S--E--T--Y--A--A--L--C--D--Y--N--G--L--H--C--R--E--E--V--Q--W-----D--V--D--T--I--Y--H--A--E--D--N--R--E--F--N--L-- panTro_prot T--S--T--T--H--S--V--C-----G--G--F--S--E--T--Y--A--A--L--C--D--Y--N--G--L--H--C--R--E--E--V--Q--W-----D--V--D--T--I--Y--H--A--E--D--N--R--E--F--N--L-- rheMac_prot T--S--T--T--H--S--V--C-----G--G--F--S--E--T--Y--A--A--L--C--D--Y--N--G--L--H--C--R--E--E--V--Q--W-----D--V--D--T--I--Y--H--A--E--D--N--R--E--F--N--L-- 60.. ....|61.. ....|62.. ....|63.. 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TTGGATTTCAGCCACTTGGAG---A---GAGACTTGGCCCTAATGGTAGCAGCCCTGGCCTACAACCAGTGGTTCACCAAACTCTACTGCAAGGACTTGCG---G---GGCTCTGAAGTGCTAGAACAGGTGCTACATACCCTAAGCAAG macaque_dna TTGGATTTCAGCCACTTGGAG---A---GAGACTTGGCCCTAATGGTAGCAGCCCTGGCCTACAACCAGTGGTTCACCAAACTCTACTGCAAGGACTTGCG---A---GGCTCTGAAGTGCTAGAACAGGTGCTACATACCCTGAGCAAG hg18 TTGGATTTCAGCCACTTGGAG---AGCCGAGACTTGGCCCTAATGGTAGCAGCCCTGGCCTACAACCAGTGGTTCACCAAACTCTACTGCAAGGACTTGCGGCTG---GGCTCTGAAGTGCTAGAACAGGTGCTACATACCCTAAGCAAG panTro2 TTGGATTTCAGCCACTTGGAG---AGCCGAGACTTGGCCCTAATGGTAGCAGCCCTGGCCTACAACCAGTGGTTCACCAAACTCTACTGCAAGGACTTGCGGCTG---GGCTCTGAAGTGCTAGAACAGGTGCTACATACCCTAAGCAAG rheMac2 TTGGATTTCAGCCACTTGGAG---AGCCGAGACTTGGCCCTAATGGTAGCAGCCCTGGCCTACAACCAGTGGTTCACCAAACTCTACTGCAAGGACTTGCGACTG---GGCTCTGAAGTGCTAGAACAGGTGCTACATACCCTGAGCAAG codon_pos 012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot L--D--F--S--H--L--E-----S--R--D--L--A--L--M--V--A--A--L--A--Y--N--Q--W--F--T--K--L--Y--C--K--D--L--R--L-----G--S--E--V--L--E--Q--V--L--H--T--L--S--K-- panTro_prot L--D--F--S--H--L--E-----S--R--D--L--A--L--M--V--A--A--L--A--Y--N--Q--W--F--T--K--L--Y--C--K--D--L--R--L-----G--S--E--V--L--E--Q--V--L--H--T--L--S--K-- rheMac_prot L--D--F--S--H--L--E-----S--R--D--L--A--L--M--V--A--A--L--A--Y--N--Q--W--F--T--K--L--Y--C--K--D--L--R--L-----G--S--E--V--L--E--Q--V--L--H--T--L--S--K-- 75.. ....|76.. ....|77.. ....|78.. ....|79.. ....|80.. ....|81.. ....|82.. ....|83.. ....|84.. ....|85.. ....|86.. ....|87.. ....|88.. ....|89.. ....| prot S--G--S--L--E--E--L--V--L--D--N--A--G--L--K--T--------D--F--V--Q--K--L--A--G--V--F--G--E--N--G--S--C--V--L--H--A--L--T--L--S--H--N--P--I--E--D--K----- human_prot S--G--S--L--E--E--L--V--L--D--N--A--G--L--------------D--F--V--Q--K--L--A--G--V--F--G--E--N--G--S--C--V--L--H--A--L--T--L--S--H--N--P--I--E--D-------- chimp_prot S--G--S--L--E--E--L--V--L--D--N--A--G--L--------------D--F--V--Q--K--L--A--G--V--F--G--E--N--G--S--C--V--L--H--A--L--T--L--S--H--N--P--I--E--D-------- macaque_prot S--G--S--L--E--E--L--V--L--D--N--A--G--L--------------D--F--V--Q--K--L--A--G--V--F--G--E--N--G--S--C--V--L--H--A--L--T--L--S--H--N--P--I--E--D-------- human_dna TCGGGGAGCCTCGAAGAGCTGGTGCTGGACAACGCCGGGCTT------------GACTTTGTCCAGAAGCTGGCCGGGGTGTTTGGGGAGAACGGGAGCTGTGTGCTGCATGCCCTCACTCTGTCCCACAACCCCATCGAGGAC------ chimp_dna TCGGGGAGCCTCGAAGAGCTGGTGCTGGACAACGCCGGGCTT------------GACTTTGTCCAGAAGCTGGCCGGGGTGTTTGGGGAGAACGGGAGCTGTGTGCTGCATGCCCTCACTCTGTCCCACAACCCCATCGAGGAC------ macaque_dna TCGGGGAGCCTCGAAGAGCTGGTGCTGGACAACGCCGGGCTT------------GATTTTGTCCAGAAGCTGGCCGGGGTGTTTGGGGAGAACGGGAGCTGTGTGCTGCATGCCCTCACTCTGTCCCACAACCCCATCGAGGAC------ hg18 TCGGGGAGCCTCGAAGAGCTGGTGCTGGACAACGCCGGGCTTAAGACG------GACTTTGTCCAGAAGCTGGCCGGGGTGTTTGGGGAGAACGGGAGCTGTGTGCTGCATGCCCTCACTCTGTCCCACAACCCCATCGAGGACAAG--- panTro2 TCGGGGAGCCTCGAAGAGCTGGTGCTGGACAACGCCGGGCTTAAGACG------GACTTTGTCCAGAAGCTGGCCGGGGTGTTTGGGGAGAACGGGAGCTGTGTGCTGCATGCCCTCACTCTGTCCCACAACCCCATCGAGGACAAG--- rheMac2 TCGGGGAGCCTCGAAGAGCTGGTGCTGGACAACGCCGGGCTTAAGACG------GATTTTGTCCAGAAGCTGGCCGGGGTGTTTGGGGAGAACGGGAGCTGTGTGCTGCATGCCCTCACTCTGTCCCACAACCCCATCGAGGACAAG--- codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012------012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012--- hg18_prot S--G--S--L--E--E--L--V--L--D--N--A--G--L--K--T--------D--F--V--Q--K--L--A--G--V--F--G--E--N--G--S--C--V--L--H--A--L--T--L--S--H--N--P--I--E--D--K----- panTro_prot S--G--S--L--E--E--L--V--L--D--N--A--G--L--K--T--------D--F--V--Q--K--L--A--G--V--F--G--E--N--G--S--C--V--L--H--A--L--T--L--S--H--N--P--I--E--D--K----- rheMac_prot S--G--S--L--E--E--L--V--L--D--N--A--G--L--K--T--------D--F--V--Q--K--L--A--G--V--F--G--E--N--G--S--C--V--L--H--A--L--T--L--S--H--N--P--I--E--D--K----- C 90.. ....|91.. ....|92.. ....|93.. ....|94.. ....|95.. ....|96.. ....|97.. ....|98.. ....|99.. ....|100. ....|101. ....|102. ....|103. ....|104. ....| prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--R-----G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R-- human_prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--------G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R-- chimp_prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--I--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--------G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R-- macaque_prot G--F--F--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--T--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--------G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R-- human_dna GGTTTTCTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCTCTGGCCTCACCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCT------GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCAAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA chimp_dna GGTTTTCTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCTCTGGCCTCATCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCT------GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCAAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA macaque_dna GGCTTCTTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCACTGGCCTCACCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCT------GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCCAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA hg18 GGTTTTCTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCTCTGGCCTCACCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCTCGA---GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCAAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA panTro2 GGTTTTCTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCTCTGGCCTCATCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCTCGA---GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCAAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA rheMac2 GGCTTCTTCAGTCTGAGCCAGCAGCTCCTCTGCTTCCCCACTGGCCTCACCAAACTGTGCCTGGCCAAGACTGCCATTTCCCCTCGA---GGGCTCCAGGCACTCGGCCAGACCTTCGGGGCCAACCCAGCATTTGCCAGCTCCCTTCGA codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--R-----G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R-- panTro_prot G--F--L--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--S--G--L--I--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--R-----G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R-- rheMac_prot G--F--F--S--L--S--Q--Q--L--L--C--F--P--T--G--L--T--K--L--C--L--A--K--T--A--I--S--P--R-----G--L--Q--A--L--G--Q--T--F--G--A--N--P--A--F--A--S--S--L--R-- (C) 105. ....|106. ....|107. ....|108. ....|109. ....|110. ....|111. ....|112. ....|113. ....|114. ....|115. ....|116. ....|117. ....|118. ....|119. ....| prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--N-----A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--L-----L--L--G--A--L-- human_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--------A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--------L--L--G--A--L-- chimp_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--------A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--------L--L--G--A--L-- macaque_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--------A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--------L--L--G--A--L-- human_dna TACCTGGACCTGAGCAAGAATCCTGGGCTCCTCGCCACGGATGAGGCC------GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAACGCCCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGAC------CTTCTCGGTGCCCTG chimp_dna TACCTGGACCTGAGCAAGAATCCTGGGCTCCTCGCCACGGATGAGGCC------GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAACGCCCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGAT------CTTCTCGGTGCCCTG macaque_dna TACCTGGACCTGAGCAAGAACCCTGGGCTCCTCGCCACGGACGAGGCC------GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAATGCTCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGAC------CTTCTCGGTGCCCTA hg18 TACCTGGACCTGAGCAAGAATCCTGGGCTCCTCGCCACGGATGAGGCCAAT---GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAACGCCCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGACTTG---CTTCTCGGTGCCCTG panTro2 TACCTGGACCTGAGCAAGAATCCTGGGCTCCTCGCCACGGATGAGGCCAAT---GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAACGCCCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGATTTG---CTTCTCGGTGCCCTG rheMac2 TACCTGGACCTGAGCAAGAACCCTGGGCTCCTCGCCACGGACGAGGCCAAT---GCCCTCTACAGTTTCCTGGCCCAACCCAATGCTCTGGTGCACCTGGACCTGTCAGGAACTGACTGCGTCATCGACTTG---CTTCTCGGTGCCCTA codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012 hg18_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--N-----A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--L-----L--L--G--A--L-- panTro_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--N-----A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--L-----L--L--G--A--L-- rheMac_prot Y--L--D--L--S--K--N--P--G--L--L--A--T--D--E--A--N-----A--L--Y--S--F--L--A--Q--P--N--A--L--V--H--L--D--L--S--G--T--D--C--V--I--D--L-----L--L--G--A--L-- (*)(*) (H) 120. ....|121. ....|122. 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CTCCACGGCTGCTGCTCCCACCTCACCTACCTCAACCTGGCTCGCAACAGCTGCTC---C---AGGAAGGGTCGAGAGGCCCCGCCAGCTTTCAAGCAGTTCTTCAGCAGCGCCTACACACTGAGCCACGTCAACCTGTCGGCCACAAAG macaque_dna CTCCACGGCTGCTGCTCCCACCTCACCTACCTCAACCTGGCTCGCAACAGCTGCTC---C---AGGAAGGGTCGAGAGTCCCCGCCAGCCTTCAAGCAGTTCTTCAGCAGCGCCTACACACTGAGCCACGTCAACCTGTCAGCCACAAAG hg18 CTCCACGGCTGCTGCTCCCACCTCACCTACCTCAACCTGGCTCGCAACAGCTGCTCCCAC---AGGAAGGGTCGAGAGGCCCCGCCGGCCTTCAAGCAGTTCTTCAGCAGCGCCTACACACTGAGCCACGTCAATCTGTCGGCCACAAAG panTro2 CTCCACGGCTGCTGCTCCCACCTCACCTACCTCAACCTGGCTCGCAACAGCTGCTCCCAC---AGGAAGGGTCGAGAGGCCCCGCCAGCTTTCAAGCAGTTCTTCAGCAGCGCCTACACACTGAGCCACGTCAACCTGTCGGCCACAAAG rheMac2 CTCCACGGCTGCTGCTCCCACCTCACCTACCTCAACCTGGCTCGCAACAGCTGCTCCCAC---AGGAAGGGTCGAGAGTCCCCGCCAGCCTTCAAGCAGTTCTTCAGCAGCGCCTACACACTGAGCCACGTCAACCTGTCAGCCACAAAG codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot L--H--G--C--C--S--H--L--T--Y--L--N--L--A--R--N--S--C--S--H-----R--K--G--R--E--A--P--P--A--F--K--Q--F--F--S--S--A--Y--T--L--S--H--V--N--L--S--A--T--K-- panTro_prot L--H--G--C--C--S--H--L--T--Y--L--N--L--A--R--N--S--C--S--H-----R--K--G--R--E--A--P--P--A--F--K--Q--F--F--S--S--A--Y--T--L--S--H--V--N--L--S--A--T--K-- rheMac_prot L--H--G--C--C--S--H--L--T--Y--L--N--L--A--R--N--S--C--S--H-----R--K--G--R--E--S--P--P--A--F--K--Q--F--F--S--S--A--Y--T--L--S--H--V--N--L--S--A--T--K-- (H) (H) 135. ....|136. ....|137. ....|138. ....|139. ....|140. ....|141. ....|142. ....|143. ....|144. ....|145. ....|146. ....|147. ....|148. ....|149. ....| prot L--P--L--E--A-----L--R--A--L--L--Q--G--L--S--L--N--S--H--L--S--D--L--H--L--D--L--S--S--C--E-----L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C-- human_prot L--P--L--E--A--------R--A--L--L--Q--G--L--S--L--N--S--H--L--S--D--L--H--L--D--L--S--S--C--------L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C-- chimp_prot L--P--L--E--A--------R--A--L--L--Q--G--L--S--L--N--S--H--L--S--D--L--H--L--D--L--S--S--C--------L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C-- macaque_prot L--P--L--E--A--------R--A--L--L--Q--G--L--S--L--N--S--H--L--S--D--L--H--L--D--L--S--S--C--------L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C-- human_dna CTGCCCCTGGAGGC---C---AGGGCGCTGCTTCAGGGCCTCTCCCTCAACAGTCACCTCAGTGACCTGCACCTGGATCTCAGCAGCTGC------CTCCGTTCAGCGGGAGCCCAAGCCTTGCAGGAGCAGCTGGGAGCTGTCACCTGT chimp_dna CTGCCCCTGGAGGC---C---AGGGCGCTGCTTCAGGGCCTCTCCCTCAACAGTCACCTCAGTGACCTGCACCTGGATCTCAGCAGCTGT------CTCCGCTCAGCGGGAGCCCAAGCCTTGCAGGAGCAGCTGGGAGCTGTCACCTGT macaque_dna CTGCCCCTGGAGGC---C---AGGGCGCTGCTTCAGGGCCTCTCCCTCAACAGTCACCTCAGTGACCTACACCTGGATCTCAGCAGCTGT------CTCCGCTCAGCGGGAGCCCAAGCCTTGCAGGAGCAGCTGGGAGCTGTCACCTGT hg18 CTGCCCCTGGAGGCCCTC---AGGGCGCTGCTTCAGGGCCTCTCCCTCAACAGTCACCTCAGTGACCTGCACCTGGATCTCAGCAGCTGCGAG---CTCCGTTCAGCGGGAGCCCAAGCCTTGCAGGAGCAGCTGGGAGCTGTCACCTGT panTro2 CTGCCCCTGGAGGCCCTC---AGGGCGCTGCTTCAGGGCCTCTCCCTCAACAGTCACCTCAGTGACCTGCACCTGGATCTCAGCAGCTGTGAG---CTCCGCTCAGCGGGAGCCCAAGCCTTGCAGGAGCAGCTGGGAGCTGTCACCTGT rheMac2 CTGCCCCTGGANNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---CTCCGCTCAGCGGGAGCCCAAGCCTTGCAGGAGCAGCTGGGAGCTGTCACCTGT codon_pos 012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot L--P--L--E--A--L-----R--A--L--L--Q--G--L--S--L--N--S--H--L--S--D--L--H--L--D--L--S--S--C--E-----L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C-- panTro_prot L--P--L--E--A--L-----R--A--L--L--Q--G--L--S--L--N--S--H--L--S--D--L--H--L--D--L--S--S--C--E-----L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C-- rheMac_prot L--P--L--_--_--_-----_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_--_-----L--R--S--A--G--A--Q--A--L--Q--E--Q--L--G--A--V--T--C-- (C) 150. ....|151. ....|152. ....|153. 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GTAGGGAGCCTGGATCTGTCAGAC------GGGTTCGACTCGGACCTCCTGACACTGGTGCCTGCACTTGGCAAGAACAAGTCCCTCAAGCACCTGTTTTTGGGCAAGAACTTCAATGT------CAAG------ACCCTGGAGGAGATC macaque_dna GTAGGCAGCCTGGATCTGTCGGAC------GGGTTCGACTCGGACCTCCTGACACTGGTGCCGGCACTTGGCAAGAACAAGTCCCTCAAGCACCTGTTTTTGGGCAAGAACTTCAATGT------CAAG------ACCCTGGAGGAGATC hg18 GTAGGCAGCCTGGATCTGTCAGACAAT---GGGTTCGACTCGGACCTCCTGACACTGGTGCCTGCACTTGGCAAGAACAAGTCCCTCAAGCACCTGTTTTTGGGCAAGAACTTCAATGTCAAGGCCAAG------ACCCTGGAGGAGATC panTro2 GTAGGGAGCCTGGATCTGTCAGACAAT---GGGTTCGACTCGGACCTCCTGACACTGGTGCCTGCACTTGGCAAGAACAAGTCCCTCAAGCACCTGTTTTTGGGCAAGAACTTCAATGTCAAGGCCAAG------ACCCTGGAGGAGATC rheMac2 GTAGGCAGCCTGGATCTGTCGGACAAT---GGGTTCGACTCGGACCTCCTGACACTGGTGCCGGCACTTGGCAAGAACAAGTCCCTCAAGCACCTGTTTTTGGGCAAGAACTTCAATGTCAAGGCCAAG------ACCCTGGAGGAGATC codon_pos 012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012------012012012012012 hg18_prot V--G--S--L--D--L--S--D--N-----G--F--D--S--D--L--L--T--L--V--P--A--L--G--K--N--K--S--L--K--H--L--F--L--G--K--N--F--N--V--K--A--K--------T--L--E--E--I-- panTro_prot V--G--S--L--D--L--S--D--N-----G--F--D--S--D--L--L--T--L--V--P--A--L--G--K--N--K--S--L--K--H--L--F--L--G--K--N--F--N--V--K--A--K--------T--L--E--E--I-- rheMac_prot V--G--S--L--D--L--S--D--N-----G--F--D--S--D--L--L--T--L--V--P--A--L--G--K--N--K--S--L--K--H--L--F--L--G--K--N--F--N--V--K--A--K--------T--L--E--E--I-- 165. ....|166. ....|167. ....|168. ....|169. ....|170. ....|171. ....|172. ....|173. ....|174. ....|175. ....|176. ....|177. ....|178. ....|179. ....| prot L--H--K--L--V--Q--L--I--Q--E--E--D--C-----S--L--Q--S--L--S--V--A--D--S--R--L--K--L--R--T--S--I--L--I--N--A--L--G--S--N--T--C--L--A--K--V--D--L--S--G-- human_prot L--H--K--L--V--Q--L--I--Q--E--E--D--------S--L--Q--S--L--S--V--A--D--S--R--L--K--L--R--T--S--I--L--I--N--A--L--G--S--N--T--C--L--A--K--V--D--L--S--G-- chimp_prot L--H--K--L--V--Q--L--I--Q--E--E--D--------S--L--Q--S--L--S--V--A--D--S--R--L--K--L--R--T--S--I--L--I--N--A--L--G--S--N--T--C--L--A--K--V--D--L--S--G-- macaque_prot L--H--K--L--V--Q--L--I--Q--E--E--D--------S--L--Q--S--L--S--V--A--D--S--R--L--K--L--R--T--S--I--L--I--N--A--L--G--S--N--T--C--L--A--K--V--D--L--S--G-- human_dna CTCCACAAGCTGGTGCAGCTGATCCAGGAAGAGGAC------TCCCTGCAGTCACTGTCGGTGGCAGACTCCCGGCTGAAGCTTCGCACCAGCATCCTCATCAATGCCCTGGGCAGCAACACCTGCCTGGCCAAGGTGGATCTGAGCGGC chimp_dna CTCCACAAGCTGGTGCAGCTGATCCAGGAAGAGGAC------TCCCTGCAGTCACTGTCGGTGGCAGACTCCCGGCTGAAGCTTCGCACCAGCATCCTCATCAATGCCCTGGGCAGCAACACCTGCCTGGCCAAGGTGGATCTGAGCGGC macaque_dna CTCCACAAGCTGGTGCAGCTAATCCAGGAAGAGGAC------TCCCTGCAGTCACTGTCGGTGGCAGACTCCCGGCTGAAGCTTCGCACCAGCATCCTCATCAATGCCCTGGGCAGCAACACCTGCCTGGCCAAGGTGGATCTGAGCGGC hg18 CTCCACAAGCTGGTGCAGCTGATCCAGGAAGAGGACTGT---TCCCTGCAGTCACTGTCGGTGGCAGACTCCCGGCTGAAGCTTCGCACCAGCATCCTCATCAATGCCCTGGGCAGCAACACCTGCCTGGCCAAGGTGGATCTGAGCGGC panTro2 CTCCACAAGCTGGTGCAGCTGATCCAGGAAGAGGACTGT---TCCCTGCAGTCACTGTCGGTGGCAGACTCCCGGCTGAAGCTTCGCACCAGCATCCTCATCAATGCCCTGGGCAGCAACACCTGCCTGGCCAAGGTGGATCTGAGCGGC rheMac2 CTCCACAAGCTGGTGCAGCTAATCCAGGAAGAGGACTGT---TCCCTGCAGTCACTGTCGGTGGCAGACTCCCGGCTGAAGCTTCGCACCAGCATCCTCATCAATGCCCTGGGCAGCAACACCTGCCTGGCCAAGGTGGATCTGAGCGGC codon_pos 012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot L--H--K--L--V--Q--L--I--Q--E--E--D--C-----S--L--Q--S--L--S--V--A--D--S--R--L--K--L--R--T--S--I--L--I--N--A--L--G--S--N--T--C--L--A--K--V--D--L--S--G-- panTro_prot L--H--K--L--V--Q--L--I--Q--E--E--D--C-----S--L--Q--S--L--S--V--A--D--S--R--L--K--L--R--T--S--I--L--I--N--A--L--G--S--N--T--C--L--A--K--V--D--L--S--G-- rheMac_prot L--H--K--L--V--Q--L--I--Q--E--E--D--C-----S--L--Q--S--L--S--V--A--D--S--R--L--K--L--R--T--S--I--L--I--N--A--L--G--S--N--T--C--L--A--K--V--D--L--S--G-- 180. ....|181. ....|182. ....|183. 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AATGGCATGGAGGACATCGGGGCCAAGATGCTGTCTAAGGCCCTGCAGATAAACTCCTC---C---AGAACTATCCTATGGGATCGGAACAATACATCTGCCCTGGGCTTCCTGGACATCGCAAGGGCCCT---G---AGCAACCACACG macaque_dna AATGGCATGGAGGACATCGGGGCCAAGATGCTGTCTAAGGCCTTGCAGATAAACTCCTC---C---AGAACTATCCTATGGGATCGGAACAATACATCTGCCCTGGGCTTCCTGGACATCGCAAGGGCCCT---G---AGCAACCACACG hg18 AATGGCATGGAGGACATCGGGGCCAAGATGCTGTCTAAGGCCCTGCAGATAAACTCCTCCCTC---AGAACTATCCTATGGGATCGGAACAATACATCTGCCCTGGGCTTCCTGGACATCGCAAGGGCCCTGGAG---AGCAACCACACG panTro2 AATGGCATGGAGGACATCGGGGCCAAGATGCTGTCTAAGGCCCTGCAGATAAACTCCTCCCTC---AGAACTATCCTATGGGATCGGAACAATACATCTGCCCTGGGCTTCCTGGACATCGCAAGGGCCCTGGAG---AGCAACCACACG rheMac2 AATGGCATGGAGGACATCGGGGCCAAGATGCTGTCTAAGGCCTTGCAGATAAACTCCTCCCTC---AGAACTATCCTATGGGATCGGAACAATACATCTGCCCTGGGCTTCCTGGACATCGCAAGGGCCCTGGAG---AGCAACCACACG codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012 hg18_prot 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L--R--F--M--S--F--P--V--S--D--I--S--Q--A--Y--R--S--A--P--E--R--T--E--D--V--W--Q--------I--Q--W--C--L--V--R--N--N--H--S--Q--T--C--P--Q--E--Q--A--F--R-- macaque_prot L--R--F--M--S--F--P--V--S--D--I--S--Q--A--Y--R--S--A--P--E--R--T--E--D--V--W--Q--------I--Q--W--C--L--V--R--N--N--H--S--Q--T--C--P--Q--E--Q--A--F--R-- human_dna CTGCGCTTCATGTCCTTCCCCGTGAGCGACATCTCCCAAGCCTATCGCAGCGCGCCTGAGCGCACCGAGGACGTCTGGC---AG---ATCCAATGGTGCTTAGTGAGGAACAACCACTCCCAGACGTGCCCCCAGGAGCAGGCCTTCAGG chimp_dna CTGCGCTTCATGTCCTTCCCCGTGAGCGACATCTCCCAAGCCTATCGCAGCGCCCCTGAGCGCACCGAGGACGTCTGGC---AG---ATCCAATGGTGCTTAGTGAGGAACAACCACTCCCAGACGTGCCCCCAGGAGCAGGCCTTCAGG macaque_dna CTGCGCTTCATGTCCTTCCCCGTGAGCGACATCTCCCAAGCCTATCGCAGCGCCCCTGAGCGCACGGAGGACGTCTGGC---AG---ATCCAATGGTGCTTAGTGAGGAACAACCACTCCCAGACGTGCCCCCAGGAGCAGGCCTTCAGG hg18 CTGCGCTTCATGTCCTTCCCCGTGAGCGACATCTCCCAAGCCTATCGCAGCGCGCCTGAGCGCACCGAGGACGTCTGGCAGAAG---ATCCAATGGTGCTTAGTGAGGAACAACCACTCCCAGACGTGCCCCCAGGAGCAGGCCTTCAGG panTro2 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TTGCAGCAGGGCCTGGTGACCAGCAGCGCCGAGCAGATGCTGCAGCGGCTGTGTGGACGAGTGCAGGAGGAGGTGCGGGCCCTGAGACTGTGCCCCCTGGAGCCCGTGCAGGATGAGCTACTCTACGCTCGGGACCTCATCAAAGATGCC macaque_dna TTGCAGCAGGGCCTGGTGACCAGCAGCGCCGAGCAGATGCTGCAGCGGCTGTGTGGACGAGTGCAGGAGGAGGTGCGGGCCCTGAGACTCTGCCCCCTGGAGCCCGTGCAGGATGAGCTACTCTACGCTCGGGACCTCATCAAAGATGCC hg18 TTGCAGCAGGGCCTGGTGACCAGCAGCGCCGAGCAAATGCTGCAGCGGCTGTGTGGACGAGTGCAGGAGGAGGTGCGGGCCCTGAGACTATGCCCCCTGGAGCCTGTGCAGGATGAGCTACTCTACGCTCGGGACCTCATCAAAGATGCC panTro2 TTGCAGCAGGGCCTGGTGACCAGCAGCGCCGAGCAAATGCTGCAGCGGCTGTGTGGACGAGTGCAGGAGGAGGTGCGGGCCCTGAGACTGTGCCCCCTGGAGCCCGTGCAGGATGAGCTACTCTACGCTCGGGACCTCATCAAAGATGCC rheMac2 TTGCAGCAGGGCCTGGTGACCAGCAGCGCCGAGCAAATGCTGCAGCGGCTGTGTGGACGAGTGCAGGAGGAGGTGCGGGCCCTGAGACTCTGCCCCCTGGAGCCCGTGCAGGATGAGCTACTCTACGCTCGGGACCTCATCAAAGATGCC codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot L--Q--Q--G--L--V--T--S--S--A--E--Q--M--L--Q--R--L--C--G--R--V--Q--E--E--V--R--A--L--R--L--C--P--L--E--P--V--Q--D--E--L--L--Y--A--R--D--L--I--K--D--A-- panTro_prot L--Q--Q--G--L--V--T--S--S--A--E--Q--M--L--Q--R--L--C--G--R--V--Q--E--E--V--R--A--L--R--L--C--P--L--E--P--V--Q--D--E--L--L--Y--A--R--D--L--I--K--D--A-- rheMac_prot L--Q--Q--G--L--V--T--S--S--A--E--Q--M--L--Q--R--L--C--G--R--V--Q--E--E--V--R--A--L--R--L--C--P--L--E--P--V--Q--D--E--L--L--Y--A--R--D--L--I--K--D--A-- (H) 225. ....|226. ....|227. ....|228. ....|229. ....|230. ....|231. ....|232. ....|233. ....|234. ....|235. ....|236. ....|237. ....|238. ....|239. ....| prot K--N--S--R-----A--L--F--P--S--L--Y--E--L--G--H--V--L--A--N--D--G--P--V--R--Q--R--L--E--S--V--A--S--E--V--S--K--A--V--D--K--E--L-----Q--V--I--L--E--S-- human_prot K--N--S--R--------L--F--P--S--L--Y--E--L--G--H--V--L--A--N--D--G--P--V--R--Q--R--L--E--S--V--A--S--E--V--S--K--A--V--D--K--E--L--------V--I--L--E--S-- chimp_prot K--N--S--R--------L--F--P--S--L--Y--E--L--G--H--V--L--A--N--D--G--P--V--R--Q--R--L--E--S--V--A--S--E--V--S--K--A--V--D--K--E--L--------V--I--L--E--S-- macaque_prot K--N--S--R--------L--F--P--S--L--Y--E--L--G--H--V--L--A--N--D--G--P--V--R--Q--R--L--E--S--V--A--S--E--V--S--K--A--V--D--K--E--L--------V--I--L--E--S-- human_dna AAGAACTCCCG---G---CTGTTTCCCAGCCTCTATGAGCTGGGCCACGTGCTGGCCAATGATGGGCCTGTGCGGCAGAGGCTGGAATCAGTAGCAAGTGAGGTGTCCAAAGCTGTGGACAAGGAGCT---G---GTGATCCTGGAGTCC chimp_dna AAGAACTCCCG---G---CTGTTTCCCAGCCTCTATGAGCTGGGCCACGTGCTGGCCAATGACGGGCCTGTGCGGCAGAGGCTGGAATCAGTAGCAAGTGAGGTGTCCAAAGCTGTGGACAAGGAGCT---G---GTGATCCTGGAGTCC macaque_dna AAGAACTCCCG---G---CTGTTTCCCAGCCTCTATGAGCTGGGCCACGTACTGGCCAATGACGGGCCTGTGCGGCAGAGGCTGGAATCAGTAGCAAGCGAGGTGTCCAAAGCTGTGGACAAGGAGCT---G---GTGATCCTGGAGTCC hg18 AAGAACTCCCGGGCG---CTGTTTCCCAGCCTCTATGAGCTGGGCCACGTGCTGGCCAATGATGGGCCTGTGCGGCAGAGGCTGGAATCAGTAGCAAGTGAGGTGTCCAAAGCTGTGGACAAGGAGCTGCAG---GTGATCCTGGAGTCC panTro2 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ATGGTCAGCCTGACACAGGAGTTATGCCCTGTGGCCATGCGGGTGGCCGAGGGACACAACAAGATGCTGAGCAATGTGGCGGAGCGTGTCACTGTGCCCCGGAACTTCATCCGAGGGGCACTGCTGGAGCAAGCAGGACAAGACATTCAG macaque_dna ATGGTCAGCCTGACACAGGAGTTATGCCCTGTGGCCATGCGGGTGGCCGAGGGGCACAACAAGATGCTGAGCAATGTGGCGGAGCGTGTCACAGTGCCCCGGAACTTCATCCGAGGGGCACTGCTGGAGCAAGCAGGACAGGACATTCAG hg18 ATGGTCAGCCTGACACAGGAGTTATGCCCTGTGGCCATGCGGGTGGCCGAGGGACACAACAAGATGCTGAGCAATGTGGCGGAGCGTGTCACTGTGCCCCGGAACTTCATCCGAGGGGCACTGCTGGAGCAAGCAGGACAGGACATTCAG panTro2 ATGGTCAGCCTGACACAGGAGTTATGCCCTGTGGCCATGCGGGTGGCCGAGGGACACAACAAGATGCTGAGCAATGTGGCGGAGCGTGTCACTGTGCCCCGGAACTTCATCCGAGGGGCACTGCTGGAGCAAGCAGGACAAGACATTCAG rheMac2 ATGGTCAGCCTGACACAGGAGTTATGCCCTGTGGCCATGCGGGTGGCCGAGGGGCACAACAAGATGCTGAGCAATGTGGCGGAGCGTGTCACAGTGCCCCGGAACTTCATCCGAGGGGCACTGCTGGAGCAAGCAGGACAGGACATTCAG codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot 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N--K--------------E--V--K--L--S--V--V--T--Y--L--T--N--S--I--V--D--E--I--L--Q--E--L--Y--H--S--H--K--S--------A--R--H--L--T--Q--L--R--T--L--S--D--P--P-- macaque_prot N--K--------------E--V--K--L--S--V--V--T--Y--L--T--N--S--I--V--D--E--I--L--Q--E--L--Y--H--S--H--K--S--------A--R--H--L--T--Q--L--R--T--L--S--D--P--P-- human_dna AACAAG------------GAAGTGAAGCTCTCAGTCGTCACCTACCTAACCAGCTCCATAGTGGATGAGATCCTGCAAGAGCTCTACCATTCCCACAAGAGC------GCCCGGCACCTGACCCAGCTAAGGACGCTGTCAGATCCACCA chimp_dna AACAAG------------GAAGTGAAGCTCTCAGTCGTCACCTACCTAACCAACTCCATAGTGGATGAGATCCTGCAAGAGCTCTACCATTCCCACAAGAGC------GCCCGGCACCTGACCCAGCTAAGGACGCTGTCAGATCCACCA macaque_dna AACAAG------------GAAGTCAAGCTCTCAGTCGTCACCTACCTAACCAACTCCATAGTGGATGAGATCCTGCAAGAGCTCTACCACTCCCACAAGAGC------GCCCGGCACCTGACCCAGCTAAGGACGCTGTCAGATCCACCA hg18 AACAAGCTGGAT------GAAGTGAAGCTCTCAGTCGTCACCTACCTAACCAGCTCCATAGTGGATGAGATCCTGCAAGAGCTCTACCATTCCCACAAGAGCCTG---GCCCGGCACCTGACCCAGCTAAGGACGCTGTCAGATCCACCA panTro2 AACAAGCTGGAT------GAAGTGAAGCTCTCAGTCGTCACCTACCTAACCAACTCCATAGTGGATGAGATCCTGCAAGAGCTCTACCATTCCCACAAGAGCCTG---GCCCGGCACCTGACCCAGCTAAGGACGCTGTCAGATCCACCA rheMac2 AACAAGCTGGAT------GAAGTCAAGCTCTCAGTCGTCACCTACCTAACCAACTCCATAGTGGATGAGATCCTGCAAGAGCTCTACCACTCCCACAAGAGCCTG---GCCCGGCACCTGACCCAGCTAAGGACGCTGTCAGATCCACCA codon_pos 012012012012------012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot N--K--L--D--------E--V--K--L--S--V--V--T--Y--L--T--S--S--I--V--D--E--I--L--Q--E--L--Y--H--S--H--K--S--L-----A--R--H--L--T--Q--L--R--T--L--S--D--P--P-- panTro_prot N--K--L--D--------E--V--K--L--S--V--V--T--Y--L--T--N--S--I--V--D--E--I--L--Q--E--L--Y--H--S--H--K--S--L-----A--R--H--L--T--Q--L--R--T--L--S--D--P--P-- rheMac_prot N--K--L--D--------E--V--K--L--S--V--V--T--Y--L--T--N--S--I--V--D--E--I--L--Q--E--L--Y--H--S--H--K--S--L-----A--R--H--L--T--Q--L--R--T--L--S--D--P--P-- (H) 270. ....|271. ....|272. ....|273. 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GGGTGCCCAGGCCAAGGGCAGGATCTGTCCTCCCGGGGCCGAGGCCGGAACCATGACCATGAGGAGACCACAGATGATGAACTTGGGACCAAC------GACACCATGGCCATCAAAAAGCAGAAACGCTGCCGCAAGATCCGGCCGGTG macaque_dna GGGTGCCCAGGCCAAGGGCAGGATCTGTCCTCCCGGGGCCGAGGCCGGAACCATGACCACGAGGAGACCACAGATGATGAACTTGGGACCAAC------GACACCATGGCCATCAAAAAGCAGAAACGCTGCCGCAAGATCCGGCCGGTG hg18 GGGTGCCCAGGCCAAGGGCAGGATCTGTCCTCCCGGGGCCGAGGCCGGAACCATGACCATGAGGAGACCACAGATGATGAACTTGGGACCAACATT---GACACCATGGCCATCAAAAAGCAGAAACGCTGCCGCAAGATTCGGCCGGTG panTro2 GGGTGCCCAGGCCAAGGGCAGGATCTGTCCTCCCGGGGCCGAGGCCGGAACCATGACCATGAGGAGACCACAGATGATGAACTTGGGACCAACATT---GACACCATGGCCATCAAAAAGCAGAAACGCTGCCGCAAGATCCGGCCGGTG rheMac2 GGGTGCCCAGGCCAAGGGCAGGATCTGTCCTCCCGGGGCCGAGGCCGGAACCATGACCACGAGGAGACCACAGATGATGAACTTGGGACCAACATT---GACACCATGGCCATCAAAAAGCAGAAACGCTGCCGCAAGATCCGGCCGGTG codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot 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S--A--F--------------G--S--P--Q--D--M--E--S--Q--L--G--N--L--G--I--P--P--G--W--F--S--G--L--G--G--S--Q--P--T--A--S--G--S--W--E--G--L--S--E--L--P--T--H-- macaque_prot S--A--F--------------G--S--P--Q--D--M--E--S--Q--L--G--N--L--G--I--P--P--G--W--F--S--G--L--G--G--S--Q--P--T--A--T--G--S--W--E--G--L--S--E--L--P--T--H-- human_dna TCTGCCTT------C------GGGAGCCCTCAGGACATGGAAAGCCAACTGGGGAATCTGGGGATCCCCCCTGGCTGGTTCTCAGGACTTGGGGGCAGCCAGCCCACAGCTAGTGGCTCCTGGGAAGGTCTATCTGAGCTGCCCACTCAT chimp_dna TCTGCCTT------C------GGGAGCCCTCAGGACATGGAAAGCCAACTGGGGAATCTGGGGATCCCCCCTGGCTGGTTCTCAGGACTTGGGGGCAGCCAGCCCACAGCTAGTGGCTCCTGGGAAGGTCTATCTGAGCTGCCCACTCAT macaque_dna TCTGCCTT------C------GGGAGCCCTCAGGACATGGAAAGCCAACTGGGGAACCTGGGAATCCCCCCTGGCTGGTTCTCAGGACTCGGGGGCAGCCAGCCCACAGCTACTGGCTCCTGGGAAGGTCTATCTGAGCTGCCCACTCAT hg18 TCTGCCTTCATCAGC------GGGAGCCCTCAGGACATGGAAAGCCAACTGGGGAATCTGGGGATCCCCCCTGGCTGGTTCTCAGGACTTGGGGGCAGCCAGCCCACAGCTAGTGGCTCCTGGGAAGGTCTATCTGAGCTGCCCACTCAT panTro2 TCTGCCTTCATCAGC------GGGAGCCCTCAGGACATGGAAAGCCAACTGGGGAATCTGGGGATCCCCCCTGGCTGGTTCTCAGGACTTGGGGGCAGCCAGCCCACAGCTAGTGGCTCCTGGGAAGGTCTATCTGAGCTGCCCACTCAT rheMac2 TCTGCCTTCATCAGC------GGGAGCCCTCAGGACATGGAAAGCCAACTGGGGAACCTGGGAATCCCCCCTGGCTGGTTCTCAGGACTCGGGGGCAGCCAGCCCACAGCTACTGGCTCCTGGGAAGGTCTATCTGAGCTGCCCACTCAT codon_pos 012012012012012------012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot S--A--F--I--S--------G--S--P--Q--D--M--E--S--Q--L--G--N--L--G--I--P--P--G--W--F--S--G--L--G--G--S--Q--P--T--A--S--G--S--W--E--G--L--S--E--L--P--T--H-- panTro_prot S--A--F--I--S--------G--S--P--Q--D--M--E--S--Q--L--G--N--L--G--I--P--P--G--W--F--S--G--L--G--G--S--Q--P--T--A--S--G--S--W--E--G--L--S--E--L--P--T--H-- rheMac_prot S--A--F--I--S--------G--S--P--Q--D--M--E--S--Q--L--G--N--L--G--I--P--P--G--W--F--S--G--L--G--G--S--Q--P--T--A--T--G--S--W--E--G--L--S--E--L--P--T--H-- 300. ....|301. ....|302. ....|303. 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G--Y--K--L--R--H--Q--T--Q--G--R--P--R--P--P--R--T--T--P--P--G--P--G--R--P--S-----M--P--A--P--G--T--R--Q--E--N--G--M--A--T--R--L--D--E--G--L--E--D--F-- panTro_prot G--Y--K--L--R--H--Q--T--Q--G--R--P--R--P--P--R--T--T--P--P--G--P--G--R--P--S-----M--P--A--P--G--T--R--Q--E--N--G--M--A--T--R--L--D--E--G--L--E--D--F-- rheMac_prot G--Y--K--L--R--H--Q--T--Q--G--R--P--R--P--P--R--T--T--P--P--G--P--G--R--P--S-----M--P--A--P--G--T--R--Q--E--N--G--M--A--T--R--L--D--E--G--L--E--D--F-- H (C) 315. ....|316. ....|317. ....|318. ....|319. ....|320. ....|321. ....|322. ....|323. ....|324. ....|325. ....|326. ....|327. ....|328. ....|329. ....| prot F--S--R--R--V--L--E--E--S-----S--S--Y--P--R--T--L--R--T--V--R--P--G--L--S--E--A--P--L--P--P--L--Q--K--K--R--R--R--G--L--F--H--F--R--R--P--R--S--F--K-- human_prot F--S--R--R--V--L--E--E--S--------S--Y--P--R--T--L--R--T--V--R--P--G--L--S--E--A--P--L--P--P--L--Q--K--K--R--R--R--G--L--F--H--F--R--R--P--R--S--F--K-- chimp_prot F--S--R--R--V--M--E--E--S--------S--Y--P--R--T--L--R--T--V--R--P--G--L--S--E--A--P--L--P--P--L--Q--K--K--R--R--R--G--L--F--H--F--R--R--P--R--S--F--K-- macaque_prot F--S--R--R--V--M--E--E--S--------S--Y--P--R--T--L--R--T--V--R--P--G--L--S--E--P--P--L--P--P--L--Q--K--K--R--R--R--G--L--F--H--F--R--R--P--R--S--F--K-- human_dna TTCAGCCGAAGGGTCCTGGAGGAAAG---T---AGCTACCCCCGGACTCTGAGGACCGTGCGGCCAGGACTCTCGGAGGCACCGCTGCCTCCACTCCAGAAGAAGAGGCGCCGGGGCCTGTTTCACTTTCGCCGGCCCCGGAGCTTCAAG chimp_dna TTCAGCCGAAGGGTCATGGAGGAAAG---T---AGCTACCCCCGGACTCTGAGGACCGTGCGGCCAGGACTCTCGGAGGCACCGCTGCCTCCACTCCAGAAGAAGAGGCGCCGGGGCCTGTTCCACTTTCGCCGGCCCCGGAGCTTCAAG macaque_dna TTCAGCCGAAGGGTCATGGAGGAAAG---T---AGCTACCCCCGGACTCTGAGGACCGTGCGGCCAGGACTCTCAGAGCCACCGCTGCCTCCACTCCAGAAGAAAAGGCGCCGGGGCCTGTTTCACTTTCGCAGGCCCCGGAGCTTCAAG hg18 TTCAGCCGAAGGGTCCTGGAGGAAAGTTCT---AGCTACCCCCGGACTCTGAGGACCGTGCGGCCAGGACTCTCGGAGGCACCGCTGCCTCCACTCCAGAAGAAGAGGCGCCGGGGCCTGTTTCACTTTCGCCGGCCCCGGAGCTTCAAG panTro2 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L--L--P--G--F--G--G--G--R--G--P--S--F--R--R--K--------G--T--E--G--S--E--P--G--E--G--G--P--A--P--G--T--A--Q--Q--P--R--V--H--G--V--A--L--P--G--L--E--R-- macaque_prot L--L--P--G--F--G--G--G--R--G--P--S--F--C--R--K--------G--T--E--V--S--E--P--G--E--G--G--P--A--P--G--I--A--Q--Q--P--R--V--H--G--V--A--L--P--G--L--E--R-- human_dna CTCCTCCCTGGATTTGGTGGGGGCCGGGGACCTTCCTTCCGCCGGAA---G---GGCACTGAGGGGTCAGAGCCAGGGGAGGGGGGCCCAGCCCCTGGGACAGCACAGCAGCCAAGGGTTCACGGTGTTGCCCTTCCCGGGTTGGAAAGA chimp_dna CTCCTCCCTGGATTTGGTGGGGGCCGGGGACCTTCCTTCCGCAGGAA---G---GGCACTGAGGGGTCAGAGCCAGGGGAGGGGGGCCCAGCCCCTGGGACAGCACAGCAGCCAAGGGTTCACGGTGTTGCCCTTCCCGGGTTGGAAAGA macaque_dna CTCCTGCCTGGATTTGGTGGGGGCCGGGGGCCTTCCTTCTGCAGGAA---G---GGCACTGAGGTGTCGGAGCCAGGGGAGGGGGGCCCAGCCCCTGGGATAGCACAGCAGCCACGGGTTCACGGTGTTGCCCTTCCTGGGTTGGAAAGA hg18 CTCCTCCCTGGATTTGGTGGGGGCCGGGGACCTTCCTTCCGCCGGAAGATG---GGCACTGAGGGGTCAGAGCCAGGGGAGGGGGGCCCAGCCCCTGGGACAGCACAGCAGCCAAGGGTTCACGGTGTTGCCCTTCCCGGGTTGGAAAGA panTro2 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P--S--F--S--A--M--R--R--A--E--A--T--W--H--------A--E--E--S--A--P--N--H--S--C--Q--S--P--S--P--A--S--Q--D--G--E--E--E--K--E--G--T--L--F--P--E--R--T--L-- macaque_prot P--S--F--S--A--M--R--R--A--E--A--T--W--H--------A--E--E--S--A--P--N--H--S--C--Q--S--P--S--P--A--S--Q--D--G--E--E--E--K--E--G--T--L--F--P--E--R--T--L-- human_dna CCAAGCTTCAGCGCCATGCGCAGAGCAGAGGCCACATGGCAC------GCTGAAGAGAGTGCCCCCAACCACAGCTGCCAGAGTCCCAGCCCAGCCTCCCAAGATGGGGAAGAGGAGAAGGAGGGGACCCTCTTCCCAGAGAGGACACTT chimp_dna CCAAGCTTCAGCGCCATGCGCAGAGCAGAGGCCACATGGCAC------GCTGAAGAGAGTGCCCCCAACCACAGCTGCCAGAGTCCCAGCCCAGCCTCCCAAGATGGGGAAGAGGAGAAGGAGGGGACCCTCTTCCCAGAGAGGACACTT macaque_dna CCAAGCTTCAGTGCCATGCGCCGAGCAGAGGCCACGTGGCAC------GCTGAAGAGAGTGCCCCCAACCACAGCTGCCAGAGTCCCAGCCCAGCCTCCCAAGATGGGGAAGAGGAGAAGGAGGGGACCCTCTTCCCAGAGAGGACACTT hg18 CCAAGCTTCAGCGCCATGCGCAGAGCAGAGGCCACATGGCACATA---GCTGAAGAGAGTGCCCCCAACCACAGCTGCCAGAGTCCCAGCCCAGCCTCCCAAGATGGGGAAGAGGAGAAGGAGGGGACCCTCTTCCCAGAGAGGACACTT panTro2 CCAAGCTTCAGCGCCATGCGCAGAGCAGAGGCCACATGGCACATA---GCTGAAGAGAGTGCCCCCAACCACAGCTGCCAGAGTCCCAGCCCAGCCTCCCAAGATGGGGAAGAGGAGAAGGAGGGGACCCTCTTCCCAGAGAGGACACTT rheMac2 CCAAGCTTCAGTGCCATGCGCCGAGCAGAGGCCACGTGGCACATA---GCTGAAGAGAGTGCCCCCAACCACAGCTGCCAGAGTCCCAGCCCAGCCTCCCAAGATGGGGAAGAGGAGAAGGAGGGGACCCTCTTCCCAGAGAGGACACTT codon_pos 012012012012012012012012012012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot P--S--F--S--A--M--R--R--A--E--A--T--W--H--I-----A--E--E--S--A--P--N--H--S--C--Q--S--P--S--P--A--S--Q--D--G--E--E--E--K--E--G--T--L--F--P--E--R--T--L-- panTro_prot P--S--F--S--A--M--R--R--A--E--A--T--W--H--I-----A--E--E--S--A--P--N--H--S--C--Q--S--P--S--P--A--S--Q--D--G--E--E--E--K--E--G--T--L--F--P--E--R--T--L-- rheMac_prot P--S--F--S--A--M--R--R--A--E--A--T--W--H--I-----A--E--E--S--A--P--N--H--S--C--Q--S--P--S--P--A--S--Q--D--G--E--E--E--K--E--G--T--L--F--P--E--R--T--L-- (H) H 390. ....|391. ....|392. ....|393. 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CCAGCTAGGAATGCC------CTACAGGACCCTGCTCTAGCTCCACGGCCTCCCAAGCCAGTGGCTGTGCCCAGGGGCCGCCGGCCTCCCCAGGAGCCAGGGGTCAGGGAGGAGGCTGAGGCTGGAGATGCAGCTCCAGGAGTCAACAAA macaque_dna CCAGCTAGGAATGCC------CTACAGGACCCTGCTCTAGCTCCACGGCCTCCCAAGCCAGTGGCTGTGCCCAGGGGCCGCTGGCCTCCTCAGGAGCCAGGGGTCAGGGAGGAGGCTGAGGCTGGGGATGCAACTCCAGGAGGCAACAAA hg18 CCAGCTAGGAATGCCAAG---CTACAGGACCCCGCTCTAGCTCCATGGCCTCCCAAGCCAGTGGCTGTGCCCAGGGGCCGCCAGCCTCCCCAGGAGCCAGGGGTCAGGGAGGAGGCTGAGGCTGGAGATGCAGCTCCAGGAGTCAACAAA panTro2 CCAGCTAGGAATGCCAAG---CTACAGGACCCTGCTCTAGCTCCACGGCCTCCCAAGCCAGTGGCTGTGCCCAGGGGCCGCCGGCCTCCCCAGGAGCCAGGGGTCAGGGAGGAGGCTGAGGCTGGAGATGCAGCTCCAGGAGTCAACAAA rheMac2 CCAGCTAGGAATGCCAAG---CTACAGGACCCTGCTCTAGCTCCACGGCCTCCCAAGCCAGTGGCTGTGCCCAGGGGCCGCTGGCCTCCTCAGGAGCCAGGGGTCAGGGAGGAGGCTGAGGCTGGGGATGCAACTCCAGGAGGCAACAAA codon_pos 012012012012012012---012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012012 hg18_prot 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